<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hi Helen,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I’ve checked the account, and it had a custom ontology list set to a single ontology, which prevented you from seeing the rest of your ontologies. I think the fact that it had existed prior to my performing various fixes related to your ontologies
 created a situation where you could not see the rest of them. I’ve signed in to your account, cleared your custom ontology set and cleared the caches on our end. I then browsed all your ontologies (via your account), and they were all visible and searchable.
 Let me know if this isn’t the case.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Michael</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Mar 28, 2018, at 5:11 PM, Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org" class="">hpan@rti.org</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi Michael,<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I am very grateful for your helpful! I can see the updated title! I appreciate the helpful information you provided for me to submit/edit the ontologies myself.<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Before I log in, searching “lungmap” returns 5 ontologies. However,<span class="Apple-converted-space"> </span><b class="">after I log in</b>, I am having all sorts of error messages.<o:p class=""></o:p></div>
<ol start="1" type="1" style="margin-bottom: 0in; margin-top: 0in;" class="">
<li class="MsoListParagraph" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
error messages when I click the links you provided below, the same error message I got after I tried to submit the human ontologies several time or edit.<o:p class=""></o:p></li></ol>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span id="cid:image001.jpg@01D3C6D0.FA3DFCE0"><image001.jpg></span><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span id="cid:image003.jpg@01D3C6D0.FA3DFCE0"><image003.jpg></span><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<ol start="2" type="1" style="margin-bottom: 0in; margin-top: 0in;" class="">
<li class="MsoListParagraph" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
searching “lungmap” returns only 1 ontology I submitted successfully, I don’t see the other ontologies I was able to see before I log in.<o:p class=""></o:p></li></ol>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span id="cid:image004.jpg@01D3C6D0.FA3DFCE0"><image004.jpg></span><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<ol start="3" type="1" style="margin-bottom: 0in; margin-top: 0in;" class="">
<li class="MsoListParagraph" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
My default landing page after log in is the one ontology I submitted successfully,<o:p class=""></o:p></li></ol>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span id="cid:image005.jpg@01D3C6D0.FA3DFCE0"><image005.jpg></span><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt 0.5in; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<ol start="4" type="1" style="margin-bottom: 0in; margin-top: 0in;" class="">
<li class="MsoListParagraph" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
Click on “account settings” takes me to a page where I see only that 1 ontology, and clicking on the ontology to edit gives me the same error message in 1.<o:p class=""></o:p></li><li class="MsoListParagraph" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
Going to the lungmap-human, or the 2 lung cell ontologies gives me the same error message. So I can’t access or edit.<o:p class=""></o:p></li></ol>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
It seems most times I try any submit/edit function I got this error message. I am not sure if it’s an account setting issue or a performance issue. I got the same error message using different browsers (Firefox, IE, Chrome). I am happy to set up a web working
 session to show you or fix it if you are available.<span class="Apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Many thanks!<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Helen<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div style="border-style: solid none none; border-top-width: 1pt; border-top-color: rgb(225, 225, 225); padding: 3pt 0in 0in;" class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class="">From:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Michael Dorf [<a href="mailto:mdorf@stanford.edu" class="">mailto:mdorf@stanford.edu</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Wednesday, March 28, 2018 5:28 PM<br class="">
<b class="">To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org" class="">hpan@rti.org</a>><br class="">
<b class="">Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>John Graybeal <<a href="mailto:jgraybeal@stanford.edu" class="">jgraybeal@stanford.edu</a>><br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: [bioontology-support] problem with ontology submission - please help!<o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi Helen,<span class="Apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
The username hpan67 should have an admin access to the ontology. The ontology metadata can be updated by clicking on either the “Edit ontology information” link (for a general ontology info) or the “Edit submission information (1)” link (for a version specific
 info):<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN/edit" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN/edit</a> <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN/submissions/1/edit" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN/submissions/1/edit</a> <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I did fix the title as you requested but wanted you to know that you have that capability in case further changes are needed.<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thanks!<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Michael<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<br class="">
<br class="">
<o:p class=""></o:p></div>
<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
On Mar 28, 2018, at 2:18 PM, Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">hpan@rti.org</a>> wrote:<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi Michael,<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I noticed one error. The name/title of the<span class="apple-converted-space"> </span><a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN</span></a><span class="apple-converted-space"> </span>ontology
 needs to be updated:  <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Anatomic Ontology for<span class="apple-converted-space"> </span><s class=""><span style="color: red;" class="">Alveolar Development and Maturation in the Mouse</span></s><span class="apple-converted-space"><span style="color: red;" class=""> </span></span><span style="color: red;" class="">Human<span class="apple-converted-space"> </span></span>Lung<span class="apple-converted-space"> </span><span style="color: red;" class="">Maturation</span><o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thank you!<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Helen<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
<div class="">
<div style="border-style: solid none none; border-top-width: 1pt; border-top-color: rgb(225, 225, 225); padding: 3pt 0in 0in;" class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class="">From:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Michael Dorf [<a href="mailto:mdorf@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">mailto:mdorf@stanford.edu</span></a>]<span class="apple-converted-space"> </span><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Wednesday, March 28, 2018 12:39 PM<br class="">
<b class="">To:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">hpan@rti.org</span></a>><br class="">
<b class="">Cc:</b><span class="apple-converted-space"> </span>John Graybeal <<a href="mailto:jgraybeal@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">jgraybeal@stanford.edu</span></a>>;<span class="apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">support@bioontology.org</span></a><br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Re: [bioontology-support] problem with ontology submission - please help!<o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi Pan,<span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I’ve re-submitted your ontology under the correct acronym, LUNGMAP-HUMAN. I’ve also deleted all the extraneous records (LUNGMAP-, LUNGMAP-HUMAN1, LUNGMAP_HUMAN, LUNGMAP_HUMAN2, LUNGMAP--HUMAN). Your ontology is now browsable here:<o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN</span></a> <o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Please contact us if you run into further issues.<o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thank you for using BioPortal!<o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Michael<o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif;" class="">----------------------------------------------------<br class="">
Michael Dorf<br class="">
Chief Software Architect<br class="">
The National Center for Biomedical Ontology<br class="">
Stanford Biomedical Informatics Research<br class="">
</span><a href="mailto:mdorf@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; color: purple;" class="">mdorf@stanford.edu</span></a><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif;" class=""><br class="">
O: 650-723-0357<br class="">
M: 650-995-4374<br class="">
----------------------------------------------------</span><o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 12pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<br class="">
<br class="">
<br class="">
<o:p class=""></o:p></p>
</div>
<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
On Mar 28, 2018, at 7:32 AM, Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">hpan@rti.org</span></a>> wrote:<o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
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<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi John,<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thank you for helping me creating the<span class="apple-converted-space"> </span><a href="http://purl.bioontology.org/ontology/LUNGMAP-HUMAN1" target="_blank" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 10.5pt; font-family: "Helvetica Neue", serif; color: rgb(35, 82, 124); background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">http://purl.bioontology.org/ontology/LUNGMAP-HUMAN1</span></a>.
 It looks good and I can access it!<o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I can find the 5 other “unsuccessful” attempts (highlighted below) when I search for “lungmap” at the public site, but I can’t delete them before I login in, and I can’t find them after I log in. would you please help me delete these 5, and change the name
 of the successful submission you did above by removing the “1” at the end?<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<image002.jpg><o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I greatly appreciate your help!<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Helen<o:p class=""></o:p></div>
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 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div style="border-style: solid none none; border-top-width: 1pt; border-top-color: rgb(225, 225, 225); padding: 3pt 0in 0in;" class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class="">From:</b><span class="apple-converted-space"> </span>John Graybeal [<a href="mailto:jgraybeal@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">mailto:jgraybeal@stanford.edu</span></a>]<span class="apple-converted-space"> </span><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Saturday, March 24, 2018 5:51 PM<br class="">
<b class="">To:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">hpan@rti.org</span></a>><br class="">
<b class="">Cc:</b><span class="apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">support@bioontology.org</span></a><br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Re: [bioontology-support] problem with ontology submission - please help!<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Helen,<span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I have submitted your OWL file under the LUNGMAP-HUMAN1 acronym, and got the results below [1]. I did not get any error messages.<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Note that you probably will want to redo your submission under the same acronym but leaving off the '1'. Once that is successful, we can delete this ontology.<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I am wondering when you attempted your submissions. If you submitted it before late Thursday, we were having problems with the system up until that point, and these were likely interfering with your efforts.<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
When you try to submit under LUNGMAP-HUMAN, please keep track of the Add Submission process as you go, and let us know if there are any issues.<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thanks,<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
John<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
[1]  Results of submission:<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 7.5pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white; box-sizing: border-box; font-variant-ligatures: normal; orphans: 2; widows: 2; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;">
<span style="font-size: 10.5pt; font-family: "Helvetica Neue", serif; color: rgb(51, 51, 51);" class="">Thank you for submitting your ontology to BioPortal.</span><o:p class=""></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 7.5pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white; box-sizing: border-box; font-variant-ligatures: normal; orphans: 2; widows: 2; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;">
<span style="font-size: 10.5pt; font-family: "Helvetica Neue", serif; color: rgb(51, 51, 51);" class="">We will now put your ontology in the queue to be processed. Please keep in mind that it may take up to several hours before BioPortal users will be able
 to explore and search your ontology.</span><o:p class=""></o:p></p>
<div class="">
<div class="">
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt; font-family: "Helvetica Neue", serif; color: rgb(51, 51, 51);" class="">When your ontology is ready for viewing, it will be available here: <br class="">
</span><a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN1" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 10.5pt; font-family: "Helvetica Neue", serif; color: rgb(51, 122, 183); text-decoration: none;" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/LUNGMAP-HUMAN1</span></a><o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt; font-family: "Helvetica Neue", serif; color: rgb(51, 51, 51);" class="">If you have any questions or problems, please email the BioPortal support team at </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 10.5pt; font-family: "Helvetica Neue", serif; color: rgb(51, 122, 183); text-decoration: none;" class="">support@bioontology.org</span></a><o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
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<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
On Mar 24, 2018, at 7:38 PM, Pan, Huaqin (Helen) <<a href="mailto:hpan@rti.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="color: purple;" class="">hpan@rti.org</span></a>> wrote:<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hello,<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hello, I tried several times to submit an ontology:<o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
initial submission always got<span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
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<image002.jpg><o:p class=""></o:p></div>
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Another try always got<span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
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<image004.jpg><o:p class=""></o:p></div>
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It repeats that when I tried different name/acronyms on different web browsers.<o:p class=""></o:p></div>
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Would you please help me create the ontology?<span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Name:<span class="apple-converted-space"> </span><span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">Anatomic Ontology for Alveolar
 Development and Maturation in the Mouse Lung</span><o:p class=""></o:p></div>
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<span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">Acronym: LUNGMAP-HUMAN</span><o:p class=""></o:p></div>
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<span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">Public</span><o:p class=""></o:p></div>
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<span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">Anatomy</span><o:p class=""></o:p></div>
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<span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class=""> </span><o:p class=""></o:p></div>
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<span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">Owl is attached.</span><o:p class=""></o:p></div>
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<span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class=""> </span><o:p class=""></o:p></div>
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<span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">Thanks!</span><o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">Helen</span><o:p class=""></o:p></div>
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 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<Human_bioportal.owl><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif;" class="">_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
</span><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; color: rgb(149, 79, 114);" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</span></a><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif;" class=""><br class="">
</span><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; color: rgb(149, 79, 114);" class="">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</span></a><o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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========================<span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
John Graybeal<o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Technical Program Manager<o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Center for Expanded Data Annotation and Retrieval /+/ NCBO BioPortal<o:p class=""></o:p></div>
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<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 12pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
Stanford Center for Biomedical Informatics Research<br class="">
650-736-1632<o:p class=""></o:p></p>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif;" class="">_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
</span><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; color: purple;" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</span></a><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif;" class=""><br class="">
</span><a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 9pt; font-family: Helvetica, sans-serif; color: purple;" class="">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</span></a><o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
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<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<Human_Cell_Ontology_bioportal.owl><Mouse_Cell_Ontology_bioportal.owl></div>
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