<html><body>
<p><font size="2" face="sans-serif">Exactly what I was looking for, thanks Ray!</font><br>
<br>
<font size="2" face="sans-serif">For the record, I did try the "history and physical" search but I did NOT think to set the "include property values" flag.  For some reason I was thinking it only affected the contents of what would be returned, not the actual fields that are searched (similar to </font><font size="3" face="serif">includedefinitions</font><font size="2" face="sans-serif">)</font><br>
<br>
<font size="2" face="sans-serif">thanks,</font><br>
<br>
<font size="2" face="sans-serif">Lee Surprenant<br>
IBM Emerging Technologies | jStart Team<br>
lmsurpre@us.ibm.com | (919) 543-8919</font><br>
<br>
<img width="16" height="16" src="cid:1__=08BBF140DFE104D08f9e8a93df938@us.ibm.com" border="0" alt="Inactive hide details for Ray Fergerson ---08/26/2013 04:47:59 PM---Lee,"><font size="2" color="#424282" face="sans-serif">Ray Fergerson ---08/26/2013 04:47:59 PM---Lee,</font><br>
<br>
<font size="1" color="#5F5F5F" face="sans-serif">From:      </font><font size="1" face="sans-serif">Ray Fergerson <ray.fergerson@stanford.edu></font><br>
<font size="1" color="#5F5F5F" face="sans-serif">To:        </font><font size="1" face="sans-serif">Lee M Surprenant/Raleigh/IBM@IBMUS, <support@bioontology.org></font><br>
<font size="1" color="#5F5F5F" face="sans-serif">Date:      </font><font size="1" face="sans-serif">08/26/2013 04:47 PM</font><br>
<font size="1" color="#5F5F5F" face="sans-serif">Subject:   </font><font size="1" face="sans-serif">RE: [bioontology-support] search concept definitions</font><br>
<hr width="100%" size="2" align="left" noshade style="color:#8091A5; "><br>
<br>
<br>
<font size="2" color="#1F497D" face="Calibri">Lee,</font><br>
<font size="2" color="#1F497D" face="Calibri"> </font><br>
<font size="2" color="#1F497D" face="Calibri">If you use “History and Physical” as the search term and then include property values in the search, you will get 10 matches, including the ROS one that you prefer. The “include property valus” flag allows the system to search the definition property, which is were the matches are made.</font><br>
<font size="2" color="#1F497D" face="Calibri"> </font><br>
<font size="2" color="#1F497D" face="Calibri">Ray</font><br>
<font size="2" color="#1F497D" face="Calibri"> </font>
<ul style="padding-left: 36pt"><font size="2" face="Tahoma"><b>From:</b></font><font size="2" face="Tahoma"> bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu [</font><font size="2" face="Tahoma"><a href="mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu">mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu</a></font><font size="2" face="Tahoma">] </font><font size="2" face="Tahoma"><b>On Behalf Of </b></font><font size="2" face="Tahoma">Lee M Surprenant</font><font size="2" face="Tahoma"><b><br>
Sent:</b></font><font size="2" face="Tahoma"> Thursday, August 22, 2013 12:29 PM</font><font size="2" face="Tahoma"><b><br>
To:</b></font><font size="2" face="Tahoma"> support@bioontology.org</font><font size="2" face="Tahoma"><b><br>
Subject:</b></font><font size="2" face="Tahoma"> [bioontology-support] search concept definitions</font><br>
<font size="3" face="Times New Roman"> </font>
<p><font size="2" face="Arial">I was browsing the REST API and I do not see this function.  Here is why I think it would be useful:</font><font size="3" face="Times New Roman"><br>
</font><font size="2" face="Arial"><br>
I am trying to find the best match for my concept "History and Physical" from within the NCI Thesaurus.</font><font size="3" face="Times New Roman"><br>
</font><font size="2" face="Arial"><br>
I make the following REST call:</font><font size="2" color="#0000FF" face="Arial"><u><br>
</u></font><a href="http://rest.bioontology.org/bioportal/search/?query=Physical&ontologyids=1032&subtreerootconceptid=C16203&includedefinitions=true&maxnumhits=15&apikey=YourApiKey"><font size="2" color="#0000FF" face="Arial"><u>http://rest.bioontology.org/bioportal/search/?query=Physical&ontologyids=1032&subtreerootconceptid=C16203&includedefinitions=true&maxnumhits=15&apikey=YourApiKey</u></font></a><font size="3" face="Times New Roman"><br>
</font><font size="2" face="Arial"><br>
I get back a single answer with a decent match:<br>
<conceptId></font><a href="http://ncicb.nci.nih.gov/xml/owl/EVS/Thesaurus.owl#C20989"><font size="2" color="#0000FF" face="Arial"><u>http://ncicb.nci.nih.gov/xml/owl/EVS/Thesaurus.owl#C20989</u></font></a><font size="2" face="Arial"></conceptId><br>
<conceptIdShort>C20989</conceptIdShort><br>
<preferredName>Physical Examination</preferredName><br>
<contents>Physical</contents><br>
<definition>A systemic evaluation of the body and it&apos;s functions using visual inspection, palpation, percussion and auscultation. The purpose is to determine the presence or absence of physical signs of disease or abnormality for an individual&apos;s health assessment.</definition><br>
...</font><font size="3" face="Times New Roman"><br>
<br>
</font><font size="2" face="Arial"><br>
But it's missing the 'History' part, so I browse the Ontology manually and find:</font>
<p>
<table class="MsoNormalTable" width="100%" border="0" cellspacing="0" cellpadding="0">
<tr valign="top"><td width="19%" valign="middle">
<ul style="padding-left: 36pt"><font size="3" face="Times New Roman">Preferred Name (Preferred_Name) </font></ul>
</td><td width="81%" valign="middle">
<ul style="padding-left: 36pt"><font size="3" face="Times New Roman">Review of Systems</font></ul>
</td></tr>

<tr valign="top"><td width="19%" valign="middle">
<ul style="padding-left: 36pt"><font size="3" face="Times New Roman">Synonyms (FULL_SYN) </font></ul>
</td><td width="81%" valign="middle">
<ul style="padding-left: 36pt"><font size="3" face="Times New Roman">ROS</font></ul>
</td></tr>

<tr valign="top"><td width="19%" valign="middle">
<ul style="padding-left: 36pt"><font size="3" face="Times New Roman">Definitions (DEFINITION) </font></ul>
</td><td width="81%" valign="middle">
<ul style="padding-left: 36pt"><font size="3" face="Times New Roman">A comprehensive assessment of a patient, which includes a subjective history taking component as well as an objective based structured interview and physical examination of all the body systems.</font></ul>
</td></tr>

<tr valign="top"><td width="19%" valign="middle">
<ul style="padding-left: 36pt"><font size="3" face="Times New Roman">ID</font></ul>
</td><td width="81%" valign="middle">
<ul style="padding-left: 36pt"><font size="3" face="Times New Roman">C95618</font></ul>
</td></tr>
</table>
<font size="3" face="Times New Roman"><br>
</font><font size="2" face="Arial"><br>
Now, I'm not necessarilly saying that ROS is a "better" match, but it would be nice for it to show up on the search results.  Any thoughts?</font><font size="3" face="Times New Roman"><br>
</font><font size="2" face="Arial"><br>
thanks,</font><font size="3" face="Times New Roman"><br>
</font><font size="2" face="Arial"><br>
Lee Surprenant<br>
IBM Emerging Technologies | jStart Team</font><font size="2" color="#0000FF" face="Arial"><u><br>
</u></font><a href="mailto:lmsurpre@us.ibm.com"><font size="2" color="#0000FF" face="Arial"><u>lmsurpre@us.ibm.com</u></font></a><font size="2" face="Arial"> | (919) 543-8919</font>
<p></ul>
</body></html>