<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD><TITLE></TITLE>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<META content="MSHTML 6.00.6000.17092" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY text=#000000 bgColor=#ffffff>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=920361420-03122010><FONT face=Arial 
color=#0000ff size=2>Sina,</FONT></SPAN></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=920361420-03122010><FONT face=Arial 
color=#0000ff size=2>You would need to zip up all the RRF files excluding the 
CHANGES folder and submit it via the BioPortal UI. Often times the size gets to 
be too big for the upload and so I manually ftp the file over to the right 
location. </FONT></SPAN></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=920361420-03122010><FONT face=Arial 
color=#0000ff size=2>If you run into difficulties getting the load to work, 
please let me know the SAB you are interested in loading and I would help you 
get it into BioPortal. I assume you are subsetting the ontologies from the 
2010AB version of the UMLS?</FONT></SPAN></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=920361420-03122010><FONT face=Arial 
color=#0000ff size=2></FONT></SPAN> </DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=920361420-03122010><FONT face=Arial 
color=#0000ff size=2>Regards,</FONT></SPAN></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=920361420-03122010><FONT face=Arial 
color=#0000ff size=2>Pradip</FONT></SPAN></DIV><BR>
<DIV class=OutlookMessageHeader lang=en-us dir=ltr align=left>
<HR tabIndex=-1>
<FONT face=Tahoma size=2><B>From:</B> Paul R Alexander 
[mailto:palexander@stanford.edu] <BR><B>Sent:</B> Friday, December 03, 2010 2:13 
PM<BR><B>To:</B> Madani,Sina<BR><B>Cc:</B> support@bioontology.org; Kanjamala, 
Pradip P.<BR><B>Subject:</B> Re: [bioontology-support] FW: BioPortal VM Image - 
access information<BR></FONT><BR></DIV>
<DIV></DIV>On 12/2/10 7:11 AM, Madani,Sina wrote: 
<BLOCKQUOTE 
cite=mid:6AFD32980D1F8F4DBD774D687B002A601F1651D97A@DCPWVMBXC1VS2.mdanderson.edu 
type="cite">
  <DIV class=WordSection1><!--[if !mso]>
  <STYLE>v\:* {
        BEHAVIOR: url(#default#VML)
}
o\:* {
        BEHAVIOR: url(#default#VML)
}
w\:* {
        BEHAVIOR: url(#default#VML)
}
.shape {
        BEHAVIOR: url(#default#VML)
}
</STYLE>
<![endif]-->
  <P class=MsoNormal><SPAN 
  style="FONT-SIZE: 11pt; COLOR: rgb(31,73,125); FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'">For 
  RRF format terminologies, which RRF file I should use for upload (MRSAB, 
  MRCONSO, or all of them)? For ICD9 below I just chose one and waiting for an 
  error to happen.<O:P></O:P></SPAN><SPAN 
  style="FONT-SIZE: 11pt; COLOR: rgb(31,73,125); FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'"><O:P> 
  <BR></O:P></SPAN></P></DIV></BLOCKQUOTE>Sina: My guess is that you would need to 
upload a zip archive containing all of the files, but I've CCed Pradip, our RRF 
expert, to see if he can shed some light for us.<BR><BR>Pradip, can you clarify 
this for Sina please?<BR><BR>Paul </BODY></HTML>