Thanks Trish,<div><br></div><div>I don't know about SNOMED, all I know is that querying on it for version 44777 seems to work. I probably would not have emailed only for the fact that the child query doesn't work properly. I'm happy no, at least for SNOMED :) Let me know when you figure this out. Collaborators are looking for its integration as soon as possible.</div>
<div><br></div><div>Many thanks,</div><div><br></div><div>Eamonn<br><br><div class="gmail_quote">On 8 December 2010 15:12, Trish Whetzel <span dir="ltr"><<a href="mailto:whetzel@stanford.edu">whetzel@stanford.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;"><div style="word-wrap:break-word"><div>Hi Eamonn,</div><div><br></div><div>I'm traveling the next two weeks so others on the list will need to fill-in details. However, it looks like the latest version of SNOMED is only on the Stage Annotator server .. so I'm wondering how you are accessing the latest version, ontology version id=44777? </div>
<div><br></div><div>I am able to get children for SNOMED, </div><div><a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/children/1353/123037004?email=example@example.org" target="_blank">http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/children/1353/123037004?email=example@example.org</a></div>
<div><br></div><div>However, the equivalent call for MedDRA gives an error,</div><div><a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/children/1422/10005329?email=example@example.org" target="_blank">http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/children/1422/10005329?email=example@example.org</a></div>
<div>I'm not sure why this error is occurring and have added this bug to the tracker.  </div><div><br></div><div>Trish </div><div><br></div><br><div><div><div></div><div class="h5"><div>On Dec 8, 2010, at 9:08 AM, Eamonn Maguire wrote:</div>
<br></div></div><blockquote type="cite"><div><div></div><div class="h5">Hi Guys,<div><br></div><div>This is quite urgent, is there any way you can tell me how to get the children properly for Meddra and SNOMED?</div><div>
<br></div><div>many thanks as always!</div><div><br></div><div>Eamonn<br>
<br><div class="gmail_quote">---------- Forwarded message ----------<br>From: <b class="gmail_sendername">Eamonn Maguire</b> <span dir="ltr"><<a href="mailto:eamonnmag@gmail.com" target="_blank">eamonnmag@gmail.com</a>></span><br>
Date: 3 December 2010 16:01<br>
Subject: How do I get the child nodes for the Meddra ontology<br>To: <a href="mailto:support@bioontology.org" target="_blank">support@bioontology.org</a><br><br><br>Hello,<div><br></div><div>First of all, thanks for indexing the latest version of SnoMed!</div>

<div><br></div><div>So now I am able to get the hieracrchy services working for pretty much every ontology apart from Meddra & SnoMed. Although, I'm noticing that these are in a format called RRF, so perhaps this is where the problem is coming from. I can get the root terms in the ontology ok, but when I attempt to get the children for a node, I get nothing back, e.g.</div>


<div><br></div><div><a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/concepts/children/42280/10005329?level=1" target="_blank">http://rest.bioontology.org/bioportal/concepts/children/42280/10005329?level=1</a></div><div><br>

</div><div>I've attached screenshots showing how Every root node of the ontology is depicted as a leaf node (since it can't find any children under them).</div>
<div><br></div><div>If one of you could tell me how to properly query these ontologies using the hierarchy services, I'd be really grateful!</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div><br></div><div>Eamonn<br clear="all">


<br>-- <br><div><div><div><span style="font-size:13.2px;border-collapse:collapse"><pre cols="72" style="white-space:pre-wrap"><font face="verdana, sans-serif">-------------------------------------------------------------
Eamonn Maguire                                
Lead Engineer - <a href="http://www.isa-tools.org/" target="_blank">ISA tools</a>                                                                                                             <br></font></pre><pre cols="72" style="white-space:pre-wrap"><font face="verdana, sans-serif">University of Oxford            Tel: +44(0)1865 610788
Oxford e-Research Center        
7 Keble Road, Oxford            skype: maguire1986
OX1 3QG, UK                     
-------------------------------------------------------------</font></pre></span></div></div></div><br>
</div>
</div><br><br clear="all"><br>-- <br><div><div><div><span style="font-size:13.2px;border-collapse:collapse"><pre cols="72" style="white-space:pre-wrap"><font face="verdana, sans-serif">-------------------------------------------------------------
Eamonn Maguire                                
Lead Engineer - <a href="http://www.isa-tools.org/" target="_blank">ISA tools</a>                                                                                                             <br></font></pre><pre cols="72" style="white-space:pre-wrap"><font face="verdana, sans-serif">University of Oxford            Tel: +44(0)1865 610788
Oxford e-Research Center        
7 Keble Road, Oxford            skype: maguire1986
OX1 3QG, UK                     
-------------------------------------------------------------</font></pre></span></div></div></div><br>
</div>
</div></div><span><Screen shot 2010-12-03 at 15.57.08.png></span><span><Screen shot 2010-12-03 at 15.57.39.png></span></blockquote></div><br></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div><div><div>
<span style="font-size:13.2px;border-collapse:collapse"><pre cols="72" style="white-space:pre-wrap"><font face="verdana, sans-serif">-------------------------------------------------------------
Eamonn Maguire                                
Lead Engineer - <a href="http://www.isa-tools.org" target="_blank">ISA tools</a>                                                                                                              <br></font></pre><pre cols="72" style="white-space:pre-wrap"><font face="verdana, sans-serif">University of Oxford            Tel: +44(0)1865 610788
Oxford e-Research Center        
7 Keble Road, Oxford            skype: maguire1986
OX1 3QG, UK                     
-------------------------------------------------------------</font></pre></span></div></div></div><br>
</div>