<div dir="ltr">Dear all and Manuel,<div><br></div><div>First, thanks for your great support.</div><div><br></div><div>My research is focussing on the semantic web in health sector, how to exploit there references/terms and to analyze them. When I say external references I mentioned the source of the obtained concept, mainly to retrieve information a patient from a trusted health information -not only a description or term. As an example MEDLINEPLUS collects a set of web page that explains the concept.</div>

<div><br></div><div>I don´t know If I explaind crearly, my apologize. I hope it would be better explained.</div><div><br></div><div>Best regards</div><div>C. </div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">

2013/11/4 manuelso <span dir="ltr"><<a href="mailto:manuelso@stanford.edu" target="_blank">manuelso@stanford.edu</a>></span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<div style="word-wrap:break-word">Carlos,<div><br></div><div>Answers inlined below …</div><div><br></div><div><br><div><div class="im"><div>On Nov 2, 2013, at 4:20 AM, Carlos Luis Sánchez Bocanegra <<a href="mailto:carlosl.sanchez@gmail.com" target="_blank">carlosl.sanchez@gmail.com</a>> wrote:</div>

<br><blockquote type="cite"><div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>The following class: <a href="http://data.bioontology.org/ontologies/NCIT/classes/http%3A%2F%2Fncicb.nci.nih.gov%2Fxml%2Fowl%2FEVS%2FThesaurus.owl%23C2985?include=prefLabel,synonyms,definitions,properties" target="_blank">http://data.bioontology.org/ontologies/NCIT/classes/http%3A%2F%2Fncicb.nci.nih.gov%2Fxml%2Fowl%2FEVS%2FThesaurus.owl%23C2985?include=prefLabel,synonyms,definitions,properties</a></div>



<div><br></div><div>Consult another OWL files from the NCIT Ontology. Surprisely I found no external links on their description (remembering the <span style="color:rgb(102,102,153);font-family:'Lucida Sans Unicode','Lucida Grande',sans-serif;font-size:12px;line-height:14px">MP_HEALTH_TOPIC_URL on MEDLINEPLUS Onto). That means that no all Class contain links in their properties, doesn´t it?.  Is there any way to deep in the class for obtaining external information? (mapping possible?).</span></div>

</div></blockquote><div><br></div></div><div>You might want to look at our mapping dataset:</div><div><br></div><div><a href="http://bioportal.bioontology.org/mappings" target="_blank">http://bioportal.bioontology.org/mappings</a></div>

<div><br></div><div>Though I am not sure if this is what you need. I am not sure what are external references in this context.</div><div class="im"><div><br></div><blockquote type="cite"><div dir="ltr">

<div><span style="color:rgb(102,102,153);font-family:'Lucida Sans Unicode','Lucida Grande',sans-serif;font-size:12px;line-height:14px"><br></span></div><div><span style="color:rgb(102,102,153);font-family:'Lucida Sans Unicode','Lucida Grande',sans-serif;font-size:12px;line-height:14px">In this case which Ontologies are supporting external references?.</span></div>

</div></blockquote><div><br></div></div><div>Carlos, can you explain a bit your use case and what you mean by external references ?</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div><br></div><div>Manuel</div><div><div class="h5">

<div><br></div><blockquote type="cite"><div dir="ltr">

<div><span style="color:rgb(102,102,153);font-family:'Lucida Sans Unicode','Lucida Grande',sans-serif;font-size:12px;line-height:14px"><br></span></div><div><span style="color:rgb(102,102,153);font-family:'Lucida Sans Unicode','Lucida Grande',sans-serif;font-size:12px;line-height:14px">My apologizes for these stupid queries, but i´m begining on this thread.</span></div>



<div><span style="color:rgb(102,102,153);font-family:'Lucida Sans Unicode','Lucida Grande',sans-serif;font-size:12px;line-height:14px"><br></span></div><div><font color="#666699" face="Lucida Sans Unicode, Lucida Grande, sans-serif"><span style="font-size:12px;line-height:14px">Thank you in advance.</span></font></div>



</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2013/11/2 Carlos Luis Sánchez Bocanegra <span dir="ltr"><<a href="mailto:carlosl.sanchez@gmail.com" target="_blank">carlosl.sanchez@gmail.com</a>></span><br>



<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Thanks Manuel!<div><br></div><div>Other question I have on my mind is the Category. What is the use of it? How can I manage over my queries?</div>



<div><br></div><div>Thanks a lot.</div><span><font color="#888888">C.</font></span></div><div><div><div class="gmail_extra">
<br><br><div class="gmail_quote">2013/11/2 manuelso <span dir="ltr"><<a href="mailto:manuelso@stanford.edu" target="_blank">manuelso@stanford.edu</a>></span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">




<div style="word-wrap:break-word">Hi Carlos,<div><br></div><div>The default REST class call does not return all the properties attached to a term. If you want to see all properties you can add the following parameter to your call:</div>




<div><br></div><div>?include=prefLabel,synonyms,definitions,properties</div><div><br></div><div>something like this would work:</div><div><br></div><div><a href="http://data.bioontology.org/ontologies/MEDLINEPLUS/classes/http://purl.bioontology.org/ontology/MEDLINEPLUS/31?include=prefLabel,synonyms,definitions,properties" target="_blank">http://data.bioontology.org/ontologies/MEDLINEPLUS/classes/http%3A%2F%2Fpurl.bioontology.org%2Fontology%2FMEDLINEPLUS%2F31?include=prefLabel,synonyms,definitions,properties</a></div>




<div><br></div><div>Manuel</div><div><br></div><div><br></div><div><div><div><div>On Nov 1, 2013, at 6:14 PM, Carlos Luis Sánchez Bocanegra <<a href="mailto:carlosl.sanchez@gmail.com" target="_blank">carlosl.sanchez@gmail.com</a>> wrote:</div>




<br></div><blockquote type="cite"><div><div dir="ltr">Hi everyone,<div><br></div><div>I´m diving on the bioontology REST API, try to exploit all their possibilities including on this API.</div><div><br>
</div><div>I take some time to adapt and get manual results and finally I think I can manage with the API. I need to access to the <span style="color:rgb(102,102,153);font-family:'Lucida Sans Unicode','Lucida Grande',sans-serif;font-size:12px;line-height:14px">MP_HEALTH_TOPIC_URL value on the Class Medicine (for example) </span><font color="#666699" face="Lucida Sans Unicode, Lucida Grande, sans-serif"><span style="font-size:12px;line-height:14px"><a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/MEDLINEPLUS?p=classes&conceptid=http%3A%2F%2Fpurl.bioontology.org%2Fontology%2FMEDLINEPLUS%2F31#details" target="_blank">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/MEDLINEPLUS?p=classes&conceptid=http%3A%2F%2Fpurl.bioontology.org%2Fontology%2FMEDLINEPLUS%2F31#details</a></span></font></div>






<div><font color="#666699" face="Lucida Sans Unicode, Lucida Grande, sans-serif"><span style="font-size:12px;line-height:14px"><br></span></font></div><div><font color="#666699" face="Lucida Sans Unicode, Lucida Grande, sans-serif"><span style="font-size:12px;line-height:14px">But REST API does not give me this value: </span></font><a href="http://data.bioontology.org/ontologies/MEDLINEPLUS/classes/http%3A%2F%2Fpurl.bioontology.org%2Fontology%2FMEDLINEPLUS%2F31" title="Link: http://data.bioontology.org/ontologies/MEDLINEPLUS/classes/http%3A%2F%2Fpurl.bioontology.org%2Fontology%2FMEDLINEPLUS%2F31" style="background-color:transparent;font-family:monaco,monospace;font-size:12px;line-height:21px;white-space:pre-line;margin:0px;padding:2px 0px;vertical-align:baseline;color:rgb(28,92,118);word-wrap:break-word" target="_blank">http://data.bioontology.org/ontologies/MEDLINEPLUS/classes/http%3A%2F%2Fpurl.bioontology.org%2Fontology%2FMEDLINEPLUS%2F31</a><span style="background-color:transparent;color:rgb(51,51,51);font-family:monaco,monospace;font-size:12px;line-height:21px;white-space:pre-line"> : </span><a href="http://purl.bioontology.org/ontology/MEDLINEPLUS/31" title="Link: http://purl.bioontology.org/ontology/MEDLINEPLUS/31" style="background-color:transparent;font-family:monaco,monospace;font-size:12px;line-height:21px;white-space:pre-line;margin:0px;padding:2px 0px;vertical-align:baseline;color:rgb(28,92,118);outline:none;word-wrap:break-word" target="_blank">http://purl.bioontology.org/ontology/MEDLINEPLUS/31</a></div>






<div><br></div><div>In the rest result I can´t find MP_HEALTH_TOPIC_URL.</div><div><br></div><div>Thank your for helping me.</div><div><br></div><div>C.</div></div></div>
_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" target="_blank">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" target="_blank">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br>




</blockquote></div><br></div></div></blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>
_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" target="_blank">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" target="_blank">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br>

</blockquote></div></div></div><br></div></div></blockquote></div><br></div>