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<body lang=EN-US link=blue vlink=purple style='word-wrap: break-word;
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<div class=Section1>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'>Can you use a different term? It looks like </span><span
style='font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D'>OBI_0000261
has been deprecated in OBI (38617).<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'>Trish</span><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>

<div style='border:none;border-left:solid blue 1.5pt;padding:0in 0in 0in 4.0pt'>

<div>

<div style='border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in'>

<p class=MsoNormal><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>From:</span></b><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'> Eamonn Maguire
[mailto:maguire@ebi.ac.uk] <br>
<b>Sent:</b> Thursday, August 27, 2009 1:59 AM<br>
<b>To:</b> Trish Whetzel<br>
<b>Cc:</b> support@bioontology.org; Philippe Rocca-Serra<br>
<b>Subject:</b> Re: access to individuals and classes<o:p></o:p></span></p>

</div>

</div>

<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>

<p class=MsoNormal>I'm not completely sure what you mean by this since the
individuals will only ever be added beneath a class, no? I assume that by this
you mean that the individuals should only be returned as part of the result and
not the classes themselves, i.e. <o:p></o:p></p>

<div>

<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>in OBI (version 38617), we'd make a search under
'digital entity (OBI_0000261)' and the result would be:<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>analytical cytology data file<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>binary digital entity<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>binary executable<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>electronic case report form<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>electronic case report tabulation<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>eMedical record<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>eSource document<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>text based digital entity<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>and the class 'digital document' is removed from the result
since you'd only be returning the individuals. is this what you meant?! i think
that this is fine for now, but it would maybe be useful to reference the parent
class of the individual in the XML file returned if this is not too much
effort!<o:p></o:p></p>

<div>

<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>

<div>

<p class=MsoNormal>many thanks as always,<o:p></o:p></p>

<div>

<div>

<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>eamonn<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>On 27 Aug 2009, at 03:03, Trish Whetzel wrote:<o:p></o:p></p>

</div>

<p class=MsoNormal><br>
<br>
<o:p></o:p></p>

<div>

<div>

<div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>Will
you be interested in accessing terms that are either classes or individuals? I
think that OBI is or will be adding in a lot of terms as individuals.<o:p></o:p></span></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> <o:p></o:p></span></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>Trish<o:p></o:p></span></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> <o:p></o:p></span></p>

</div>

</div>

</div>

</div>

<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>

<div>

<div>

<div>

<div>

<div>

<div>

<div>

<div>

<div>

<div>

<div>

<div>

<div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'>--<o:p></o:p></span></p>

</div>

<div>

<div>

<p class=MsoNormal><span class=apple-style-span><span style='font-size:7.5pt;
font-family:Wingdings;color:black'>*</span></span><span class=apple-style-span><span
style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black'> </span></span><span
class=apple-tab-span><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'>         </span></span><span
class=apple-style-span><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'><a href="mailto:maguire@ebi.ac.uk">maguire@ebi.ac.uk</a></span></span><span
style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black'><o:p></o:p></span></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><span class=apple-style-span><span style='font-size:7.5pt;
font-family:Wingdings;color:black'>:</span></span><span style='font-size:9.0pt;
font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black'> <span
class=apple-tab-span>          </span><a
href="http://www.ebi.ac.uk/~maguire">http://www.ebi.ac.uk/~maguire</a><o:p></o:p></span></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><span class=apple-style-span><span style='font-size:7.5pt;
font-family:Wingdings;color:black'>:</span></span><span style='font-size:9.0pt;
font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black'>     <a
href="http://www.ebi.ac.uk/net-project">http://www.ebi.ac.uk/net-project</a><o:p></o:p></span></p>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'><o:p> </o:p></span></p>

</div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'><o:p> </o:p></span></p>

</div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'><o:p> </o:p></span></p>

</div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'><o:p> </o:p></span></p>

</div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'><o:p> </o:p></span></p>

</div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'><o:p> </o:p></span></p>

</div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'><o:p> </o:p></span></p>

</div>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";
color:black'><o:p> </o:p></span></p>

</div>

<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>

</div>

<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

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