<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Hello Sridevi,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">If you want to upload an ontology with local imports, you need to create a ZIP file that contains your main ontology file, along with all of the imported ontology files.  In addition, your ZIP file must have the same name as the main ontology
 file so that BioPortal knows which ontology is the one you’re trying to upload.  For example:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">my_ontology.zip (the ZIP file you create with the same name as your main ontology file)</div>
<div class="">- my_ontology.owl (the main ontology file)</div>
<div class="">- imported_ontology_1.owl</div>
<div class="">- imported_ontology_2.owl</div>
<div class="">- imported_ontology_3.owl</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">… etc.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Jennifer</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Sep 17, 2015, at 11:57 AM, sridevi polavaram <<a href="mailto:spolavar@gmail.com" class="">spolavar@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div class="">Hi All, <br class="">
</div>
 I need some guidance on how to upload ontologies that import from local files. Because, I believe my recent upload (<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NMOBR" target="_blank" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NMOBR</a>)
 didn't work due to imported ontologies. <br class="">
<br class="">
 Should i upload all local ontologies together? Instead of referring to local files i even tried importing directly from bioportal (e.g., 
<a href="http://purl.bioontology.org/ontology/NMOSP" target="_blank" class="">http://purl.bioontology.org/ontology/NMOSP )</a> but got an error!
<br class="">
<br class="">
</div>
<div class="">I would appreciate if you can provide some examples in this regard.
<br class="">
<br class="">
</div>
<div class="">Thank you<br class="">
</div>
<div class="">Sridevi<br class="">
<br class="">
<br class="">
</div>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="gmail_extra">
<div class="gmail_quote">On Wed, Sep 16, 2015 at 3:53 PM, sridevi polavaram <span dir="ltr" class="">
<<a href="mailto:spolavar@gmail.com" target="_blank" class="">spolavar@gmail.com</a>></span> wrote:<br class="">
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="">Hi Ray, <br class="">
</div>
 I have uploaded a new ontology of brain regions to bioportal at <a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NMOBR" target="_blank" class="">
http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NMOBR</a><br class="">
<br class="">
</div>
But the parsing didn't go through. Can you please help me figure out what is going on here? I am able to open this file and test in protege 4.3.
<br class="">
<br class="">
</div>
Thank you<span class=""><font color="#888888" class=""><br class="">
</font></span></div>
<span class=""><font color="#888888" class="">Sridevi<br class="">
<div class="">
<div class="">
<div class=""><br class="">
</div>
</div>
</div>
</font></span></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
<br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br class="">
https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support<br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>