<html><head><base href="x-msg://51/"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>The current ontology visualization graphs are displayed using FlexViz developed by our collaborators at the University of Victoria. However, we plan to move to displaying ontology visualizations using Bio-Mixer, also developed by the same group. Both projects are described here: <a href="http://www.thechiselgroup.com/projects">http://www.thechiselgroup.com/projects</a></div><div><br></div><div>There is an ontology graph visualization widget available for all ontologies on BioPortal. For ICD, the widget page is at: <a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/47178/?p=widgets">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/47178/?p=widgets</a></div><div><br></div><div>Trish </div><div><br></div><br><div><div>On May 9, 2012, at 10:54 AM, Suzhi Wang wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"><div class="WordSection1" style="page: WordSection1; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Version:          v2.3.5, November 9th, 2010<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Operating System: Windows XP 64<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Flash Version:    WIN 11,1,102,63<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Flash Parameters: log=true&ontology=44450&redirecturl=&virtual=false&server=&nodeid=&v=2.3.6<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Browser URL:     <span class="Apple-converted-space"> </span><a href="http://bioportal.bioontology.org/flex/FlexoViz.html?v=1.1.7" style="color: blue; text-decoration: underline; ">http://bioportal.bioontology.org/flex/FlexoViz.html?v=1.1.7</a><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Hello,<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">I have a question about your virtualization tool for Ontology,<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/47178/?p=terms&conceptid=06" style="color: blue; text-decoration: underline; ">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/47178/?p=terms&conceptid=06</a>.<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">We would like to set up a online Ontology Editor for our project. We installed Webprotege 2011.05.28 successfully. Now we are trying to install a tool for graph virtualization of Ontology terms. We like the virtualization tool on your website. Would you please tell us how do you set it up? Which version of protege/webprotege you use? And which plugin do I need to install?<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">I appreciate if you could help!<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Thanks you,<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Suzhi Wang<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Division of Biostatistics<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Washington University in St. Louis<o:p></o:p></div></div>_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: blue; text-decoration: underline; ">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: blue; text-decoration: underline; ">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br></div></blockquote></div><br>
<br></body></html>