<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Rakesh,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">There are a number of circumstances in which BioPortal can not effectively display the ontology tree. Given finite development time, we choose in those circumstances to avoid presenting a display which may be poorly formatted, difficult to use,
 or incorrect.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Obviously we'd like to to meet all needs as effectively as possible, but we recognize there are other tools that are meant explicitly for viewing and editing ontologies, and so we do not try to provide every feature for working with ontologies.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I am sorry we have not covered this particular situation, and we will look for an opportunity to do so in the future.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">John</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On May 6, 2017, at 12:23 PM, Rakesh Nagarajan <<a href="mailto:rakesh@pieriandx.com" class="">rakesh@pieriandx.com</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">Hello,
<div class="">     I got the above response to the HPO ontology. How can you list an ontology on your site and not have it loaded appropriately to browse it?</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks,</div>
<div class="">Rakesh</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br class="">
<div class="gmail_quote">On Fri, May 5, 2017 at 1:51 PM, Vincent Emonet <span dir="ltr" class="">
<<a href="mailto:vincent.emonet@lirmm.fr" target="_blank" class="">vincent.emonet@lirmm.fr</a>></span> wrote:<br class="">
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div text="#000000" bgcolor="#FFFFFF" class="">
<p class="">Hi,</p>
<p class="">It's due to the fact that no roots concepts have been found for this ontology. BioPortal needs those roots concepts to draw the Class tree.<br class="">
</p>
<p class="">We can see that the root classes of an ontology in the REST API: <a class="m_-6195761022305173644moz-txt-link-freetext" href="http://data.bioontology.org/ontologies/HP/classes/roots" target="_blank">
http://data.bioontology.org/<wbr class="">ontologies/HP/classes/roots</a><br class="">
</p>
Have a good day,<br class="">
<br class="">
Vincent
<div class="">
<div class="h5"><br class="">
<br class="">
<div class="m_-6195761022305173644moz-cite-prefix">On 05/05/2017 08:05, Rakesh Nagarajan wrote:<br class="">
</div>
</div>
</div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">
<div class="h5">
<div dir="ltr" class="">Hello,
<div class="">     I am trying to access <a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/HP?p=classes&conceptid=root" target="_blank" class="">http://bioportal.<wbr class="">bioontology.org/ontologies/HP?<wbr class="">p=classes&conceptid=root</a>. However,
 there is an error stating:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<h1 class="">The page you are looking for wasn't found. Please try again.</h1>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Please fix and let me know when I can access this page.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks,</div>
<div class="">Rakesh</div>
<div class=""><br class="">
</div>
-- <br class="">
<div class="m_-6195761022305173644gmail_signature">
<div dir="ltr" class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<b style="color:rgb(80,0,80);font-family:calibri,sans-serif;font-size:15px" class=""><i class=""><span style="font-size:8.5pt;font-family:arial,sans-serif" class="">The materials in this email are private and may contain Protected Health Information. If you
 are not the intended recipient, be advised that any unauthorized use, disclosure, copying, distribution or the taking of any action in reliance on the contents of this information is strictly prohibited. If you have received this email in error, please immediately
 notify the sender via telephone or return email.</span></i></b><br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
<br class="">
<fieldset class="m_-6195761022305173644mimeAttachmentHeader"></fieldset> <br class="">
</div>
</div>
<pre class="">______________________________<wbr class="">_________________
bioontology-support mailing list
<a class="m_-6195761022305173644moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" target="_blank">bioontology-support@lists.<wbr class="">stanford.edu</a>
<a class="m_-6195761022305173644moz-txt-link-freetext" href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" target="_blank">https://mailman.stanford.edu/<wbr class="">mailman/listinfo/bioontology-<wbr class="">support</a>
</pre>
</blockquote>
<br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
<br clear="all" class="">
<div class=""><br class="">
</div>
-- <br class="">
<div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">
<div dir="ltr" class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<b style="color:rgb(80,0,80);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px" class=""><i class=""><span style="font-size:8.5pt;font-family:Arial,sans-serif" class="">The materials in this email are private and may contain Protected Health Information. If you
 are not the intended recipient, be advised that any unauthorized use, disclosure, copying, distribution or the taking of any action in reliance on the contents of this information is strictly prohibited. If you have received this email in error, please immediately
 notify the sender via telephone or return email.</span></i></b><br class="">
</div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br class="">
https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support<br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
<div class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
========================
<div class="">John Graybeal</div>
<div class="">Technical Program Manager</div>
<div class="">Center for Expanded Data Annotation and Retrieval /+/ NCBO BioPortal</div>
<div class="">Stanford Center for Biomedical Informatics Research<br class="">
650-736-1632  <br class="">
skype: graybealski<br class="">
<br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>