<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Hello Chao-Kung,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Feb 13, 2017, at 7:59 AM, <a href="mailto:support@bioontology.org" class="">
support@bioontology.org</a> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="">
<p class="">Name: Chao-Kung Chen </p>
<p class="">Email: <a href="mailto:ckchen@ebi.ac.uk" class="">ckchen@ebi.ac.uk</a>
</p>
<p class="">Location: http%3A%2F%<a href="http://2Fbioportal.bioontology.org" class="">2Fbioportal.bioontology.org</a>%2Fontologies%2FMESH
</p>
<p class=""><br class="">
<strong class="">Feedback:</strong> </p>
<p class="">Dear support desk:</p>
<p class="">Our group from the European bioinformatics institute is trying to map MESH terms to mammalian phenotype ontology.
<br class="">
It is exciting to find that BioPortal has already done lots of stuff on this kind of mapping.
<br class="">
I wonder if there is a flatfile that users can download?</p>
<div class=""><br class="">
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
<div>Currently we don’t make mappings available as a flat file download.  You can read about the reason for this in a previous post on our support list:</div>
<div><br class="">
</div>
<div><a href="http://ncbo-support.2288202.n4.nabble.com/bioontology-support-Downloading-Mappings-in-Bulk-td4655255.html#a4655269" class="">http://ncbo-support.2288202.n4.nabble.com/bioontology-support-Downloading-Mappings-in-Bulk-td4655255.html#a4655269</a></div>
<div><br class="">
</div>
<div>You can however, retrieve all mappings between the MESH and MP ontologies via our REST API, e.g.:</div>
<div><br class="">
</div>
<div><a href="http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=MESH,MP" class="">http://data.bioontology.org/mappings?ontologies=MESH,MP</a></div>
<div><br class="">
</div>
<div>The results default to JSON format.  If you want XML, you can use the “format" query string parameter.  Our REST API is documented here:</div>
<div><br class="">
</div>
<div><a href="http://data.bioontology.org/documentation" class="">http://data.bioontology.org/documentation</a></div>
<div><br class="">
</div>
<div>Kind regards,</div>
<div>Jennifer</div>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>