<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div><span>Hi Yannick, <br></span></div><div><br><span></span></div><div><span>There is a parameter </span><strong>wholeWordOnly</strong><span> I guess that could do the trick but you could also have more annotations that you are looking for. Maybe give it a try and see whether it gives you what you need.</span></div><div><br><span></span></div><div><span>LJ</span></div><div><br></div><div style="font-family: times new roman,new york,times,serif; font-size: 12pt;"><div style="font-family: times new roman,new york,times,serif; font-size: 12pt;"><font face="Arial" size="2"><hr size="1"><b><span style="font-weight: bold;">From:</span></b> Yannick Pouliot PhD <ypouliot@stanford.edu><br><b><span style="font-weight: bold;">To:</span></b> support@bioontology.org<br><b><span style="font-weight: bold;">Sent:</span></b> Sunday,
 October 30, 2011 10:58 PM<br><b><span style="font-weight: bold;">Subject:</span></b> [bioontology-support] tokenization function in Annotator?<br></font><br>
<div id="yiv1358505675"><style><!--
#yiv1358505675  
 _filtered #yiv1358505675 {font-family:"Cambria Math";panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
 _filtered #yiv1358505675 {font-family:Calibri;panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
#yiv1358505675  
#yiv1358505675 p.yiv1358505675MsoNormal, #yiv1358505675 li.yiv1358505675MsoNormal, #yiv1358505675 div.yiv1358505675MsoNormal
        {margin:0in;margin-bottom:.0001pt;font-size:11.0pt;font-family:"sans-serif";}
#yiv1358505675 a:link, #yiv1358505675 span.yiv1358505675MsoHyperlink
        {color:blue;text-decoration:underline;}
#yiv1358505675 a:visited, #yiv1358505675 span.yiv1358505675MsoHyperlinkFollowed
        {color:purple;text-decoration:underline;}
#yiv1358505675 span.yiv1358505675EmailStyle17
        {font-family:"sans-serif";color:windowtext;}
#yiv1358505675 .yiv1358505675MsoChpDefault
        {}
 _filtered #yiv1358505675 {margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
#yiv1358505675 div.yiv1358505675WordSection1
        {}
--></style><div><div class="yiv1358505675WordSection1"><div class="yiv1358505675MsoNormal">Howdy.  The Annotator doesn’t recognize the term “heparinized” but does recognize “heparin”. Q: Is there a function I can invoke to ask for tokenization (i.e., removal of parts of terms associated with plurals, adjectives, etc) when invoking the Annotator via REST?</div><div class="yiv1358505675MsoNormal">  </div><div class="yiv1358505675MsoNormal">Thx,</div><div class="yiv1358505675MsoNormal">  </div><div class="yiv1358505675MsoNormal">Yannick</div><div class="yiv1358505675MsoNormal">  </div><div class="yiv1358505675MsoNormal"><span style="font-size: 10pt; color: rgb(166, 166, 166);">____________________<br>Yannick Pouliot, PhD MBA<br>Bioinformatics Specialist</span></div><div class="yiv1358505675MsoNormal"><span style="font-size: 10pt; color: rgb(166, 166, 166);">Butte Laboratory<br>Division of Systems Medicine</span></div><div
 class="yiv1358505675MsoNormal"><span style="font-size: 10pt; color: rgb(166, 166, 166);">Room X-147, MSOB<br>Stanford University School of Medicine<br><a rel="nofollow" ymailto="mailto:ypouliot@stanford.edu" target="_blank" href="mailto:ypouliot@stanford.edu"><span style="color: rgb(166, 166, 166);">ypouliot@stanford.edu</span></a></span><span style="font-size: 12pt; color: rgb(166, 166, 166);"></span></div><div class="yiv1358505675MsoNormal"><span style="font-size: 10pt; color: rgb(166, 166, 166);"><a rel="nofollow" target="_blank" href="http://www.linkedin.com/in/ypouliot"><span style="color: rgb(166, 166, 166);">http://www.linkedin.com/in/ypouliot</span></a></span></div><div class="yiv1358505675MsoNormal">  </div></div></div></div><br>_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a ymailto="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu"
 href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" target="_blank">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br><br><br></div></div></div></body></html>