<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Sorry, Pradip. Should have clarified that Sina is using the new NCBO
    Virtual Appliance so while she's running an instance of BioPortal it
    won't appear on our installation. We would have to give her the
    information on how to do the file transfer should the files get too
    large, or perhaps just walk her through increasing the limit on
    upload size.<br>
    <br>
    Paul<br>
    <br>
    <br>
    On 12/3/10 12:19 PM, Kanjamala, Pradip P. wrote:
    <blockquote
      cite="mid:10222C0B84694A459E89545CDD456B3502DA98F8@msgebe39"
      type="cite">
      <title></title>
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=ISO-8859-1">
      <meta content="MSHTML 6.00.6000.17092" name="GENERATOR">
      <div dir="ltr" align="left"><span class="920361420-03122010"><font
            color="#0000ff" face="Arial" size="2">Sina,</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="920361420-03122010"><font
            color="#0000ff" face="Arial" size="2">You would need to zip
            up all the RRF files excluding the CHANGES folder and submit
            it via the BioPortal UI. Often times the size gets to be too
            big for the upload and so I manually ftp the file over to
            the right location. </font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="920361420-03122010"><font
            color="#0000ff" face="Arial" size="2">If you run into
            difficulties getting the load to work, please let me know
            the SAB you are interested in loading and I would help you
            get it into BioPortal. I assume you are subsetting the
            ontologies from the 2010AB version of the UMLS?</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="920361420-03122010"></span> </div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="920361420-03122010"><font
            color="#0000ff" face="Arial" size="2">Regards,</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="920361420-03122010"><font
            color="#0000ff" face="Arial" size="2">Pradip</font></span></div>
      <br>
      <div class="OutlookMessageHeader" dir="ltr" align="left"
        lang="en-us">
        <hr tabindex="-1">
        <font face="Tahoma" size="2"><b>From:</b> Paul R Alexander
          [<a class="moz-txt-link-freetext" href="mailto:palexander@stanford.edu">mailto:palexander@stanford.edu</a>] <br>
          <b>Sent:</b> Friday, December 03, 2010 2:13 PM<br>
          <b>To:</b> Madani,Sina<br>
          <b>Cc:</b> <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a>; Kanjamala, Pradip P.<br>
          <b>Subject:</b> Re: [bioontology-support] FW: BioPortal VM
          Image - access information<br>
        </font><br>
      </div>
      On 12/2/10 7:11 AM, Madani,Sina wrote:
      <blockquote
cite="mid:6AFD32980D1F8F4DBD774D687B002A601F1651D97A@DCPWVMBXC1VS2.mdanderson.edu"
        type="cite">
        <div class="WordSection1"><!--[if !mso]>
  <STYLE>v\:* {
        BEHAVIOR: url(#default#VML)
}
o\:* {
        BEHAVIOR: url(#default#VML)
}
w\:* {
        BEHAVIOR: url(#default#VML)
}
.shape {
        BEHAVIOR: url(#default#VML)
}
</STYLE>
<![endif]-->
          <p class="MsoNormal"><span style="font-size: 11pt; color:
              rgb(31, 73, 125); font-family: 'Calibri','sans-serif';">For
              RRF format terminologies, which RRF file I should use for
              upload (MRSAB, MRCONSO, or all of them)? For ICD9 below I
              just chose one and waiting for an error to happen.<o:p></o:p></span><span
              style="font-size: 11pt; color: rgb(31, 73, 125);
              font-family: 'Calibri','sans-serif';"><o:p> <br>
              </o:p></span></p>
        </div>
      </blockquote>
      Sina: My guess is that you would need to upload a zip archive
      containing all of the files, but I've CCed Pradip, our RRF expert,
      to see if he can shed some light for us.<br>
      <br>
      Pradip, can you clarify this for Sina please?<br>
      <br>
      Paul </blockquote>
  </body>
</html>