<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Hi Marvin,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Jul 31, 2017, at 5:54 AM, <a href="mailto:support@bioontology.org" class="">
support@bioontology.org</a> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="">
<p class="">Name: Marvin Martens </p>
<p class="">Email: <a href="mailto:marvin.martens@maastrichtuniversity.nl" class="">
marvin.martens@maastrichtuniversity.nl</a> </p>
<p class="">Location: http%3A%2F%<a href="http://2Fbioportal.bioontology.org" class="">2Fbioportal.bioontology.org</a>%2Fontologies%2FPW%3Fp%3Dclasses%26conceptid%3Dhttp%253A%252F%<a href="http://252Fpurl.obolibrary.org" class="">252Fpurl.obolibrary.org</a>%252Fobo%252FPW_0000001
</p>
<p class=""><br class="">
<strong class="">Feedback:</strong> </p>
<p class="">Dear BioPortal group, <br class="">
I am working on pathways on WikiPathways, which uses your Pathway ontology. However, I work on a type of pathways that is not in there, and is different: Adverse Outcome Pathways. They are pathways that cover multiple cell types, multiple processes, and often
 multiple biological levels. I think it would be a great addition if we could work on an ontology for this kind of patway, as it is a growing concept and soon many more of these pathways will be made in wikipathways. Could you tell me what is the best thing
 to do? What are the possibilities? <br class="">
</p>
</div>
</div>
</blockquote>
<div><br class="">
</div>
<div>I’m not sure I can offer you much in the way of assistance. This support list is focused around addressing questions / issues with the BioPortal software, and/or parsing issues that arise when ontologies are submitted. You might want to consider contacting
 the authors of the PW ontology (their contact information is listed on the ontology summary page [1]), as they may have ideas about how to extend their ontology, or create a related one.</div>
<div><br class="">
</div>
<div>Alternatively, if you’re looking for assistance with how to model the concepts in your domain, you could try posting a message on the support list for the Protege ontology editing environment [2]. Their list has a large number of subscribers, many of whom
 are familiar with best practices when building ontologies.</div>
<div><br class="">
</div>
<div>Kind regards,</div>
<div>Jennifer</div>
<div><br class="">
</div>
<div>[1] <a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/PW" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/PW</a></div>
<div>[2] <a href="http://protege.stanford.edu/support.php" class="">http://protege.stanford.edu/support.php</a></div>
</div>
</div>
</body>
</html>