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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">OK, there does seem to be some problem with the EHDA ontology. You are getting matches in this ontology and we aren’t able to retrieve the ontology information
 to flesh out the return values.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">We have known problems with 2 other ontologies with the same behavior. We are looking into it.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">The only workaround for this at the moment is to specify which ontologies you want to work with. Assuming you don’t need EHDA then it should probably be ok.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Ray<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><a name="_MailEndCompose"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></a></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> Fábio Guilherme [mailto:fabioguilherme1989@gmail.com]
<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, October 7, 2015 2:44 PM<br>
<b>To:</b> Ray Fergerson<br>
<b>Subject:</b> Re: [bioontology-support] problms with using java<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">its ramdom text, i used text= "Melanoma is a malignant tumor of melanocytes which are found predominantly in skin but also in the bowel and the eye." and text="<span style="font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:black">Objective
 Glycated hemoglobin</span>",<o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">For the parameters i only use the texr and let the annotator search in all the ontologies.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">the erros is this: <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">java.io.IOException: Server returned HTTP response code: 500 for URL:
<a href="http://data.bioontology.org/ontologies/EHDA/classes/http%3A%2F%2Fpurl.obolibrary.org%2Fobo%2FEHDA_9922">
http://data.bioontology.org/ontologies/EHDA/classes/http%3A%2F%2Fpurl.obolibrary.org%2Fobo%2FEHDA_9922</a><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">i checked if the entrys are equals to the browsers ones, they are. but after some entrys i get this error.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">its very strange.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">thank you for your quick answer<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">2015-10-07 22:24 GMT+01:00 Ray Fergerson <<a href="mailto:rayferg@stanford.edu" target="_blank">rayferg@stanford.edu</a>>:<o:p></o:p></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Can you provide a bit more information. Is there a particular piece of text that causes problems
 or is it random. What parameters are you sending to the annotator. What ontologies?</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Ray</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><a name="1504430a702aaf83__MailEndCompose"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"> </span></a><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> bioontology-support [mailto:<a href="mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu" target="_blank">bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu</a>]
<b>On Behalf Of </b>Fábio Guilherme<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, October 7, 2015 10:41 AM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:support@bioontology.org" target="_blank">support@bioontology.org</a><br>
<b>Subject:</b> [bioontology-support] problms with using java</span><o:p></o:p></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"> <o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">Good afternoon,<o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">i´m using your api and i´m having some problems when using your annotator with java.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">using your original code from github, without any changes of the code, only the api key, i'm having http 500 errors and sometimes filenotfound exceptions.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"> what can i do to solve this?<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">regards<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">Fábio Guilherme<o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
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