<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>In addition, Web services are being developed that will return RDF for a term.  </div><div><br></div><div>Trish</div><div><br></div><br><div><div>On May 18, 2010, at 9:21 AM, Trish Whetzel wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>Hi Lena, </div><div><br></div><div>As a quick note, we are developing a <b>PROTOTYPE</b> triple store that is accessible at: <a href="http://sparql.bioontology.org:8080/webui">http://sparql.bioontology.org:8080/webui</a>. As for the other items, a fix has been implemented to provide the full URI via the widgets and I am checking to see when this will be available on the production site.</div><div><br></div><div>Trish</div><div><br></div><br><div><div>On May 18, 2010, at 9:02 AM, Helena Deus wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">Hello,<div><br></div><div>When trying to obtain a full URI for certain terms using the ontology widgets, I came acrros many terms that do not have a full ID in the format of a URI. For example, the term "MRSA", in ontology id 40397 (concept id is T4539). I have been trying to discover, using the same json service that bioportal widgets use (ex: <a href="http://bioportal.bioontology.org/search/json_search/?q=T4539&response=json&callback=jsondata">http://bioportal.bioontology.org/search/json_search/?q=T4539&response=json&callback=jsondata</a>), but even there no full ID in the format of a URI exists.</div> <div><br></div><div>Alternativelly, I tried to get the full URI using the "concepts" REST service (<a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/concepts/40397/T4539">http://rest.bioontology.org/bioportal/concepts/40397/T4539</a>), but this leads me to a list of terms formatted as XML. Ideally, to be SPARQL compatible, I would meed this URI (or the full UID within it) to return data in RDF format, is it possible? Maybe with a small addition of syntax this could be achieved (ex: <a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/concepts/40397/T4539?format=rdf">http://rest.bioontology.org/bioportal/concepts/40397/T4539?format=rdf</a>) ?? I may be missing something but was unable to find in the documentation how to obtain the necessary RDF representation to integrate in SPARQL queries.</div> <div><br></div><div><br></div><div>Thanks</div><div>Lena</div> _______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br></blockquote></div><br></div>_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br>https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support<br></blockquote></div><br></body></html>