<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>Dear Eugene, </div><div><br></div><div>Can you provide more details on how you are getting the term "atorvastatin"?  For example, are you using the Get all terms web service, e.g. <a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/ontology/1351/all?&pagesize=50&pagenum=1&email=example@example.org?">http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/ontology/1351/all?&pagesize=50&pagenum=1&email=example@example.org?</a>  The output of the Get all terms web service and the Term web service for atorvastin, e .g. <a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/ontology/1351/C065179?email=example@example.org">http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/ontology/1351/C065179?email=example@example.org</a>  indicate that this term does not have any children terms [1].  </div><div><br></div><div>Trish </div><div><br></div><div><br></div><div>[1]</div><div><relations></div><div>...</div><div><div><entry></div><div><string>ChildCount</string></div><div><int>0</int></div><div></entry></div></div><div><br></div><br><div><div>On Sep 22, 2010, at 2:17 PM, Eugene wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"><div class="WordSection1"><div><div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">Dear Sir or Madam,</span><span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); "> </span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); ">One</span><span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); "><span class="Apple-converted-space"> </span>issue is some terms are floating, meaning the term has no parent. For example,<span class="Apple-converted-space"> </span></span>atorvastatin<span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); "><span class="Apple-converted-space"> </span>has no parent --<a href="http://www.nlm.nih.gov/cgi/mesh/2011/MB_cgi" target="_blank" style="color: blue; text-decoration: underline; ">http://www.nlm.nih.gov/cgi/mesh/2011/MB_cgi</a>.</span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); "> </span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); ">Currently, we use the url to download --<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255); "><a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/ontology/%3conto" target="_blank" style="color: blue; text-decoration: underline; ">http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/ontology/<onto</a></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(31, 73, 125); ">logy</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255); ">id>/<id><a href="mailto:?email=example@example.org" target="_blank" style="color: blue; text-decoration: underline; ">?email=example@example.org</a>.</span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255); "> </span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255); ">However, that URL requires the ID. But if a term has no parent, we donít know what the id of the term is without first knowing its parent ID. On the other hands, we donít know the name of the floating term. If we know, we can query by term to get the rest of info. But we donít know the name of the term.</span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255); "> </span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255); ">Do you have idea how we can handle the case? We compared two MeSH versions which were all downloaded through BioPortal API, there are 5 times of size difference. In current version,</span>atorvastatin has no parent, so all its children cannot be found.<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255); "> </span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); ">Thanks</span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); "> </span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); ">Eugene</span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); "> </span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125); "> </span><o:p></o:p></div></div></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div></div></div>_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: blue; text-decoration: underline; ">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: blue; text-decoration: underline; ">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br></div></blockquote></div><br></body></html>