<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1"><meta name=Generator content="Microsoft Word 12 (filtered medium)"><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:#1F497D;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]--></head><body lang=EN-US link=blue vlink=purple><div class=WordSection1><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>Nadin,<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>Sorry for the delay. It took a while to track this down. There is a problem in our underlying serialization of terms that causes this issue. It is not at all simply a visualization problem. Our understanding at the moment is that the problem is limited to some situations involving the use of metaclasses in Protégé Frames ontologies. We have created a bug to track this issue. It may take a while to get it fixed though. <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>Ray<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p><div style='border:none;border-left:solid blue 1.5pt;padding:0in 0in 0in 4.0pt'><div><div style='border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in'><p class=MsoNormal><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>From:</span></b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'> bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu [mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu] <b>On Behalf Of </b>Nadin Kökciyan<br><b>Sent:</b> Monday, April 11, 2011 1:38 PM<br><b>To:</b> support@bioontology.org<br><b>Subject:</b> [bioontology-support] A question related to visualizing RadLex ontology<o:p></o:p></span></p></div></div><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>Hello, <br><br>We are currently working on RadLex ontology, and thanks to FlexViz, we can visualise it and explore it better. In RadLex 3.3.3 ontology, i see that there are different relationships defined such as "has part", "has regional part", "member of" etc.. But i can see that we can only visualise "subclass of" relation on FlexViz. Is that intuitive?<br><br><br>Version:          v2.3.5, November 9th, 2010<br>Operating System: Linux 2.6.32-30-generic<br>Flash Version:    LNX 10,2,153,1<br>Flash Parameters: server=&nodeid=&v=2.3.4.1&redirecturl=&virtual=false&ontology=4519<br>Browser URL:      <a href="http://keg.cs.uvic.ca/ncbo/flexviz/FlexoViz.html">http://keg.cs.uvic.ca/ncbo/flexviz/FlexoViz.html</a><br><br><br clear=all>Nadin Kökciyan<o:p></o:p></p></div></div></body></html>