<p dir="ltr">Got it! Would locally imported ontologies make auto complete search faster than Web imported ones?<br>
Thank you<br>
Sridevi</p>
<div class="gmail_quote">On Sep 21, 2015 1:59 PM, "Jennifer Leigh Vendetti" <<a href="mailto:vendetti@stanford.edu">vendetti@stanford.edu</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div style="word-wrap:break-word">
Hello Sridevi,
<div><br>
</div>
<div>If you want to upload an ontology with local imports, you need to create a ZIP file that contains your main ontology file, along with all of the imported ontology files.  In addition, your ZIP file must have the same name as the main ontology
 file so that BioPortal knows which ontology is the one you’re trying to upload.  For example:</div>
<div><br>
</div>
<div>my_ontology.zip (the ZIP file you create with the same name as your main ontology file)</div>
<div>- my_ontology.owl (the main ontology file)</div>
<div>- imported_ontology_1.owl</div>
<div>- imported_ontology_2.owl</div>
<div>- imported_ontology_3.owl</div>
<div><br>
</div>
<div>… etc.</div>
<div><br>
</div>
<div>Jennifer</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
<div>
<blockquote type="cite">
<div>On Sep 17, 2015, at 11:57 AM, sridevi polavaram <<a href="mailto:spolavar@gmail.com" target="_blank">spolavar@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br>
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div>Hi All, <br>
</div>
 I need some guidance on how to upload ontologies that import from local files. Because, I believe my recent upload (<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NMOBR" target="_blank">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NMOBR</a>)
 didn't work due to imported ontologies. <br>
<br>
 Should i upload all local ontologies together? Instead of referring to local files i even tried importing directly from bioportal (e.g., 
<a href="http://purl.bioontology.org/ontology/NMOSP" target="_blank">http://purl.bioontology.org/ontology/NMOSP )</a> but got an error!
<br>
<br>
</div>
<div>I would appreciate if you can provide some examples in this regard.
<br>
<br>
</div>
<div>Thank you<br>
</div>
<div>Sridevi<br>
<br>
<br>
</div>
<div>
<div>
<div>
<div class="gmail_extra">
<div class="gmail_quote">On Wed, Sep 16, 2015 at 3:53 PM, sridevi polavaram <span dir="ltr">
<<a href="mailto:spolavar@gmail.com" target="_blank">spolavar@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div>
<div>
<div>
<div>Hi Ray, <br>
</div>
 I have uploaded a new ontology of brain regions to bioportal at <a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NMOBR" target="_blank">
http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NMOBR</a><br>
<br>
</div>
But the parsing didn't go through. Can you please help me figure out what is going on here? I am able to open this file and test in protege 4.3.
<br>
<br>
</div>
Thank you<span><font color="#888888"><br>
</font></span></div>
<span><font color="#888888">Sridevi<br>
<div>
<div>
<div><br>
</div>
</div>
</div>
</font></span></div>
</blockquote>
</div>
<br>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br>
bioontology-support mailing list<br>
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" target="_blank">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br>
<a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" target="_blank">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>

</blockquote></div>