<div dir="ltr"><div><div>Beginning user of the Bioportal annotator [<a href="http://bioportal.bioontology.org/annotator">http://bioportal.bioontology.org/annotator</a>].  I entered the following text, and attempted to annotate this using SNOMEDCT ontology: </div>
<div><br></div></div><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div><div style>"35 yo male with severe <span style="background-color:rgb(182,215,168)">acne</span> vulgaris and hla-b27-positive inflammatory arthritis.  Acne not responding to clindamycin or doxycycline.  <span style="background-color:rgb(182,215,168)">Current</span>ly on Arava and Indocin for the arthritis."</div>
</div></blockquote><div><div><br></div></div><div style>However, it matched only "acne" and "current".</div><div style><br></div><div style>Whereas I would have expected it to also identify "male", "acne vulgaris", "inflammatory arthritis", "clindamycin", "doxycycline", as these are also terms in SnoMed-CT, and picked up by other annotation engines like cTakes.  </div>
<div style><br></div><div style>Might there be something that I am doing wrong?</div><div style><br></div><div style>All the best, </div><div style>Pieter</div><div style><br></div><div style>Pieter Sheth-Voss, PhD</div><div style>
m. 617 645 4524</div></div>