<div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div><div><div><div>Hi all - <br><br></div>I have been trying to get the hierarchical information as displayed on the web interface @"<a href="http://bioportal.bioontology.org/">http://bioportal.bioontology.org/</a>" when a term is searched in a given ontology - <br>

<br></div><div>This is what I intend to achieve => <a href="https://trac.clinovo.com/clincapture/attachment/ticket/741/howTo.jpg">https://trac.clinovo.com/clincapture/attachment/ticket/741/howTo.jpg</a><br></div><div>
<br>
</div>Context:<br><br></div>Given the information returned by the web service, we intend to programmatic-ally build this hierarchy (really, display the fields as shown in the screen shot above) in another system (open source application => clincapture) which is using bio-portal as the end point for medical coding.<br>

<br></div>What I have done so for:<br><br></div>1. I am able to use the old "<a href="http://rest.bioontology.org">http://rest.bioontology.org</a>" (I am yet to get acquainted with the new web service) to extract the coded term for a given verbatim term entered by the user in our system<br>

<br></div>2. I have tried to work with the view extraction service but it seems to me that it only returns one subclass of the concept (the immediate sub class) - I am looking for the entire hierarchy<br><br></div>3. I have also tinkered with the RDF term service but it would appear that the generated xml does not have the entire hierarchy - It would seem that the returned xml cannot allow me to walk back to the root element (as depicted on the UX) <br>

<br></div>I know I am missing something or have probably not looked somewhere, can anyone give me some leads as to how I can retrieve the information in the tree view (With the hierarchy)? I will really appreciate the help!<br>

<br></div>Mark<br clear="all"><div><div><div><div><div><div><div><div><div><div><br>-- <br><div dir="ltr"><table style="line-height:170%;border:0px none;width:580px"><tbody><tr><td style="font-family:'arial unicode ms',sans-serif;font-size:13px;width:286px" valign="top">

<div><b>Mark Gerard</b></div>
                                <div>
                                        <span>Software Developer</span></div>
                                <div>
                                        <b><a href="mailto:sophie.mccallum@clinovo.com" style="color:rgb(137,59,201)" target="_blank">mark.gerard@clinovo.com</a></b></div>
                        </td>
                        <td style="font-family:'arial unicode ms',sans-serif;font-size:13px;width:152px" valign="top">
                                <div>
                                        <b>Cell</b>: <font color="#1155cc">(256) 794323934</font></div>
                                <div>
                                        <b>Tel</b>: <span style="color:rgb(17,85,204);font-family:arial,sans-serif;line-height:170%">(256) 794323934</span></div>
                                <div>
                                        <b><a href="http://www.clinovo.com" style="color:rgb(137,59,201)" target="_blank">www.clinovo.com</a></b></div>
                        </td>
                        <td style="width:146px">
                                <p><a href="http://www.clinovo.com/" style="line-height:170%;font-family:inherit;font-size:14px;color:black;text-decoration:underline;font-style:inherit;border:0px none;vertical-align:baseline" target="_blank"><img alt="Clinovo" src="http://clinovo.com/userfiles/logo-sig.jpg" height="30" width="96"></a><br>


                                        <a href="http://www.facebook.com/clinovo" style="line-height:170%;font-size:14px" target="_blank"><img alt="Facebook" src="http://clinovo.com/userfiles/fb.png" height="20" width="20"></a><span style="line-height:170%;font-size:14px"> </span><a href="http://www.linkedin.com/company/890144?trk=NUS_CMPY_TWIT" style="line-height:170%;font-family:inherit;font-size:14px;border:0px none;font-style:inherit;vertical-align:baseline" target="_blank"><img alt="Linkedin" src="http://clinovo.com/userfiles/lk.png" height="20" width="20"></a><span style="line-height:170%;font-size:14px"> </span><a href="http://twitter.com/Clinovo" style="line-height:170%;font-size:14px" target="_blank"><img alt="Twitter" src="http://clinovo.com/userfiles/tw.png" height="20" width="20"></a></p>


                        </td>
                </tr>
        </tbody>
</table><i style="font-family:'arial unicode ms',sans-serif;font-size:10px;text-align:justify">Confidentiality
 Notice: Unless expressly stated otherwise, this message is confidential
 and may be privileged. It is intended for the addressee(s) only. Access
 to this e-mail by anyone else is unauthorized. If you are not an 
addressee, please inform the sender immediately.</i></div>
</div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>