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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">This appears to be working now. Are you still seeing problems?<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Ray<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><a name="_MailEndCompose"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></a></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> Richard Worrall [mailto:richard@parachute.io]
<br>
<b>Sent:</b> Friday, October 9, 2015 3:21 AM<br>
<b>To:</b> Ray Fergerson<br>
<b>Cc:</b> support@bioontology.org<br>
<b>Subject:</b> Re: [bioontology-support] 504 Gateway Timeout for NCBITAXON<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">Hi Ray,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Thanks for looking at this, it was working shortly afterwards but appears to be failing again today. Would you let me know if there is a more preferable way to consume this taxonomy?<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Many Thanks,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">— Richard<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
</div>
<p><span style="color:#A0A0A8">On Friday, 2 October 2015 at 00:21, Ray Fergerson wrote:<o:p></o:p></span></p>
<blockquote style="border:none;border-left:solid windowtext 1.0pt;padding:0in 0in 0in 8.0pt;margin-left:0in;margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
<div>
<div>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Confirmed that this is not working. We will look into it. We have had trouble with NCBITaxon in the past because it has 1M classes and
 some nodes have tons of subclasses that cause us problems.</span><o:p></o:p></p>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"> </span><o:p></o:p></p>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Ray</span><o:p></o:p></p>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"> </span><o:p></o:p></p>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> bioontology-support [<a href="mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu">mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu</a>]
<b>On Behalf Of </b>Richard Worrall<br>
<b>Sent:</b> Thursday, October 1, 2015 4:44 AM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a><br>
<b>Subject:</b> [bioontology-support] 504 Gateway Timeout for NCBITAXON</span><o:p></o:p></p>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"> <o:p></o:p></p>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt">Hi Guys, <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt">I’m working on a project for Nature Publishing where we need to ingest the NCBITAXON ontology from the Bioportal API. I’ve been frequently running into 504 Gateway Timeout nginx errors when attempting to access URLs
 such as <a href="http://data.bioontology.org/ontologies/NCBITAXON/classes?page=1">http://data.bioontology.org/ontologies/NCBITAXON/classes?page=1</a> — I just wondered whether this is an issue you’re aware of, or if there is any workaround that you can suggest?<o:p></o:p></p>
</div>
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<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt">Thanks!<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt">-- <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt">Richard Worrall<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"><a href="http://parachute.io">parachute.io</a><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p style="margin:0in;margin-bottom:.0001pt"> <o:p></o:p></p>
</div>
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</div>
</blockquote>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
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