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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Thanks<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/rootpath/1422/10003890?apikey">http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/rootpath/1422/10003890?apikey</a>=<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">just worked for me.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">I need to find the parent code for each medDRA concept code, Is there an easier way to accomplish this without hitting your server for every term.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Himanso<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> Trish Whetzel [mailto:whetzel@stanford.edu]
<br>
<b>Sent:</b> Friday, November 09, 2012 1:13 PM<br>
<b>To:</b> Sahni, Himanso * (FDA)<br>
<b>Cc:</b> support@bioontology.org<br>
<b>Subject:</b> Re: [bioontology-support] 500 error<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">Hi Himanso, <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">The "rootpath" call [1] requires the parameter "conceptId", which for the term "Melanoma" in MedDRA is "10053571" and therefore the call should be formatted as:<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/rootpath/1422/10053571?apikey=YourAPIKey">http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/rootpath/1422/10053571?apikey=YourAPIKey</a><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">However, this call returns an empty list. I'll need to check with the developers to see if the RQ relationship is also considered as a parent relationship and whether this call is expected to return "Malignant melanoma" as a parent. <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Trish <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">[1] <a href="http://www.bioontology.org/wiki/index.php/NCBO_REST_services#Get_paths_to_root.2Fleaves_from_a_concept_in_the_latest_version_of_a_given_ontology">http://www.bioontology.org/wiki/index.php/NCBO_REST_services#Get_paths_to_root.2Fleaves_from_a_concept_in_the_latest_version_of_a_given_ontology</a><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:black">Trish Whetzel, PhD<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:black">Outreach Coordinator<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:black">The National Center for Biomedical Ontology<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:black">Ph: 650-721-2378<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:black"><a href="http://www.bioontology.org">http://www.bioontology.org</a><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:black"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span class="apple-style-span"><span style="font-size:9.0pt">"Like" NCBO on Facebook:
<a href="http://on.fb.me/bioontology">http://on.fb.me/bioontology</a></span></span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span class="apple-style-span"><span style="font-size:9.0pt">Follow NCBO on Twitter:
<a href="http://twitter.com/#!/bioontology">http://twitter.com/#!/bioontology</a></span></span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span class="apple-style-span"><span style="font-size:9.0pt">Join in Discussions on LinkedIn:
<a href="http://linkd.in/ncbo-group">http://linkd.in/ncbo-group</a></span></span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">On Nov 9, 2012, at 9:34 AM, Sahni, Himanso * (FDA) wrote:<o:p></o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><br>
<br>
<o:p></o:p></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"">I am getting a 500 error for the following query<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""> <o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""><a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/rootpath/1422/Melanoma?apikey">http://rest.bioontology.org/bioportal/virtual/rootpath/1422/Melanoma?apikey</a>=<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""> <o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""><errorStatus><accessedResource>/bioportal/virtual/rootpath/1422/Melanoma</accessedResource><accessDate>2012-11-09 09:33:57.308 PST</accessDate><shortMessage>Internal Server
 Error</shortMessage><longMessage>The server encountered an unexpected condition which prevented it from fulfilling the request</longMessage><errorCode>500</errorCode></errorStatus><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""> <o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"">using my access key<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""> <o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Himanso Sahni</span><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""><a href="mailto:Himanso.Sahni@fda.hhs.gov">Himanso.Sahni@fda.hhs.gov</a><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Contractor-Recombinant Data Corp.</span><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""><a href="mailto:HSahni@recomdata.com">HSahni@recomdata.com</a><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black"> </span><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black"> </span><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""> <o:p></o:p></span></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Arial","sans-serif"">_______________________________________________<br>
bioontology-support mailing list<br>
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br>
<a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
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