<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>The Search web service can be used to submit the value of the Talairach property and retrieve the concept identifier. I tested these examples of Talairach terms:  *.*.Precentral Gyrus.*.* for term RID6448 and Inter-Hemispheric.*.Superior Frontal Gyrus.*.* for term RID6441 with our sample code for using the Search web service and it worked fine.  </div><div><br></div><div>Documentation on the Search web service is at: <a href="http://www.bioontology.org/wiki/index.php/NCBO_REST_services#Search_BioPortal">http://www.bioontology.org/wiki/index.php/NCBO_REST_services#Search_BioPortal</a>. Important parameters to set are ontologyids=1057 to limit the Search to RadLex and includeproperties=1 in order to search properties other than the preferred name and concept id. </div><div><br></div><div>The sample code examples for the Search web service, written in Java and Perl, are at: </div><div><a href="https://bmir-gforge.stanford.edu/gf/project/client_examples/scmsvn/?action=browse&path=%2Ftrunk%2FJava%2FBioPortalTermSearch%2Fsrc%2F">https://bmir-gforge.stanford.edu/gf/project/client_examples/scmsvn/?action=browse&path=%2Ftrunk%2FJava%2FBioPortalTermSearch%2Fsrc%2F</a> </div><div>AND </div><div><a href="https://bmir-gforge.stanford.edu/gf/project/client_examples/scmsvn/?action=browse&path=%2Ftrunk%2FPerl%2FBioPortalTermSearch%2F">https://bmir-gforge.stanford.edu/gf/project/client_examples/scmsvn/?action=browse&path=%2Ftrunk%2FPerl%2FBioPortalTermSearch%2F</a></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Monaco; font-size: 11px; "><br></span></div><div>Trish </div><div><br></div><br><div><div>On Dec 5, 2010, at 3:03 PM, Trish Whetzel wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>Can you send a few examples of Talairach terms? </div><div><br></div><div>Trish </div><div><br></div><br><div><div>On Dec 5, 2010, at 10:36 AM, Daniel Rubin wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div bgcolor="#FFFFFF"><div>Hi</div><div><br></div><div>Main use case is to send bioportal the Talairach term and return the RID...</div><div>Can you provide such webservice??</div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.292969); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.230469); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.230469);"><br></span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.292969); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.230469); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.230469);">DR</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.292969); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.230469); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.230469);"><br></span><div>---</div>Sent from my iPhone<div> ••Please<span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.289062); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.222656); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.222656); "> excuse typos••</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.285156); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.21875); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.21875);">Daniel L. Rubin, MD</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.28125); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.214844); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.214844);">Assistant Professor of Radiology</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.277344); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.210938); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.210938);">Richard M. Lucas Center</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.273438); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.207031); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.207031);">1201 Welch Road, Office P285</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.269531); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.203125); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.203125);">Stanford, CA,  94305-5488</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.265625); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.199219); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.199219);">Phone: (650) 427-0025</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.261719); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.195312); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.195312);">Fax: (650) 723-5795</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.253906); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.1875); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.1875);">Email: <a href="mailto:dlrubin@stanford.edu"></a><a href="mailto:dlrubin@stanford.edu">dlrubin@stanford.edu</a></span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.242188); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.175781); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.175781);">Web: <a href="http://rubin.stanford.edu/"></a><a href="http://rubin.stanford.edu/">http://rubin.stanford.edu</a></span></div><div><span class="Apple-style-span" style="-webkit-tap-highlight-color: rgba(26, 26, 26, 0.238281); -webkit-composition-fill-color: rgba(175, 192, 227, 0.171875); -webkit-composition-frame-color: rgba(77, 128, 180, 0.171875);"><br></span></div></div><div><br>On Dec 5, 2010, at 8:11 AM, Trish Whetzel <<a href="mailto:whetzel@stanford.edu">whetzel@stanford.edu</a>> wrote:<br><br></div><div></div><blockquote type="cite"><div><div>Hi Daniel,</div><div><br></div><div>Can you provide examples of input values you would like to use? For example, are you looking for a web service that can take either the values RID6448 (concept identifier) or 61894 (FMA ID) or *.*.Precentral Gyrus.*.* (Talairach) and return information for the concept RID6448? </div><div><br></div><div>Trish</div><div><br></div><div><br></div><br><div><div>On Dec 4, 2010, at 10:00 PM, Daniel Rubin wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Arial; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="color: rgb(31, 73, 125); ">Trish,<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="color: rgb(31, 73, 125); ">As per Todd’s question below,<span class="Apple-converted-space"> </span></span>are there any methods in biportal webservices which take both a concept identifier and property identifier in order to retrieve the values for that property on that class?<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; ">Daniel<span style="color: rgb(31, 73, 125); "><o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="color: rgb(31, 73, 125); "><o:p> </o:p></span></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="color: rgb(31, 73, 125); ">___________________________________<o:p></o:p></span></div><div style="border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-top-style: double; border-top-color: windowtext; border-top-width: 1.5pt; padding-top: 1pt; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 0in; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; border-top-style: none; border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; padding-top: 0in; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 0in; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; "><span><image001.jpg></span><span class="Apple-converted-space"> </span>Daniel L. Rubin, MD, MS                             <span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); "><span><image002.jpg></span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; "><o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; border-top-style: none; border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; padding-top: 0in; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 0in; "><i><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; ">            Assistant Professor<o:p></o:p></span></i></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; border-top-style: none; border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; padding-top: 0in; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 0in; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; ">            Department of Radiology | Stanford University<o:p></o:p></span></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">            Richard M. Lucas Center</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; "><span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">| 1201 Welch Road, Office P285</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; "><o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">            Stanford, CA 94305-5488</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; "><o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">            Phone: 650-723-9495 | Fax: 650-723-5795</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; "><o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">            Web:<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="color: rgb(31, 73, 125); "><a href="http://rubin.web.stanford.edu/" style="color: blue; text-decoration: underline; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; ">http://rubin.web.stanford.edu/</span></a><o:p></o:p></span></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="color: rgb(31, 73, 125); "><o:p> </o:p></span></div><div style="border-top-style: none; border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-left-style: solid; border-left-color: blue; border-left-width: 1.5pt; padding-top: 0in; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 4pt; "><div><div style="border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-top-style: solid; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding-top: 3pt; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 0in; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; color: windowtext; ">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; color: windowtext; "><span class="Apple-converted-space"> </span>Todd Detwiler [mailto:det@u.washington.edu]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Saturday, December 04, 2010 2:36 PM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Daniel Rubin<br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>'Neeraj Agrawal';<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:mejino@u.washington.edu" style="color: blue; text-decoration: underline; "></a><a href="mailto:mejino@u.washington.edu">mejino@u.washington.edu</a><br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: looking up RIDs from labels<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; ">It isn't clear to me how you would do this through the bioportal api. I've only used the bp api for accessing full ontologies (not slot values within an ontology). The problem is, there doesn't appear to be any methods which take both a concept identifier and property identifier in order to retrieve the values for that property on that class. Perhaps Natasha could provide more info.<span class="Apple-converted-space"> </span><br>Todd<br><br>On 12/3/2010 7:10 PM, Daniel Rubin wrote:<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="color: rgb(31, 73, 125); ">Todd,</span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="color: rgb(31, 73, 125); ">Thanks. But this assumes I know the RadLex term and I want to look up the</span>Talairach label. What if I’m starting with a Talairach string?<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "> <o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; ">Daniel<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="color: rgb(31, 73, 125); "> </span><o:p></o:p></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="color: rgb(31, 73, 125); ">___________________________________</span><o:p></o:p></div><div style="border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-top-style: double; border-top-color: windowtext; border-top-width: 1.5pt; padding-top: 1pt; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 0in; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; "><span><image003.jpg></span>Daniel L. Rubin, MD, MS                             <span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; "><span><image002.jpg></span></span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><i><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; ">            Assistant Professor</span></i><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow', sans-serif; color: maroon; ">            Department of Radiology | Stanford University</span><o:p></o:p></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="font-size: 10pt; ">            Richard M. Lucas Center | 1201 Welch Road, Office P285</span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="font-size: 10pt; ">            Stanford, CA 94305-5488</span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="font-size: 10pt; ">            Phone: 650-723-9495 | Fax: 650-723-5795</span><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="font-size: 10pt; ">            Web:<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="color: rgb(31, 73, 125); "><a href="http://rubin.web.stanford.edu/" style="color: blue; text-decoration: underline; "><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Arial Narrow , sans-serif ;', serif; ">http://rubin.web.stanford.edu/</span></a></span><o:p></o:p></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><span style="color: rgb(31, 73, 125); "> </span><o:p></o:p></div><div style="border-top-style: none; border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-left-style: solid; border-left-color: windowtext; border-left-width: 1.5pt; padding-top: 0in; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 4pt; "><div><div style="border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-top-style: solid; border-top-color: windowtext; border-top-width: 1pt; padding-top: 3pt; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 0in; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; color: windowtext; ">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; color: windowtext; "><span class="Apple-converted-space"> </span>Todd Detwiler [<a href="mailto:det@u.washington.edu" style="color: blue; text-decoration: underline; "></a><a href="mailto:det@u.washington.edu">mailto:det@u.washington.edu</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Monday, November 29, 2010 2:12 PM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Daniel Rubin<br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Neeraj Agrawal;<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:mejino@u.washington.edu" style="color: blue; text-decoration: underline; "></a><a href="mailto:mejino@u.washington.edu">mejino@u.washington.edu</a><br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: looking up RIDs from labels</span><o:p></o:p></div></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; "> <o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; ">OK, so let's start by talking about how things are in RadLex (native, not the owl version in bioportal). When you say "names of the slots he’d need to search in RadLex to go from an atlas label to the RadLex term", what do you mean by RadLex term? Do you want an id (i.e. RID1234) or a human readable term (i.e. precentral gyrus)? The former is attached to a class via the Protege system property :NAME. The latter is attached, for the preferred term via the Preferred name slot. But this connection is via a reified instance. Values in the Preferred name slot are instances of the RadLex term class. Each instance has a "name" slot where the actual string value resides. Similarly, terms from other terminologies are attached via reified relationships like Talairach, Freesurfer, and AAL. Values in these slots are instances of Non-RadLex term and again have a name field for retrieving the actual string values.<br><br>Now let's talk about how these things look in Bioportal. First, I don't have much in the way of example code for doing this through the bioportal web services. And, what you get back from the services doesn't look exactly like what you see in Protege. For example, here is a URL that will retrieve the concept precentral gyrus (by its RID) from the web services<br><br><a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/concepts/44843/RID6448" style="color: blue; text-decoration: underline; "></a><a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/concepts/44843/RID6448">http://rest.bioontology.org/bioportal/concepts/44843/RID6448</a><br><br>Note that the results of the above call include:<br><br>        <entry><br>          <string>Talairach</string><br><br>          <list><br>            <string>*.*.Precentral Gyrus.*.*</string><br>          </list><br>        </entry><br><br>I believe that you will need to parse these results (and potentially perform more service calls) to get the results you are looking for.<br><br>Todd<br></div></div></div></span></blockquote></div><br></div></blockquote></div></blockquote></div><br></div>_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br>https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support<br></blockquote></div><br></body></html>