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<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
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<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div class="">Hello Joseph,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">When I navigate to the URL you sent, the NCIT ontology displays fine for me (see screen shot below).  Could you please be more specific about the error message you see? What is it?  Can you send us the text of the message and/or create a screen
 shot and include it in your response?</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Best,</div>
<div class="">Jennifer</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><img height="685" width="1264" apple-width="yes" apple-height="yes" apple-inline="yes" id="A9C8670F-CED0-44EE-B960-3345B22B0743" src="cid:C4B268E3-C18E-408D-9FB5-4930C4EFDE3B@stanford.edu" class=""></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Oct 7, 2015, at 8:30 AM, <a href="mailto:sirintrs@mskcc.org" class="">
sirintrs@mskcc.org</a> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="color: rgb(31, 73, 125);" class="">Hello, I was referred to your team, I believe certain parts of your site are down. Please see below. Tx.<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(242, 101, 41);" class="">S. Joseph Sirintrapun, M.D.</span></b><span style="font-family: Georgia, serif;" class=""><br class="">
Director of Pathology Informatics<br class="">
Assistant Attending<br class="">
Department of Pathology<br class="">
<br class="">
<b class="">Memorial Sloan Kettering Cancer Center</b><br class="">
1275 York Avenue Rm A515, New York, NY 10065<br class="">
T 212.639.2169   F 212.717.3203<br class="">
</span><span style="color: rgb(31, 73, 125);" class=""><a href="mailto:mcbeanc1@mskcc.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-family: Georgia, serif; color: rgb(41, 134, 226);" class="">sirintrs@mskcc.org</span></a><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div class="">
<div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;" class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;" class="">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;" class=""><span class="Apple-converted-space"> </span>Burns, Kevin (NIH/NCI) [C] [<a href="mailto:kevin.burns@nih.gov" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">mailto:kevin.burns@nih.gov</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Wednesday, October 07, 2015 10:15 AM<br class="">
<b class="">To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Sirintrapun, Sahussapont J./Pathology<br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>RE: is bioportal NCIT down?<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi Joseph<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
From the site is seems like the people to contact for this would be<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: windowtext;" class="">support@bioontology.org</span></a>.
 Please contact them about the site being down. Let me know if there is anything else I can do.<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thanks<br class="">
Kevin<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div class="">
<div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0in 0in;" class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;" class="">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;" class=""><span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:sirintrs@mskcc.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">sirintrs@mskcc.org</a><span class="Apple-converted-space"> </span>[<a href="mailto:sirintrs@mskcc.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">mailto:sirintrs@mskcc.org</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Wednesday, October 07, 2015 9:38 AM<br class="">
<b class="">To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>NCI CBIIT<br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>is bioportal NCIT down?<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I wasn’t sure who to ask, since there was not a help site.  But I’ve been trying to use the ontologies created in bioportal for oncology as part of an AACR GENIE project.  Is the site down by any chance?  I have gotten this error for several weeks now. The
 link is below.<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NCIT?p=classes&conceptid=root" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NCIT?p=classes&conceptid=root</a><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thanks and best. Joe<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(242, 101, 41);" class="">S. Joseph Sirintrapun, M.D.</span></b><span style="font-family: Georgia, serif;" class=""><br class="">
Director of Pathology Informatics<br class="">
Assistant Attending<br class="">
Department of Pathology<br class="">
<br class="">
<b class="">Memorial Sloan Kettering Cancer Center</b><br class="">
1275 York Avenue Rm A515, New York, NY 10065<br class="">
T 212.639.2169   F 212.717.3203<br class="">
</span><a href="mailto:mcbeanc1@mskcc.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-family: Georgia, serif; color: rgb(41, 134, 226);" class="">sirintrs@mskcc.org</span></a><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<p style="margin-right: 0in; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
=====================================================================<br class="">
<br class="">
Please note that this e-mail and any files transmitted from<br class="">
Memorial Sloan Kettering Cancer Center may be privileged, confidential,<br class="">
and protected from disclosure under applicable law. If the reader of<br class="">
this message is not the intended recipient, or an employee or agent<br class="">
responsible for delivering this message to the intended recipient,<br class="">
you are hereby notified that any reading, dissemination, distribution,<br class="">
copying, or other use of this communication or any of its attachments<br class="">
is strictly prohibited. If you have received this communication in<br class="">
error, please notify the sender immediately by replying to this message<br class="">
and deleting this message, any attachments, and all copies and backups<br class="">
from your computer.<o:p class=""></o:p></p>
</div>
<p style="margin-right: 0in; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
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<br class="">
Please note that this e-mail and any files transmitted from<br class="">
Memorial Sloan Kettering Cancer Center may be privileged, confidential,<br class="">
and protected from disclosure under applicable law. If the reader of<br class="">
this message is not the intended recipient, or an employee or agent<br class="">
responsible for delivering this message to the intended recipient,<br class="">
you are hereby notified that any reading, dissemination, distribution,<br class="">
copying, or other use of this communication or any of its attachments<br class="">
is strictly prohibited. If you have received this communication in<br class="">
error, please notify the sender immediately by replying to this message<br class="">
and deleting this message, any attachments, and all copies and backups<br class="">
from your computer.<br class="">
</p>
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">bioontology-support
 mailing list</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: purple; text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
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