<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hello Ahmed,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Apologies, but I have no knowledge of what the ClinCapture system is, so I can’t comment on whether you’ve correctly entered data there.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">What I can tell you is how to test whether your BioPortal account is working properly. You should be able to enter a URL for our REST API in a browser and see response data displayed. For example, if you enter the following URL in a browser (enter
 your API key at the end where I’ve indicated):</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><a href="http://data.bioontology.org/ontologies/MEDDRA?apikey=your_api_key_goes_here" class="">http://data.bioontology.org/ontologies/MEDDRA?apikey=your_api_key_goes_here</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">You should see a JSON response like this:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><img apple-inline="yes" id="10830DC8-CF7F-44A5-B650-666B537967B6" src="cid:EBB7B747-FABE-4BE3-989C-97FD1FA74D51@stanford.edu" class=""></div>
<div class="">Kind regards,</div>
<div class="">Jennifer</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On May 7, 2018, at 9:44 AM, Ahmed Farhat <<a href="mailto:ahmed.farhat@clinart.net" class="">ahmed.farhat@clinart.net</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class="">Dear Jennifer,</span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class="">Many thanks for your prompt reply.</span></div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""> </span></p>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class="">Kindly find the below snapshot from my BioPortal account and from ClinCapture EDC System</span></div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""> </span></p>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span id="cid:image003.png@01D3E633.77020CE0"><image003.png></span><span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""></span></div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""> </span></p>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span id="cid:image001.png@01D3E632.E5C088B0"><image001.png></span><span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""></span></div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""> </span></p>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class="">Is the entered data<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class="">correct?</span></div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""> </span></p>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class="">Thanks</span></div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""> </span></p>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt; font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96); background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">Regards,</span></div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<span style="font-size: 6pt; color: rgb(0, 32, 96); background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class=""> </span></p>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="font-size: 10.5pt; font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(34, 34, 34); background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">Ahmed Farhat </span></b><span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(34, 34, 34);" class=""><br class="">
</span><span style="font-size: 9pt; font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(34, 34, 34); background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">IT Supervisor</span><span style="color: rgb(34, 34, 34);" class=""><br class="">
</span><span style="color: rgb(0, 32, 96);" class=""><span id="cid:image002.jpg@01D3E632.E5C088B0"><image002.jpg></span></span><span style="color: rgb(34, 34, 34);" class=""><br class="">
</span><span style="font-size: 8.5pt; font-family: "Century Gothic", sans-serif; background-color: white;" class="">2<sup class="">nd</sup><span class="Apple-converted-space"> </span><sup class=""> </sup>Floor</span><span style="font-size: 8.5pt; font-family: "Century Gothic", sans-serif; background-color: white;" class="">,
 106 Town Center, 1st Commercial sector (Banks Zone), 5th Settlement, New Cairo, Egypt<br class="">
Phone: +20228117526 | Fax: +20228117527<br class="">
Mobile: +20 1145161634 | Skype: farhat.clinart</span><span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif;" class=""><br class="">
</span><b class=""><span style="font-size: 8.5pt; font-family: "Century Gothic", sans-serif; background-color: white;" class="">Email:</span></b><b class=""><span style="font-size: 8.5pt; font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: darkgray; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class=""> </span></b><span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""><a href="mailto:ahmed.farhat@clinart.net" target="_blank" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 8.5pt; color: rgb(17, 85, 204); background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">ahmed.farhat@clinart.net</span></a></span><span style="font-size: 8.5pt; font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: darkgray; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class=""> |<b class=""> </b></span><span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""><a href="http://www.clinart.net/" target="_blank" style="color: purple; text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 8.5pt; color: rgb(17, 85, 204); background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class="">www.clinart.net</span></a></span><span style="font-size: 8.5pt; color: darkgray; background-color: white; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;" class=""> </span><span style="color: rgb(0, 32, 96);" class=""></span></div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<span style="font-family: "Century Gothic", sans-serif; color: rgb(0, 32, 96);" class=""> </span></p>
<div class="">
<div style="border-style: solid none none; border-top-width: 1pt; border-top-color: rgb(225, 225, 225); padding: 3pt 0in 0in;" class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class="">From:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Jennifer Leigh Vendetti <<a href="mailto:vendetti@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">vendetti@stanford.edu</a>><span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>7 May, 2018 6:02 PM<br class="">
<b class="">To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>NCBO User Support <<a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">support@bioontology.org</a>><br class="">
<b class="">Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:ahmed.farhat@clinart.net" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">ahmed.farhat@clinart.net</a><br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from afarhat</div>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hello Ahmed,</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I’m not sure I understand exactly what you’re looking for. You can browse MEDDRA via the BioPortal application here:</div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/MEDDRA" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/MEDDRA</a></div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Or, you can use our REST API to programmatically access the ontology:</div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<a href="http://data.bioontology.org/ontologies/MEDDRA" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">http://data.bioontology.org/ontologies/MEDDRA</a></div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Use of the REST API requires that you have an API key. Instructions for getting an API key are available on our wiki:</div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<a href="https://www.bioontology.org/wiki/index.php/BioPortal_Help#Getting_an_API_key" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">https://www.bioontology.org/wiki/index.php/BioPortal_Help#Getting_an_API_key</a></div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
The API is documented here:</div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<a href="http://data.bioontology.org/documentation" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">http://data.bioontology.org/documentation</a></div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Kind regards</div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Jennifer</div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<br class="">
<br class="">
</div>
<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="" type="cite">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
On May 7, 2018, at 8:20 AM,<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">support@bioontology.org</a><span class="Apple-converted-space"> </span>wrote:</div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Name: afarhat</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<a href="mailto:ahmed.farhat@clinart.net" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">Email: ahmed.farhat@clinart.net</a></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Location: https%3A%2F%<a href="http://2fbioportal.bioontology.org/" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">2Fbioportal.bioontology.org</a>%2Fontologies<span class="Apple-converted-space"> </span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<br class="">
<strong class=""><span style="font-family: Calibri, sans-serif;" class="">Feedback:</span></strong></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi,<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
I need "Bioontology URL" for MEDDRA to use it through ClinCapture EDC System.</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
We already have an MSSO account</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Appreciate your help.</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thanks<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
Ahmed Farhat</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br class="">
<a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a></div>
</div>
</blockquote>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
 </p>
</div>
</div>
<br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
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