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</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hello Sebastien,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I looked at the ontology you mention below in BioPortal. We are currently serving the ontology in OWL format. I navigated to the home page that’s listed in the Details pane (<a href="http://ctep.cancer.gov/protocolDevelopment/electronic_applications/ctc.htm" class="">http://ctep.cancer.gov/protocolDevelopment/electronic_applications/ctc.htm</a>).
 It’s unclear to me whether or not NCI has made version 5 available in OWL format (BioPortal doesn’t consume xls format).</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I did some googling and ended up here:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><a href="https://evs.nci.nih.gov/ftp1/CTCAE/About.html" class="">https://evs.nci.nih.gov/ftp1/CTCAE/About.html</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I can see an OWL distribution for version 4.03, but not 5.0. Do you happen to know who at NCI we could contact to find out more about whether they plan to publish the ontology in OWL? If it’s available somewhere in OWL format, we’re certainly
 willing to upload.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Kind regards,</div>
<div class="">Jennifer</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Mar 14, 2018, at 8:37 AM, Estaque, Sebastien <<a href="mailto:Sebastien_Estaque@URMC.Rochester.edu" class="">Sebastien_Estaque@URMC.Rochester.edu</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi,<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
This is concerning the CTCAE Ontology. Right now only v4 is available. NCI has made v5 available at the end of 2017 and plans to enforce its use for new research on April 1st 2018. We use BioPortal's CTCAE Ontology through REDCap. Are there any plans to upload
 v5 on BioPortal and if so how soon will this be done?<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thank you,<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="MsoNormal" align="center" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; text-align: center;">
<b class=""><span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif; color: rgb(23, 54, 93);" class="">
<hr size="2" width="100%" align="center" class="">
</span></b></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="font-size: 9pt; font-family: "Lucida Calligraphy";" class="">Sebastien Estaque</span></b><b class=""><span style="font-size: 9pt; font-family: "Lucida Calligraphy";" class=""><o:p class=""></o:p></span></b></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif; color: rgb(64, 64, 64);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<i class=""><span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif; color: rgb(89, 89, 89);" class="">Lead Analyst Programmer</span></i><span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif; color: rgb(89, 89, 89);" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="font-size: 9pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">University of Rochester Medical Center<o:p class=""></o:p></span></b></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="font-size: 9pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">URCC NCORP Research Base<o:p class=""></o:p></span></b></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 9pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">Saunders Research Building<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">265 Crittenden Blvd, Room 2-214<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">CU 420658<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">Rochester, NY  14642-420658<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">585-275-2044 (P)</span><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class=""></span><span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">585-461-5601 (F)<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">Confidentiality Notice: This electronic message, including any attachments, may contain information that is confidential and/or legally privileged.  The information
 is intended only for the use of the individual(s) and entity named as recipients in the message.  Any unauthorized review, use, disclosure, or distribution of the information contained in this message and its attachments is prohibited.  If you are not an intended
 recipient, or the employee or agent responsible for delivering the message to the intended recipient, please notify the sender immediately and delete the material from any computer or shred any printed copy.  Do not deliver, distribute or copy this message
 and do not disclose its contents or take any action on the information it contains.<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 8pt; font-family: "Times New Roman", serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">If this email is not intended for you, please notify us immediately by telephone 585-275-5513.</span><span style="font-size: 8pt;" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">bioontology-support
 mailing list</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
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