<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=windows-1252"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">Sina,<div><br></div><div>Thanks for the clarifications. You need to use a library that knows how to handle SPARQL federation, not all of them do. Jena ARQ supports it. What are you using ?</div><div><br></div><div>Manuel </div><div><br><div><div>On Mar 5, 2014, at 9:48 AM, Madani,Sina <<a href="mailto:AHMadani@mdanderson.org">AHMadani@mdanderson.org</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;"><div class="WordSection1" style="page: WordSection1;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">Thank you Manuel,<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">Yes, I understand your point for using SERVICE. I didnít include the portion of the query that points to my local triple store where it makes a federated query.<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">I wanted to make sure that from my local triple store (AllegroGraph) I can extract data from (remote) Bioportal sparql endpoint first and, if it is successful,  then connect Bioportal data (CUI) to my local CUIs to get the hierarchy/relationships between CUIs. I am not using Java.   Is this even possible?<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">Thanks!<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">Sina<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">P.S Thanks for the filter replacement. In my original code I was using a list of 10 codes and thatís why I used Filter<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 11pt; font-family: Wingdings; color: rgb(31, 73, 125);">J</span><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"><o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">Sina<o:p></o:p></span></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span></div><div><div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;"><span class="Apple-converted-space"> </span>manuelso [<a href="mailto:manuelso@stanford.edu">mailto:manuelso@stanford.edu</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Wednesday, March 05, 2014 11:20 AM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Madani,Sina<br><b>Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a> Support<br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: [bioontology-support] sparql endpoint<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">Hi Sina,<o:p></o:p></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">Your apikey seems to be fine.<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">I am not sure if you can combine FROM and SERVICE. But  you do not need to use a SERVICE query, SERVICE should be  used for federated resources and your query is targeting only one endpoint. Something like this would the job better and faster:<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div></div><div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">PREFIX xsd:  <<a href="http://www.w3.org/2001/XMLSchema" style="color: purple; text-decoration: underline;">http://www.w3.org/2001/XMLSchema#</a>><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">PREFIX skos:  <<a href="http://www.w3.org/2004/02/skos/core" style="color: purple; text-decoration: underline;">http://www.w3.org/2004/02/skos/core#</a>><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">SELECT ?x ?label<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">FROM <<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT" style="color: purple; text-decoration: underline;">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT</a>><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">WHERE<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">{<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">?x skos:notation '372030009'^^xsd:string;<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">skos:prefLabel ?label.<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">}<o:p></o:p></div></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">Notice how I replaced the filter.<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">If you are using Java, to run that query you can use, as a template, the code in here:<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><a href="https://github.com/ncbo/sparql-code-examples/blob/master/java/src/org/ncbo/stanford/sparql/examples/JenaARQTest.java" style="color: purple; text-decoration: underline;">https://github.com/ncbo/sparql-code-examples/blob/master/java/src/org/ncbo/stanford/sparql/examples/JenaARQTest.java</a><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">Manuel<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">PS: I hope you donít mind me cc-ing the support list so that this gets archived. I have removed your api key from the thread.<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><o:p> </o:p></div><div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">On Mar 5, 2014, at 7:48 AM, Madani,Sina <<a href="mailto:AHMadani@mdanderson.org" style="color: purple; text-decoration: underline;">AHMadani@mdanderson.org</a>> wrote:<o:p></o:p></div></div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><br><br><o:p></o:p></div><div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">Thank you Manuel,</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">One more question. I am trying to access your sparql endpoint from my local AllegroGraph store but am getting error (</span>Executing query failed: bad request Remote server returned error code 403.<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">) while executing below query.</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">Is it something wrong with my query or my apikey is not active? I want to link some of Bioportal SNOMED data to my local store data.</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">Thanks!</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">Sina</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">PREFIX rdfs: <<a href="http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#</span></a>></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">PREFIX snomed-term: <<a href="http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/?apikey=" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/?apikey=</span></a>APIKEY></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">PREFIX skos: <<a href="http://www.w3.org/2004/02/skos/core" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">http://www.w3.org/2004/02/skos/core#</span></a>></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">SELECT ?o ?label</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">FROM <<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT</span></a>></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">WHERE</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">{</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">SERVICE <<a href="http://sparql.bioontology.org/sparql/?apikey=A" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">http://sparql.bioontology.org/sparql/?apikey=A</span></a>PIKEY> { ?x skos:notation ?o;</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">                                                                                                                                                                                                                skos:prefLabel ?label.  </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">                                                                                                                                                                                                                  FILTER (str(?o) in ('372030009'))  }    </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);">}</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">Executing query failed: bad request Remote server returned error code 403.<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;"><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">From:</span></b><span class="apple-converted-space"><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;">manuelso [<a href="mailto:manuelso@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;">mailto:manuelso@stanford.edu</a>]<span class="apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Monday, March 03, 2014 5:59 PM<br><b>To:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Madani,Sina<br><b>Cc:</b><span class="apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;">support@bioontology.org</a><br><b>Subject:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Re: [bioontology-support] sparql endpoint</span><o:p></o:p></div></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"> <o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">Sina,<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"> <o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">That is correct, those are different SNOMED versions. We are working on a new version of the SPARQL endpoint that will be updated regularly. This release will probably happen in late March or early April. <o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"> <o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">Best,<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"> <o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">Manuel<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"> <o:p></o:p></div></div><div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"> <o:p></o:p></div></div><div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">On Mar 3, 2014, at 12:09 PM, Madani,Sina <<a href="mailto:AHMadani@mdanderson.org" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">AHMadani@mdanderson.org</span></a>> wrote:<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><br><br><br><o:p></o:p></div></div><div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">Hi</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">I am using Bioportalís  sparql endpoint to extract preLabel of some SNOMED concepts based on their codes or class names.</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">However, for some of the concepts no data is returned. If I do a regular Bioportal search (non sparql) for those concept codes (like the one shown in the query below)  I do get a result though.</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">Does this mean the sparql endpoint is pointing to a different version of SNOMED?</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">PREFIX rdfs: <<a href="http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#</span></a>></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">PREFIX snomed-term: <<a href="http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/</span></a>></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">PREFIX skos: <<a href="http://www.w3.org/2004/02/skos/core" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">http://www.w3.org/2004/02/skos/core#</span></a>></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">SELECT ?o ?label</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">FROM <<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT</span></a>></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">WHERE</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">{</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">    ?x skos:notation ?o;</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">       skos:prefLabel ?label.  </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">FILTER (str(?o) in ('450945008'))      </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">}</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">[no results]</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"><image001.png></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;"> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">Thanks!</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">Sina</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif;">_______________________________________________<br>bioontology-support mailing list<br><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">bioontology-support@lists.stanford.edu</span></a><br><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: purple; text-decoration: underline;"><span style="color: purple;">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</span></a></span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></blockquote></div><br></div></body></html>