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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hi Michael,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I noticed one error. The name/title of the <a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN">
http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN</a> ontology needs to be updated:  <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Anatomic Ontology for <s><span style="color:red">Alveolar Development and Maturation in the Mouse</span></s><span style="color:red"> Human
</span>Lung <span style="color:red">Maturation</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Thank you!<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Helen<o:p></o:p></p>
<div>
<div>
<blockquote style="margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<div>
<p class="MsoNormal"><b>From:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Michael Dorf [<a href="mailto:mdorf@stanford.edu"><span style="color:purple">mailto:mdorf@stanford.edu</span></a>]<span class="apple-converted-space"> </span><br>
<b>Sent:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Wednesday, March 28, 2018 12:39 PM<br>
<b>To:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org"><span style="color:purple">hpan@rti.org</span></a>><br>
<b>Cc:</b><span class="apple-converted-space"> </span>John Graybeal <<a href="mailto:jgraybeal@stanford.edu"><span style="color:purple">jgraybeal@stanford.edu</span></a>>;<span class="apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org"><span style="color:purple">support@bioontology.org</span></a><br>
<b>Subject:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Re: [bioontology-support] problem with ontology submission - please help!<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Hi Pan,<span class="apple-converted-space"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">I’ve re-submitted your ontology under the correct acronym, LUNGMAP-HUMAN. I’ve also deleted all the extraneous records (LUNGMAP-, LUNGMAP-HUMAN1, LUNGMAP_HUMAN, LUNGMAP_HUMAN2, LUNGMAP--HUMAN). Your ontology is now browsable here:<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN"><span style="color:purple">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN</span></a> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Please contact us if you run into further issues.<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Thank you for using BioPortal!<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Michael<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif">----------------------------------------------------<br>
Michael Dorf<br>
Chief Software Architect<br>
The National Center for Biomedical Ontology<br>
Stanford Biomedical Informatics Research<br>
</span><a href="mailto:mdorf@stanford.edu"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;color:purple">mdorf@stanford.edu</span></a><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif"><br>
O: 650-723-0357<br>
M: 650-995-4374<br>
----------------------------------------------------</span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><br>
<br>
<o:p></o:p></p>
</div>
<blockquote style="margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">On Mar 28, 2018, at 7:32 AM, Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org"><span style="color:purple">hpan@rti.org</span></a>> wrote:<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Hi John,<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Thank you for helping me creating the<span class="apple-converted-space"> </span><a href="http://purl.bioontology.org/ontology/LUNGMAP-HUMAN1" target="_blank"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica Neue",serif;color:#23527C;background:white">http://purl.bioontology.org/ontology/LUNGMAP-HUMAN1</span></a>.
 It looks good and I can access it!<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">I can find the 5 other “unsuccessful” attempts (highlighted below) when I search for “lungmap” at the public site, but I can’t delete them before I login in, and I can’t find them after I log in. would you please help me delete these 5,
 and change the name of the successful submission you did above by removing the “1” at the end?<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><image002.jpg><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">I greatly appreciate your help!<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Helen<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><b>From:</b><span class="apple-converted-space"> </span>John Graybeal [<a href="mailto:jgraybeal@stanford.edu"><span style="color:purple">mailto:jgraybeal@stanford.edu</span></a>]<span class="apple-converted-space"> </span><br>
<b>Sent:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Saturday, March 24, 2018 5:51 PM<br>
<b>To:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org"><span style="color:purple">hpan@rti.org</span></a>><br>
<b>Cc:</b><span class="apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org"><span style="color:purple">support@bioontology.org</span></a><br>
<b>Subject:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Re: [bioontology-support] problem with ontology submission - please help!<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
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<div>
<p class="MsoNormal">Helen,<span class="apple-converted-space"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
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<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
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<div>
<p class="MsoNormal">I have submitted your OWL file under the LUNGMAP-HUMAN1 acronym, and got the results below [1]. I did not get any error messages.<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
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<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Note that you probably will want to redo your submission under the same acronym but leaving off the '1'. Once that is successful, we can delete this ontology.<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">I am wondering when you attempted your submissions. If you submitted it before late Thursday, we were having problems with the system up until that point, and these were likely interfering with your efforts.<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">When you try to submit under LUNGMAP-HUMAN, please keep track of the Add Submission process as you go, and let us know if there are any issues.<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
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<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
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<div>
<div>
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<p class="MsoNormal">Thanks,<o:p></o:p></p>
</div>
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<div>
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<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
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<div>
<div>
<p class="MsoNormal">John<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
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<div>
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<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
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<p class="MsoNormal">[1]  Results of submission:<o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<blockquote style="margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:7.5pt;background:white;box-sizing: border-box;font-variant-ligatures: normal;orphans: 2;widows: 2;background-position:initial initial;background-repeat:initial initial">
<span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica Neue",serif;color:#333333">Thank you for submitting your ontology to BioPortal.</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:7.5pt;background:white;box-sizing: border-box;font-variant-ligatures: normal;orphans: 2;widows: 2;background-position:initial initial;background-repeat:initial initial">
<span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica Neue",serif;color:#333333">We will now put your ontology in the queue to be processed. Please keep in mind that it may take up to several hours before BioPortal users will be able to explore and search your
 ontology.</span><o:p></o:p></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica Neue",serif;color:#333333">When your ontology is ready for viewing, it will be available here: <br>
</span><a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN1"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica Neue",serif;color:#337AB7;text-decoration:none">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN1</span></a><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica Neue",serif;color:#333333">If you have any questions or problems, please email the BioPortal support team at </span><a href="mailto:support@bioontology.org"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica Neue",serif;color:#337AB7;text-decoration:none">support@bioontology.org</span></a><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
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<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
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</div>
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<blockquote style="margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">On Mar 24, 2018, at 7:38 PM, Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org"><span style="color:purple">hpan@rti.org</span></a>> wrote:<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
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<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
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<div>
<p class="MsoNormal">Hello,<o:p></o:p></p>
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<div>
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<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
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</div>
</div>
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<div>
<p class="MsoNormal">Hello, I tried several times to submit an ontology:<o:p></o:p></p>
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</div>
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<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
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</div>
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<div>
<p class="MsoNormal">initial submission always got<span class="apple-converted-space"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
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<p class="MsoNormal"><image002.jpg><o:p></o:p></p>
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</div>
<div>
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<div>
<p class="MsoNormal">Another try always got<span class="apple-converted-space"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
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<p class="MsoNormal"><image004.jpg><o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
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</div>
</div>
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<div>
<p class="MsoNormal">It repeats that when I tried different name/acronyms on different web browsers.<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
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<div>
<p class="MsoNormal">Would you please help me create the ontology?<span class="apple-converted-space"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Name:<span class="apple-converted-space"> </span><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;background:white">Anatomic Ontology for Alveolar Development and Maturation in the Mouse Lung</span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;background:white">Acronym: LUNGMAP-HUMAN</span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;background:white">Public</span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;background:white">Anatomy</span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;background:white"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;background:white">Owl is attached.</span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
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<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;background:white"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;background:white">Thanks!</span><o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;background:white">Helen</span><o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal"><Human_bioportal.owl><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif">_______________________________________________<br>
bioontology-support mailing list<br>
</span><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;color:#954F72">bioontology-support@lists.stanford.edu</span></a><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif"><br>
</span><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;color:#954F72">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</span></a><o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal">John Graybeal<o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal">Technical Program Manager<o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal">Center for Expanded Data Annotation and Retrieval /+/ NCBO BioPortal<o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt">Stanford Center for Biomedical Informatics Research<br>
650-736-1632<o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif">_______________________________________________<br>
bioontology-support mailing list<br>
</span><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;color:purple">bioontology-support@lists.stanford.edu</span></a><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif"><br>
</span><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Helvetica",sans-serif;color:purple">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</span></a><o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal"><Human_Cell_Ontology_bioportal.owl><Mouse_Cell_Ontology_bioportal.owl><o:p></o:p></p>
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