<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META content="text/html; charset=us-ascii" http-equiv=Content-Type>
<META name=GENERATOR content="MSHTML 8.00.6001.19088"></HEAD>
<BODY 
style="WORD-WRAP: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space">
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=204365517-14072011>Forwarding this message (Trish is on 
vacation)</SPAN></FONT></DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial></FONT><BR>
<DIV dir=ltr lang=en-us class=OutlookMessageHeader align=left>
<HR tabIndex=-1>
<FONT size=2 face=Tahoma><B>From:</B> Phillips, Lori C. <BR><B>Sent:</B> 
Thursday, July 14, 2011 1:55 PM<BR><B>To:</B> 'Trish Whetzel'<BR><B>Subject:</B> 
Need some assistance<BR></FONT><BR></DIV>
<DIV></DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN class=269594717-14072011>Hi 
Trish,</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=269594717-14072011></SPAN></FONT> </DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN class=269594717-14072011>I have 
seen a reference to SABs on the Path to Root page  </SPAN></FONT><FONT 
color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN class=269594717-14072011><A 
href="http://www.bioontology.org/wiki/index.php/Path_to_Root">http://www.bioontology.org/wiki/index.php/Path_to_Root</A></SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=269594717-14072011></SPAN></FONT> </DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=269594717-14072011>"-ontologies : The complete path of the file 
containing the SABs of the ontologies to be used. The file should contain one 
SAB 
<BR>                 
on every line. Please see SABsTest.txt and SABsComplete for the correct format. 
The path should be of the type 
<BR>                 
C:\\Bioportal\\SAB\\SABsTest.txt "</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=269594717-14072011></SPAN></FONT> </DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=269594717-14072011></SPAN></FONT> </DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN class=269594717-14072011>Can 
you tell me what kind of info is contained in the file and whether or not this 
info is a(n) (accepted) standard?</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=269594717-14072011></SPAN></FONT> </DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN class=269594717-14072011>I am 
asking not so I can use this path-to-root feature but rather, if its what I 
think it is (acronyms for ontologies),</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN class=269594717-14072011>that I 
need it for my i2b2-NCBO extraction tool.</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=269594717-14072011></SPAN></FONT> </DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN class=269594717-14072011>Also 
could you send me the two files:  SABsTest.txt and SABsComplete?  or 
explain if this info is available via the rest services?</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=269594717-14072011></SPAN></FONT> </DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN class=269594717-14072011>Thanks 
for your help</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=269594717-14072011>Lori</SPAN></FONT></DIV><font face="monospace"><br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
http://www.partners.org/complianceline . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.</font></BODY></HTML>