<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>Hi Larry, </div><div><br></div><div>Thanks for the background information. I'll submit a request to NCI to get access to the older versions of CTCAE and upload these as the files become available.  It sounds as though the Search and Term Web services will be of most interest [1] and yes, there are many applications that are using the NCBO Web services. A selection of these are listed in our recent publication: <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21672956">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21672956</a>. If you like, we can set-up a demo session to review the Web services. </div><div><br></div><div>Cheers, </div><div>Trish </div><div><br></div><div><br></div><div>[1] <a href="http://www.bioontology.org/wiki/index.php/NCBO_REST_services">http://www.bioontology.org/wiki/index.php/NCBO_REST_services</a>  </div><div><br></div><div><br></div><br><div><div>On Aug 4, 2011, at 10:43 AM, Persaud,Larry wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Arial; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple" style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div class="WordSection1" style="page: WordSection1; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">Hi Trish,<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); "><o:p> </o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">Typically when a Protocol is created the version of the CTCAE is what is used for that protocol.  Since we have legacy protocols calling legacy CTCAE we need a way to be able to reference the CTCAE version associated with the Protocol (e.g 3.n.n).<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); "><o:p> </o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">We were thinking of using the BioPortal ontology service to have our application point to the BioPortal NCI CTCAE and record the unique ID and other minimal data to our database so we do not need to maintain the ontologies locally.  Do you know of any institutions that are consuming the NIH BioPortal Ontology services in their applications? If so, it would be very nice to know how they are using this.<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); "><o:p> </o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">Cheers,<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); ">Larry<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); "><o:p> </o:p></span></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><b><span style="font-size: 26pt; font-family: 'Freestyle Script'; color: black; ">Lawrence T Persaud</span></b><b><span style="font-family: Calibri, sans-serif; color: black; ">, PMP, M.Sc., B.Sc.<o:p></o:p></span></b></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; line-height: 12pt; "><b><span style="font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(0, 153, 153); ">IT Project Manager<o:p></o:p></span></b></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; line-height: 12pt; "><b><i><span style="font-size: 10pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(181, 38, 23); ">EMR Development & Support<o:p></o:p></span></i></b></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; line-height: 12pt; "><i><span style="font-size: 10pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: black; ">Unit 1162, KCB 1.5142.10<o:p></o:p></span></i></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 18pt; font-family: Webdings; color: black; "></span><span style="font-size: 8pt; font-family: Verdana, sans-serif; color: black; ">: 5.7812  |</span><span style="font-size: 1pt; font-family: Verdana, sans-serif; color: black; "><span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 8pt; font-family: Verdana, sans-serif; color: black; ">  </span><span style="font-size: 18pt; font-family: Webdings; color: black; "></span><span style="font-size: 8pt; font-family: Verdana, sans-serif; color: black; ">: 2.9996  |<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 18pt; font-family: Webdings; color: black; "></span><span style="font-size: 8pt; font-family: Verdana, sans-serif; color: black; ">: 2.0812 |<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 16pt; font-family: Webdings; color: black; "></span><span style="font-size: 8pt; font-family: Verdana, sans-serif; color: black; ">: 646.206.3855<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; line-height: 12pt; "><span style="font-size: 8pt; font-family: Verdana, sans-serif; color: black; "><o:p> </o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; background-image: initial; background-attachment: initial; background-origin: initial; background-clip: initial; background-color: white; "><span lang="EN" style="font-size: 10pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(34, 34, 34); ">"A new idea is first condemned as ridiculous and then dismissed as trivial, until finally, it becomes what everybody knows."</span><span lang="EN" style="font-size: 13.5pt; font-family: 'Trebuchet MS', sans-serif; color: rgb(34, 34, 34); "><o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span lang="EN" style="font-size: 8pt; font-family: 'Trebuchet MS', sans-serif; color: rgb(34, 34, 34); "><a href="http://en.proverbia.net/citasautor.asp?autor=13773" title="William James Quotes" style="color: blue; text-decoration: underline; "><span style="font-family: 'Times New Roman', serif; color: rgb(0, 0, 153); ">William James</span></a><span class="Apple-converted-space"> </span></span><i><span lang="EN" style="font-size: 8pt; font-family: 'Trebuchet MS', sans-serif; color: rgb(102, 102, 102); ">(1842-1910) American philosopher and psychologist.</span></i><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); "><o:p></o:p></span></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125); "><o:p> </o:p></span></div><div><div style="border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-top-style: solid; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding-top: 3pt; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 0in; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; ">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; "><span class="Apple-converted-space"> </span>Trish Whetzel [mailto:whetzel@stanford.edu]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Thursday, August 04, 2011 11:25 AM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Persaud,Larry<br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a> Support<br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: [bioontology-support] Feedback<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">Dear Larry, <o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">Yes, older versions of NCI CTCAE can be uploaded. The current version is 4.02 as seen in the "Versions" section on the ontology summary page: <a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/1415" style="color: blue; text-decoration: underline; ">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/1415</a>. What type of tasks do you envision using the older versions for? For example, search is only enabled for the latest ontology version while browsing is available for all versions.  <o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">Trish <o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; ">Trish Whetzel, PhD<o:p></o:p></span></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; ">Outreach Coordinator<o:p></o:p></span></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; ">The National Center for Biomedical Ontology<o:p></o:p></span></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; ">Ph: 650-721-2378<o:p></o:p></span></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; "><a href="mailto:whetzel@stanford.edu" style="color: blue; text-decoration: underline; ">whetzel@stanford.edu</a><o:p></o:p></span></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; "><a href="http://www.bioontology.org/" style="color: blue; text-decoration: underline; ">http://www.bioontology.org</a><o:p></o:p></span></div></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; "><o:p> </o:p></span></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">On Jul 28, 2011, at 2:48 PM,<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: blue; text-decoration: underline; ">support@bioontology.org</a><span class="Apple-converted-space"> </span>wrote:<o:p></o:p></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><br><br><o:p></o:p></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">Name : Lawrence T Persaud<br><br>Email :<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:lpersaud@mdanderson.org" style="color: blue; text-decoration: underline; ">lpersaud@mdanderson.org</a><br><br>Comment:<br>I would like to know if it is possible for BioPortal to load the NCI CTCAE versions.  I am not sure which version has been loaded but was hoping that all versions could be loaded (NCI CTC AE version 1, 2, 3, and 4).  Perhaps they have all been loaded but I cannot differentiate which verion of the CTC the terms are being derived from.<br><br>I am more than happy to further expand on my request.<br><br>Cheers,<br>Larry<br>_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: blue; text-decoration: underline; ">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: blue; text-decoration: underline; ">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><o:p></o:p></div></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div><div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; color: black; "><o:p> </o:p></span></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; color: black; "><o:p> </o:p></span></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; color: black; "> <o:p></o:p></span></div></div></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div></div></div></span></blockquote></div><br></body></html>