<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=windows-1252"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">Michael,<div><br></div><div>The link you provided works for me using curl, Firefox, and other HTTP tools. What exactly is the failure you are seeing?</div><div><br></div><div>Iím testing this URL:</div><div><a href="http://data.bioontology.org/ontologies/NDDF/submissions/1/download?apikey=81ac8eba-12ca-4b94-a80f-82e4cfd2291a">http://data.bioontology.org/ontologies/NDDF/submissions/1/download?apikey=81ac8eba-12ca-4b94-a80f-82e4cfd2291a</a></div><div><br></div><div>Paul</div><div><br></div><div><br><div><div>On Nov 1, 2013, at 7:53 PM, Celeste, Michael <<a href="mailto:michael.celeste@pfizer.com">michael.celeste@pfizer.com</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;"><div class="WordSection1" style="page: WordSection1;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Yes, the link below works. I gave you the wrong key. When I try to query using java with the key below I get the 500 error but if I use this key 4ea81d74-8960-4525-810b-fa1baab576ff then the program works.<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">So basically my question is why does this key not work:</span><span class="Apple-converted-space"> </span><span style="color: rgb(31, 73, 125);">81ac8eba-12ca-4b94-a80f-82e4cfd2291a<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Michael<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div><div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;"><span class="Apple-converted-space"> </span>Ray Fergerson [<a href="mailto:ray.fergerson@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;">mailto:ray.fergerson@stanford.edu</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Friday, November 01, 2013 9:10 PM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Celeste, Michael;<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;">support@bioontology.org</a><br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Manuel Salvadores<br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>RE: [bioontology-support] Java/Jena example 500 error<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">The link below appears to work now and downloads a file (NDDF.ttl). Can you confirm? Have I misunderstood what you want?<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Ray<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div><div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;"><span class="Apple-converted-space"> </span>Celeste, Michael [<a href="mailto:michael.celeste@pfizer.com" style="color: purple; text-decoration: underline;">mailto:michael.celeste@pfizer.com</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Thursday, October 24, 2013 3:10 PM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Ray Fergerson;<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;">support@bioontology.org</a><br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Manuel Salvadores<br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>RE: [bioontology-support] Java/Jena example 500 error<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Hereís an example of one from this url:<span class="Apple-converted-space"> </span></span><a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NDDF" style="color: purple; text-decoration: underline;">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NDDF</a><o:p></o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">Hereís the link with the API key:<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="http://data.bioontology.org/ontologies/NDDF/submissions/1/download?apikey=81ac8eba-12ca-4b94-a80f-82e4cfd2291a" style="color: purple; text-decoration: underline;">http://data.bioontology.org/ontologies/NDDF/submissions/1/download?apikey=81ac8eba-12ca-4b94-a80f-82e4cfd2291a</a><o:p></o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">Michael<span style="color: rgb(31, 73, 125);"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div><div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;"><span class="Apple-converted-space"> </span>Ray Fergerson [<a href="mailto:ray.fergerson@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;">mailto:ray.fergerson@stanford.edu</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Thursday, October 24, 2013 6:09 PM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Celeste, Michael;<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;">support@bioontology.org</a><br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Manuel Salvadores<br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>RE: [bioontology-support] Java/Jena example 500 error<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Sorry but I am still a bit lost. What keys are you referring to that are associated with the ontology download links? Where do you see these links? Are they in some sample code that we provide?<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Ray<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div><div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;"><span class="Apple-converted-space"> </span>Celeste, Michael [<a href="mailto:michael.celeste@pfizer.com" style="color: purple; text-decoration: underline;">mailto:michael.celeste@pfizer.com</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Thursday, October 24, 2013 2:58 PM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Ray Fergerson;<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;">support@bioontology.org</a><br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Manuel Salvadores<br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>RE: [bioontology-support] Java/Jena example 500 error<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Yes, there are keys associated to the ontology download links. If I use one of those then I get data using the sample java programs.<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Michael<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div><div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;"><span class="Apple-converted-space"> </span>Ray Fergerson [<a href="mailto:ray.fergerson@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;">mailto:ray.fergerson@stanford.edu</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Thursday, October 24, 2013 5:56 PM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Celeste, Michael;<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;">support@bioontology.org</a><br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Manuel Salvadores<br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>RE: [bioontology-support] Java/Jena example 500 error<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Why do you say this? If you use someone elseís api key does it work?<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Ray<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div><div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;"><span class="Apple-converted-space"> </span>Celeste, Michael [<a href="mailto:michael.celeste@pfizer.com" style="color: purple; text-decoration: underline;">mailto:michael.celeste@pfizer.com</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Thursday, October 24, 2013 2:51 PM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Ray Fergerson;<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;">support@bioontology.org</a><br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Manuel Salvadores<br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>RE: [bioontology-support] Java/Jena example 500 error<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Ok, thank you for your reply.<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"><br>I actually think itís my API key that is the problem: <span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-family: 'Trebuchet MS', sans-serif; background-color: white;">81ac8eba-12ca-4b94-a80f-82e4cfd2291a</span><span style="color: rgb(31, 73, 125);"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Michael<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div><div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;"><span class="Apple-converted-space"> </span>Ray Fergerson [<a href="mailto:ray.fergerson@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;">mailto:ray.fergerson@stanford.edu</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Thursday, October 24, 2013 5:47 PM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Celeste, Michael;<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;">support@bioontology.org</a><br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Manuel Salvadores<br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>RE: [bioontology-support] Java/Jena example 500 error<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Our expert on this is half-way around the world this week. He should be able to respond next week.<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);">Ray<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 1.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div><div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;"><span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;">bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu</a><span class="Apple-converted-space"> </span>[<a href="mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;">mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><b>On Behalf Of<span class="Apple-converted-space"> </span></b>Celeste, Michael<br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Friday, October 18, 2013 3:22 AM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;">support@bioontology.org</a><br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>[bioontology-support] Java/Jena example 500 error<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">Hello,<br><br>I am trying to run the java file using Jena below after supplying my apikey but I keep getting an HTTP 500 error. I also tried adding a query parameter but get the same error.<o:p></o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">Thanks,<br>Michael<o:p></o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">package</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>businessdevelopment;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">import</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>com.hp.hpl.jena.query.Query;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">import</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>com.hp.hpl.jena.query.QueryExecutionFactory;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">import</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>com.hp.hpl.jena.query.QueryFactory;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">import</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>com.hp.hpl.jena.query.QuerySolution;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">import</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>com.hp.hpl.jena.query.ResultSet;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">import</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>com.hp.hpl.jena.rdf.model.Literal;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">import</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>com.hp.hpl.jena.rdf.model.RDFNode;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">import</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>com.hp.hpl.jena.sparql.engine.http.QueryEngineHTTP;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(63, 95, 191);">/**</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(63, 95, 191);">* This is an example built on top of the<span class="Apple-converted-space"> </span><u>Jena</u><span class="Apple-converted-space"> </span>ARQ library.</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(63, 95, 191);">* See:<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="http://jena.sourceforge.net/ARQ/documentation.html" style="color: purple; text-decoration: underline;">http://jena.sourceforge.net/ARQ/documentation.html</a></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(63, 95, 191);">*/</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">public</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"> </span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">class</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>JenaARQTest {</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">       </span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">        </span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">private</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>String<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(0, 0, 192);">service</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>=<span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">null</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">       <span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">private</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>String<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(0, 0, 192);">apikey</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>=<span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">null</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">       </span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">        </span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">public</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>JenaARQTest(String service, String apikey) {</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">               <span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">this</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">.</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(0, 0, 192);">service</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>= service;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">               <span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">this</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">.</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(0, 0, 192);">apikey</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>= apikey;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">        }</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">       <span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">public</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>ResultSet executeQuery(String queryString)<span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">throws</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">Exception {</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                 Query query = QueryFactory.<i>create</i>(queryString) ;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                 QueryEngineHTTP qexec = QueryExecutionFactory.<i>createServiceRequest</i>(</span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">this</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">.</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(0, 0, 192);">service</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">, query);</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                 qexec.addParam(</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"apikey"</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">,<span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">this</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">.</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(0, 0, 192);">apikey</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">);</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                <span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(63, 127, 95);">//qexec.addParam("query", queryString);                </span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                 ResultSet results = qexec.execSelect() ;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                <span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">return</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>results;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">        }</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">       <span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">public</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"> </span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">static</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"> </span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">void</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>main(String[] args)<span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">throws</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>Exception {</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                String sparqlService =</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"<a href="http://sparql.bioontology.org/sparql" style="color: purple; text-decoration: underline;">http://sparql.bioontology.org/sparql</a>"</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                String apikey =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"81ac8eba-12ca-4b94-a80f-82e4cfd2291a"</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">               <span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(63, 127, 95);">/*</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(63, 127, 95);">                 * More query examples here:</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(63, 127, 95);">                 *<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="http://sparql.bioontology.org/examples" style="color: purple; text-decoration: underline;">http://sparql.bioontology.org/examples</a></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(63, 127, 95);">                 */</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                String query =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"PREFIX omv: <<a href="http://omv.ontoware.org/2005/05/ontology" style="color: purple; text-decoration: underline;">http://omv.ontoware.org/2005/05/ontology#</a>> "</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>+</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                                          <span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"SELECT ?ont ?name ?acr "</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>+</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                                          <span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"WHERE { ?ont a omv:Ontology; "</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>+</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                                          <span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"omv:acronym ?acr; "</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>+</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                                          <span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"omv:name ?name . "</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>+</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                                          <span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"}"</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">               <span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">try</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>{</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                JenaARQTest test =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">new</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">JenaARQTest(sparqlService,apikey);</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                ResultSet results = test.executeQuery(query);</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                   <span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">for</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>( ; results.hasNext() ; ) {</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                      QuerySolution soln = results.nextSolution() ;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                      RDFNode ontUri = soln.get(</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"ont"</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">) ;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                      Literal name = soln.getLiteral(</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"name"</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">) ;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                      Literal acr = soln.getLiteral(</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">"acr"</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">) ;</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                      System.</span><i><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(0, 0, 192);">out</span></i><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">.println(ontUri +<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">" ---- "</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>+ name +<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(42, 0, 255);">" ---- "</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><span class="Apple-converted-space"> </span>+ acr);</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                    }</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                }</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">               <span class="Apple-converted-space"> </span></span><b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(127, 0, 85);">catch</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">(Exception e) {</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                  System.</span><i><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New'; color: rgb(0, 0, 192);">out</span></i><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">.println(e);</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">                }</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">        }</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';">}</span><span style="font-size: 10pt; font-family: 'Courier New';"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 2in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><o:p> </o:p></div></div>_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: purple; text-decoration: underline;">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a></div></blockquote></div><br></div></body></html>