<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Shaker,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">An update to the previous information — I can see that both ontology uploads have failed to parse correctly. </div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I can’t tell if this is an error with the file or our system, but I offer the following naive observation: When I try to open the file with Protege (5 beta-17), it reports a parsing error at the beginning of the file. Others on the list may be
 able to help further.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">John</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Shaker,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Your ontology is visible now in BioPortal.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Yes, it usually does take some time for an upload to become visible in BioPortal — we do a number of indexing and other activities before finally making it public, usually it is fully visible by the next morning.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I see that while I can download the ontology, it is still being indexed. This may just be a matter of time — the ontology is somewhat large at 3MB, and the indexing and other processes can take up to a day.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">If it is not indexed within another day, it may have to be reviewed by our ontology experts, who will be available after the new year. (Also,  I’m not sure how common the use of functional OWL syntax is for BioPortal imports — so you could try
 conversion to another OWL syntax just to see if that works better. If you do, realize a day or two may be required again to complete all the upload-related processes.)</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">John</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Dec 19, 2015, at 11:51 PM, <a href="mailto:support@bioontology.org" class="">
support@bioontology.org</a> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="">
<p class="">Name: shaker </p>
<p class="">Email: <a href="mailto:shaker_elsapagh@yahoo.com" class="">shaker_elsapagh@yahoo.com</a>
</p>
<p class="">Location: <a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/DDO" class="">
http://bioportal.bioontology.org/ontologies/DDO</a> </p>
<p class=""><br class="">
<strong class="">Feedback:</strong> </p>
<p class="">Thank you for accepting my ontology in your portal. Please I can not browse my ontology until now (<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/DDO" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/DDO</a>). Are there any problem, or
 it will take some times to be available on the BioPortal?</p>
<p class="">Thank you very much.</p>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<div class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>