<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p><span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; line-height: normal;">Hello everyone,</span></p>
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; line-height: normal;"><br>
</div>
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; line-height: normal;">We’re pleased to announce a new release of BioPortal (version 4.22)! Highlights of this release are included below, and in the release notes [1].</div>
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; line-height: normal;"><br>
</div>
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; line-height: normal;">Also, I’d like to introduce myself. I’m John Graybeal, the new lead for BioPortal, replacing Ray Fergerson. I’m filling tall shoes, but Ray did a great handoff and the BioPortal support
 team is great, so I’m looking forward to providing continued high value with the BioPortal services.</div>
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; line-height: normal;"><br>
</div>
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; line-height: normal;">If you have concerns, we encourage you as always to make requests via the <a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a> email. And if you have something that isn’t
 appropriate for the list, you can email me directly. (If it looks like a routine request, I’ll forward it to the list, so please indicate if you don’t want that.) </div>
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; line-height: normal;"><br>
</div>
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; line-height: normal;">Thanks for using BioPortal and letting us know your thoughts. And now, back to our list of improvements.</div>
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; line-height: normal;">
<div class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<b class="">Enhancements</b><br class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">* New functionality at the REST API level in support of our collaboration with the CEDAR [2] project:</div>
<div class="">   * Added the ability to search for, and retrieve all value sets. (A value set is an unstructured collection of terms.)</div>
<div class="">   * Implemented search for value set items [3].</div>
<div class="">   * Implemented search for ontology classes and value set items [4].</div>
<div class="">   * Added the ability to exclude value set collections from search [5].</div>
<div class="">   * Added the ability to search for value set values across all value sets in an ontology.</div>
<div class="">* Clicking the Add Comment and/or Add Proposal buttons in the Notes sections for ontologies will navigate unauthenticated users to the login page.</div>
<div class="">
<div class="">* Ontologies are now sortable by creation date on the Admin page.</div>
</div>
<br class="">
<div class=""><b class="">Bug Fixes</b></div>
<div class=""><br class="">
<div class="">* Fixed an issue that caused Projects page load times in excess of 3 minutes.<br class="">
</div>
<div class="">* Fixed an issue that caused the UI to go blank after selecting the root node of the CCO ontology.<br class="">
</div>
<div class="">* Admin page: the ontologies table now refreshes after deleting an ontology.<br class="">
</div>
<div class="">* Fixed an issue that caused a 404 error when trying to view the DINTO ontology.<br class="">
</div>
<div class="">* Fixed an inconsistency in the metadata for the CHMO ontology that caused the parsing process to fail.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div class="">[1] <a href="http://www.bioontology.org/wiki/index.php/BioPortal_Release_Notes" title="http://www.bioontology.org/wiki/index.php/BioPortal_Release_Notes
Cmd+Click or tap to follow the link">http://www.bioontology.org/wiki/index.php/BioPortal_Release_Notes</a> </div>
<div class="">[2] <a href="http://www.metadatacenter.org/" class="">http://www.metadatacenter.org/</a></div>
<div class="">[3] <a href="http://data.bioontology.org/search?q=melanoma&also_search_provisional=true&valueset_exclude_roots=true&ontology_types=VALUE_SET_COLLECTION" class="">http://data.bioontology.org/search?q=melanoma&also_search_provisional=true&valueset_exclude_roots=true&ontology_types=VALUE_SET_COLLECTION</a></div>
<div class="">[4] <a href="http://data.bioontology.org/search?q=melanoma&also_search_provisional=true&valueset_exclude_roots=true" class="">http://data.bioontology.org/search?q=melanoma&also_search_provisional=true&valueset_exclude_roots=true</a></div>
<div class="">[5] <a href="http://data.bioontology.org/search?q=melanoma&ontology_types=ONTOLOGY&also_search_provisional=true" class="">http://data.bioontology.org/search?q=melanoma&ontology_types=ONTOLOGY&also_search_provisional=true</a></div>
</div>
</div>
</div>
<div id="AppleMailSignature">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
========================</div>
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<br>
</div>
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div class="" style="line-height: normal;">John Graybeal</div>
<div class="" style="line-height: normal;">Technical Program Manager</div>
<div class="" style="line-height: normal;">Center for Expanded Data Annotation and Retrieval /+/ NCBO BioPortal</div>
<div class="" style="line-height: normal;">Stanford Center for Biomedical Informatics Research<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>