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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">For reasons that I do not really understand the system now indicates that there are only 1799 mappings, exactly the number that would be returned in 37 pages
 of 50 each. It appears that the “blank pages” were “correct” and the overall count was wrong.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Ray<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><a name="_MailEndCompose"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></a></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> Cui, Wenwu [mailto:wcui@illumina.com]
<br>
<b>Sent:</b> Tuesday, October 6, 2015 3:22 PM<br>
<b>To:</b> Ray Fergerson; support@bioontology.org<br>
<b>Subject:</b> RE: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from biocomputing<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Hi Ray,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">I am trying to fetch the mappings between SNOMED and HP. There are 108 pages, but after 38, all the pages are empty.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><a href="http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=HP,SNOMEDCT&format=json&page=45&apikey=eb58a898-adef-4af0-a0ac-b65473d4e7ad&display_links=false&">http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=HP,SNOMEDCT&format=json&page=45&apikey=eb58a898-adef-4af0-a0ac-b65473d4e7ad&display_links=false&</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Can you check that out?
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Thanks!<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Wenwu Cui  PhD<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Illumina Inc<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""> Ray Fergerson [<a href="mailto:rayferg@stanford.edu">mailto:rayferg@stanford.edu</a>]
<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, September 23, 2015 5:52 PM<br>
<b>To:</b> Cui, Wenwu <<a href="mailto:wcui@illumina.com">wcui@illumina.com</a>>;
<a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a><br>
<b>Subject:</b> RE: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from biocomputing<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><a href="http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=NCIT,FMA">http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=NCIT,FMA</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Ray<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> Cui, Wenwu [<a href="mailto:wcui@illumina.com">mailto:wcui@illumina.com</a>]
<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, September 23, 2015 5:04 PM<br>
<b>To:</b> Ray Fergerson; <a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a><br>
<b>Subject:</b> RE: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from biocomputing<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Hi Ray,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Thank you very much for your reply.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">I got that URL from the sample page of bioportal. Can you give me a right one to retrieve mappings from 2 different ontologies?
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">I tried the ones on
<a href="http://data.bioontology.org/documentation#Mapping">http://data.bioontology.org/documentation#Mapping</a> but was unable to retrieve anything.
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Thanks!<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Wenwu<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif""> Ray Fergerson [<a href="mailto:rayferg@stanford.edu">mailto:rayferg@stanford.edu</a>]
<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, September 23, 2015 4:26 PM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a>; Cui, Wenwu <<a href="mailto:wcui@illumina.com">wcui@illumina.com</a>><br>
<b>Subject:</b> RE: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from biocomputing<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Where did you get the URL below. It doesn’t look correct at all. Is this on our web site somewhere?<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Documentation on the current way to get mappings is available at:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><a href="http://data.bioontology.org/documentation#Mapping">http://data.bioontology.org/documentation#Mapping</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Ray<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> bioontology-support [<a href="mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu">mailto:bioontology-support-bounces@lists.stanford.edu</a>]
<b>On Behalf Of </b><a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a><br>
<b>Sent:</b> Tuesday, September 15, 2015 4:46 PM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a>; <a href="mailto:wcui@illumina.com">
wcui@illumina.com</a><br>
<b>Subject:</b> [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from biocomputing<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p>Name: biocomputing <o:p></o:p></p>
<p>Email: <a href="mailto:wcui@illumina.com">wcui@illumina.com</a> <o:p></o:p></p>
<p>Location: <a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies">http://bioportal.bioontology.org/ontologies</a>
<o:p></o:p></p>
<p><br>
<strong>Feedback:</strong> <o:p></o:p></p>
<p>Dear Sir/Madam,<o:p></o:p></p>
<p>I am just wondering whether the mapping service is down. <o:p></o:p></p>
<p>I used the test URL from the sample but it generated a 'Not Found'<o:p></o:p></p>
<p><a href="http://data.bioontology.org/documentation/bioportal/virtual/mappings/ontologies?sourceontology=1104&targetontology=3016&pagesize=10&pagenum=1&apikey=eb58a898-adef-4af0-a0ac-b65473d4e7ad">http://data.bioontology.org/documentation/bioportal/virtual/mappings/ontologies?sourceontology=1104&targetontology=3016&pagesize=10&pagenum=1&apikey=eb58a898-adef-4af0-a0ac-b65473d4e7ad</a><o:p></o:p></p>
<p>Thanks!<o:p></o:p></p>
<p>Wenwu<o:p></o:p></p>
</div>
</body>
</html>