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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Hello,
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">I am trying to fetch the mappings between OMIM and HP. There are 216 pages, but after 60, all the pages are empty.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><a href="http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=HP,OMIM&format=json&page=73&apikey=eb58a898-adef-4af0-a0ac-b65473d4e7ad&display_links=false&">http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=HP,OMIM&format=json&page=73&apikey=eb58a898-adef-4af0-a0ac-b65473d4e7ad&display_links=false&</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Thanks!<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Wenwu Cui PhD<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Illumina Inc<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif">From:</span></b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif"> Cui, Wenwu
<br>
<b>Sent:</b> Tuesday, October 06, 2015 3:22 PM<br>
<b>To:</b> 'Ray Fergerson' <rayferg@stanford.edu>; support@bioontology.org<br>
<b>Subject:</b> RE: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from biocomputing<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Hi Ray,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">I am trying to fetch the mappings between SNOMED and HP. There are 108 pages, but after 38, all the pages are empty.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><a href="http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=HP,SNOMEDCT&format=json&page=45&apikey=eb58a898-adef-4af0-a0ac-b65473d4e7ad&display_links=false&">http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=HP,SNOMEDCT&format=json&page=45&apikey=eb58a898-adef-4af0-a0ac-b65473d4e7ad&display_links=false&</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Can you check that out?
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Thanks!<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Wenwu Cui  PhD<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Illumina Inc<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif">From:</span></b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif"> Ray Fergerson [<a href="mailto:rayferg@stanford.edu">mailto:rayferg@stanford.edu</a>]
<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, September 23, 2015 5:52 PM<br>
<b>To:</b> Cui, Wenwu <<a href="mailto:wcui@illumina.com">wcui@illumina.com</a>>;
<a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a><br>
<b>Subject:</b> RE: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from biocomputing<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><a href="http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=NCIT,FMA">http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=NCIT,FMA</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Ray<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><a name="_MailEndCompose"></a><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma",sans-serif">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma",sans-serif"> Cui, Wenwu [<a href="mailto:wcui@illumina.com">mailto:wcui@illumina.com</a>]
<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, September 23, 2015 5:04 PM<br>
<b>To:</b> Ray Fergerson; <a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a><br>
<b>Subject:</b> RE: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from biocomputing<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Hi Ray,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Thank you very much for your reply.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">I got that URL from the sample page of bioportal. Can you give me a right one to retrieve mappings from 2 different ontologies?
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">I tried the ones on
<a href="http://data.bioontology.org/documentation#Mapping">http://data.bioontology.org/documentation#Mapping</a> but was unable to retrieve anything.
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Thanks!<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Wenwu<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif">From:</span></b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif"> Ray Fergerson [<a href="mailto:rayferg@stanford.edu">mailto:rayferg@stanford.edu</a>]
<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, September 23, 2015 4:26 PM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a>; Cui, Wenwu <<a href="mailto:wcui@illumina.com">wcui@illumina.com</a>><br>
<b>Subject:</b> RE: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from biocomputing<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Where did you get the URL below. It doesn’t look correct at all. Is this on our web site somewhere?<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Documentation on the current way to get mappings is available at:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><a href="http://data.bioontology.org/documentation#Mapping">http://data.bioontology.org/documentation#Mapping</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Ray<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma",sans-serif">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma",sans-serif"> bioontology-support [<a href="mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu">mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu</a>]
<b>On Behalf Of </b><a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a><br>
<b>Sent:</b> Tuesday, September 15, 2015 4:46 PM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a>; <a href="mailto:wcui@illumina.com">
wcui@illumina.com</a><br>
<b>Subject:</b> [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from biocomputing<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p>Name: biocomputing <o:p></o:p></p>
<p>Email: <a href="mailto:wcui@illumina.com">wcui@illumina.com</a> <o:p></o:p></p>
<p>Location: <a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies">http://bioportal.bioontology.org/ontologies</a>
<o:p></o:p></p>
<p><br>
<strong>Feedback:</strong> <o:p></o:p></p>
<p>Dear Sir/Madam,<o:p></o:p></p>
<p>I am just wondering whether the mapping service is down. <o:p></o:p></p>
<p>I used the test URL from the sample but it generated a 'Not Found'<o:p></o:p></p>
<p><a href="http://data.bioontology.org/documentation/bioportal/virtual/mappings/ontologies?sourceontology=1104&targetontology=3016&pagesize=10&pagenum=1&apikey=eb58a898-adef-4af0-a0ac-b65473d4e7ad">http://data.bioontology.org/documentation/bioportal/virtual/mappings/ontologies?sourceontology=1104&targetontology=3016&pagesize=10&pagenum=1&apikey=eb58a898-adef-4af0-a0ac-b65473d4e7ad</a><o:p></o:p></p>
<p>Thanks!<o:p></o:p></p>
<p>Wenwu<o:p></o:p></p>
</div>
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</html>