<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=windows-1252"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi Nikolina,<div><br></div><div>I think you have a typo in one of your prefixes Try with these ...</div><div><br></div><div><div> PREFIX rdfs: <<a href="http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#">http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#</a>></div><div> PREFIX skos: <<a href="http://www.w3.org/2004/02/skos/core#">http://www.w3.org/2004/02/skos/core#</a>></div></div><div><br></div><div>You can see the query running here: </div><div><br></div><div><a href="http://goo.gl/0zMpz">http://goo.gl/0zMpz</a></div><div><br></div><div>I normally use this service called prefix.cc to get the right prefix   <a href="http://prefix.cc/skos,rdfs.sparql">http://prefix.cc/skos,rdfs.sparql</a></div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>Manuel</div><div><br></div><div><div><div>On Nov 28, 2012, at 3:06 PM, Nikolina Koleva <<a href="mailto:nikolina.koleva19@yahoo.de">nikolina.koleva19@yahoo.de</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Dear all,<div><br></div><div>I am experimenting with the BioPortal SPARQL. I want to extract the root path of a given concept in a given ontology.</div><div><br></div><div>In the paper: </div><div><span id="author" property="dcterms:creator" style="font-family: Times; ">Manuel Salvadores, Matthew Horridge, Paul Alexander, Ray W. Fergerson, Mark A. Musen and Natasha F. Noy</span><span style="font-family: Times; ">, </span><span id="title" property="rdfs:label" style="font-family: Times; font-weight: bold; ">Using SPARQL to Query BioPortal Ontologies and Metadata</span><span style="font-family: Times; ">, </span><span id="booktitle" style="font-family: Times; ">in <i>Proceedings of the 11th International Semantic Web Conference (ISWC 2012)</i>,</span><span style="font-family: Times; "> </span><span id="address" style="font-family: Times; ">Boston, US,</span><span style="font-family: Times; "> </span><span id="month" style="font-family: Times; ">November,</span><span style="font-family: Times; "> </span><span id="year" property="dcterms:created" style="font-family: Times; ">2012</span><span style="font-family: Times; ">.</span></div><div><br></div><div>Figure 4 shows a SPARQL query that must retrieve two ancestors of a given element. The results are also shown there.</div><div><br></div><div>When executing the query in the web interface I get no results (see attachment). </div><div>The query that I am running is:</div><div><br></div><div><div>PREFIX rdfs: <<a href="http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#">http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#</a>></div><div>PREFIX skos: <<a href="http://www.w3.org/2008/05/skos#">http://www.w3.org/2008/05/skos#</a>></div><div><br></div><div>SELECT DISTINCT ?ss0 ?nstep ?label{</div><div>{ GRAPH <<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT</a>> {</div><div>        <<a href="http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/122040007">http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/122040007</a>> rdfs:subClassOf ?ss1 . </div><div>        ?ss1 rdfs:subClassOf ?ss0 . </div><div>        ?ss0 skos:prefLabel ?label</div><div>        BIND ('2' AS ?nstep) .</div><div>     } } </div><div>     UNION { GRAPH <<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT</a>> {</div><div>        <<a href="http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/122040007">http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/122040007</a>> rdfs:subClassOf ?ss0 . </div><div>        ?ss0 skos:prefLabel ?label.</div><div>        BIND ('1' AS ?nstep) .</div><div>     } } </div><div> } ORDER BY ?nstep</div></div><div><br></div><div>I tried it with another term that also has two parents (<span style="font-size: 12px; ">363664003</span>) and it hadn't work, too.</div><div>Is there something that I am doing wrong?</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Nikolina</div><div><br></div><div><span><sparqlNoresults.png></span></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div></div>_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br>https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support<br></blockquote></div><br></div></body></html>