<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi Simon,<div><br></div><div>The project that Trish mentions uses the UMLS Mysql backend. It does not transform the RRF files directly.</div><div><br></div><div>Manuel</div><div><br></div><div><br><div><div>On Dec 10, 2012, at 11:21 PM, Trish Whetzel <<a href="mailto:whetzel@stanford.edu">whetzel@stanford.edu</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><base href="x-msg://29/"><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>Hi Simon, </div><div><br></div><div>I am not very familiar with the RRF format. However, as part of our work to develop the SPARQL endpoint for BioPortal, a umls2rdf [1] tool was created.</div><div><br></div><div>Trish </div><div><br></div><div>[1] <a href="https://github.com/ncbo/umls2rdf">https://github.com/ncbo/umls2rdf</a></div><div><br></div><br><div><div>On Dec 10, 2012, at 7:19 PM, Simon Kocbek wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Arial; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div lang="EN-AU" link="blue" vlink="purple"><div class="WordSection1" style="page: WordSection1; "><div style="margin-top: 0cm; margin-right: 0cm; margin-left: 0cm; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Hi,<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0cm; margin-right: 0cm; margin-left: 0cm; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0cm; margin-right: 0cm; margin-left: 0cm; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">I would like to work with the ICD ontology (<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/1101" style="color: blue; text-decoration: underline; ">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/1101</a>) and I am not used to the RRF format. Is there a way to simply convert RRF files to OWL?<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0cm; margin-right: 0cm; margin-left: 0cm; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0cm; margin-right: 0cm; margin-left: 0cm; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Is there a tool to manipulate RRF files? I am aware of LexEVS, however, I cannot find its loader for general RRF ontologies.<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0cm; margin-right: 0cm; margin-left: 0cm; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0cm; margin-right: 0cm; margin-left: 0cm; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Thanks,<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0cm; margin-right: 0cm; margin-left: 0cm; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Simon<o:p></o:p></div></div>_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: blue; text-decoration: underline; ">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: blue; text-decoration: underline; ">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br></div></span></blockquote></div><br></div>_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br>https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support<br></blockquote></div><br></div></body></html>