<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>Yes, Jennifer that is the ontology I want. Thank you very much for your valuable information. I will try to convert csv file to that formats. If I can, I will let you know</p>
<p><br>
</p>
<p>Best</p>
<p><br>
</p>
<p>Nedim</p>
<br>
<br>
<div style="color: rgb(0, 0, 0);">
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Jennifer Leigh Vendetti <vendetti@stanford.edu><br>
<b>Sent:</b> Wednesday, March 14, 2018 2:50 PM<br>
<b>To:</b> NCBO User Support<br>
<b>Cc:</b> Durmus, Nedim<br>
<b>Subject:</b> Re: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from Nedim Durmus</font>
<div> </div>
</div>
<div>Hello Nedim,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Are you referring to this ontology:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__www.who.int_classifications_icd_adaptations_oncology_en_&d=DwMGaQ&c=j5oPpO0eBH1iio48DtsedbOBGmuw5jHLjgvtN2r4ehE&r=wXO704yhA1hFGbS2NYYaxvdsCN_fKvBJ0t7ZQCYdkRs&m=ZHiunZlrcAdrzdZXGoBHWRVMwn8lVZt5sPEMKdocDlk&s=mNti3YiSR6foSs4ogL4g7otnkSuDbFYAm_XqV7Orixk&e=" class="">http://www.who.int/classifications/icd/adaptations/oncology/en/</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">?</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">If so, we’ve had a prior request to upload it to BioPortal. We were unable to do so because it doesn’t appear that they publish it in any format that BioPortal handles. BioPortal consumes ontologies in OWL, OBO, or SKOS format. According to the
 above web page, the only format available is CSV database files. If you’re aware of a version of the ontology in a format that BioPortal accepts, we’d be happy to help you try and get it submitted.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Kind regards,</div>
<div class="">Jennifer</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Mar 9, 2018, at 11:35 AM, <a href="mailto:support@bioontology.org" class="">
support@bioontology.org</a> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="">
<p class="">Name: Nedim Durmus </p>
<p class=""><a href="mailto:nedim.durmus@nyumc.org" class="">Email: nedim.durmus@nyumc.org</a>
</p>
<p class="">Location: http%3A%2F%<a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__2Fbioportal.bioontology.org&d=DwMGaQ&c=j5oPpO0eBH1iio48DtsedbOBGmuw5jHLjgvtN2r4ehE&r=wXO704yhA1hFGbS2NYYaxvdsCN_fKvBJ0t7ZQCYdkRs&m=ZHiunZlrcAdrzdZXGoBHWRVMwn8lVZt5sPEMKdocDlk&s=sQhJaz7B81vgzVvQ3jsqS1H3yjvqotn2N1vsveYf1hY&e=" class="">2Fbioportal.bioontology.org</a>%2F
</p>
<p class=""><br class="">
<strong class="">Feedback:</strong> </p>
<p class="">Hi, <br class="">
I am a professional research scientist at New York University. We are now trying to create a database for cancer registry in REDCap. First of all, I want to thank you for this excellent software. It is very useful, wonderful to create databases and also very
 easy. Thank you very very much for making such a software. </p>
<p class="">In our database, we want to add a field fro ICD-O-3 codes (International Classification of Diseases for Oncology) which is the third edition of this classification published by World Health Organization. But in your biomedical ontology, this classification
 does not exist. Can I add this classification to the ontology list or can you add this to the list?
</p>
<p class="">I think it will also be very helpful to the other people because it is mostly used in cancer research. If you want I have the excel list of this ontology. I am attaching the excel file that you can have a look.</p>
<p class="">Best</p>
<p class="">Nedim Durmus</p>
<div class=""><br class="webkit-block-placeholder">
</div>
</div>
_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br class="">
https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support<br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
<p><br>
------------------------------------------------------------<br>
This email message, including any attachments, is for the sole use of the intended recipient(s) and may contain information that is proprietary, confidential, and exempt from disclosure under applicable law. Any unauthorized review, use, disclosure, or distribution is prohibited. If you have received this email in error please notify the sender by return email and delete the original message. Please note, the recipient should check this email and any attachments for the presence of viruses. The organization accepts no liability for any damage caused by any virus transmitted by this email.<br>
=================================</p></body>
</html>