<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hi Sarah,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Mappings are NOT directed. Your assumption is correct about the mappings between ontology1 and ontology2.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Michael</div>
<div class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Oct 13, 2018, at 1:17 AM, Sarah Alghamdi <<a href="mailto:sarah.alghamdi.1@kaust.edu.sa" class="">sarah.alghamdi.1@kaust.edu.sa</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
Thank you for your response. <br class="">
<div class="">I have a question, is the mappings directed?</div>
<div class="">while downloaded I had the assumption they are not, and I just want to make sure before proceeding in my work,</div>
<div class="">in other words if I have mappings from ontology1 to ontology2 it is the same as the mappings from ontology2 to ontology1</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
</div>
<br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<div class="gmail_quote" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;">
<div dir="ltr" class="">On Fri, Oct 5, 2018 at 12:19 AM Michael Dorf <<a href="mailto:mdorf@stanford.edu" class="">mdorf@stanford.edu</a>> wrote:<br class="">
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0px 0px 0px 0.8ex; border-left-width: 1px; border-left-style: solid; border-left-color: rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
<div style="word-wrap: break-word; line-break: after-white-space;" class="">Hi Sarah,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Unfortunately, at this point, the answer is NO. We've had similar requests in the past and have an existing open ticket in Github that tracks this issue:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><a href="https://github.com/ncbo/bioportal-project/issues/84" target="_blank" class="">https://github.com/ncbo/bioportal-project/issues/84</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">We are a small team, and <span class="">our development schedule is highly selective. Unfortunately, this issue hasn’t yet made it to the top of our priority list.</span></div>
<div class=""><span class=""><br class="">
</span></div>
<div class=""><span class="">Sorry, I couldn’t be of more help.</span></div>
<div class=""><span class=""><br class="">
</span></div>
<div class=""><span class="">Michael</span></div>
<div class=""><span class=""><br class="">
</span>
<div class=""><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Oct 4, 2018, at 3:13 AM, Sarah Alghamdi <<a href="mailto:sarah.alghamdi.1@kaust.edu.sa" target="_blank" class="">sarah.alghamdi.1@kaust.edu.sa</a>> wrote:</div>
<br class="m_-6621673392184961241Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">Dear team,
<div class="">I hope this finds you very well,</div>
<div class="">For my research I want to acquire all the mappings available between pairs of ontologies from the Bioportal, I'm currently using the REST API and passing by all the pairs of ontologies, but this is taking me very long time (might spend months).</div>
<div class="">would it be possible for you to provide all the mappings in a single download link?<br clear="all" class="">
<div class=""><br class="">
</div>
--<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
<div dir="ltr" class="m_-6621673392184961241m_-6967070779982610028gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class=""><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">Best Regards,</font></div>
<div class=""><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class=""> </font></div>
<div class=""><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">Sarah M. Alghamdi</font></div>
<div class=""><span style="font-family: tahoma, sans-serif; font-size: small;" class="">Computer Science PhD Student - KAUST</span><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class=""><br class="">
</font></div>
<div class="">
<div style="margin: 0px; padding: 0px; line-height: 20.8px;" class=""><a href="https://borg.kaust.edu.sa/Pages/Home.aspx" target="_blank" style="outline: 0px;" class=""><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">Bio-Ontology
 Research Group (BORG)</font></a></div>
<div style="margin: 0px; padding: 0px; line-height: 20.8px;" class=""><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class=""><a href="http://www.cbrc.kaust.edu.sa/" target="_blank" class=""><font class="">Computational
 Bioscience Research Center (CBRC)</font></a><br class="">
<a href="https://cemse.kaust.edu.sa/Pages/Home.aspx" target="_blank" class=""><font class="">Computer, Electrical, and Mathematical Sciences and Engineering (CEMSE)</font></a></font></div>
</div>
<div class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<div style="font-size: 12.8px;" class=""><br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br class="">
<div class="">
<hr class="">
</div>
<font face="Arial" size="1" class="">This message and its contents, including attachments are intended solely for the original recipient. If you are not the intended recipient or have received this message in error, please notify me immediately and delete this
 message from your computer system. Any unauthorized use or distribution is prohibited. Please consider the environment before printing this email.</font>_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" target="_blank" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br class="">
<a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" target="_blank" class="">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br clear="all" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<div style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<br class="">
</div>
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">--<span class="Apple-converted-space"> </span></span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class=""><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">Best Regards,</font></div>
<div class=""><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class=""> </font></div>
<div class=""><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">Sarah M. Alghamdi</font></div>
<div class=""><span style="font-family: tahoma, sans-serif; font-size: small;" class="">Computer Science PhD Student - KAUST</span><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class=""><br class="">
</font></div>
<div class="">
<div style="margin: 0px; padding: 0px; line-height: 20.8px;" class=""><a href="https://borg.kaust.edu.sa/Pages/Home.aspx" target="_blank" style="outline: 0px;" class=""><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">Bio-Ontology
 Research Group (BORG)​</font></a></div>
<div style="margin: 0px; padding: 0px; line-height: 20.8px;" class=""><font face="tahoma, sans-serif" size="2" style="background-color: rgb(255, 255, 255);" class=""><a href="http://www.cbrc.kaust.edu.sa/" target="_blank" class=""><font class="">Computational
 Bioscience Research Center (CBRC)</font></a><br class="">
<a href="https://cemse.kaust.edu.sa/Pages/Home.aspx" target="_blank" class=""><font class="">Computer, Electrical, and Mathematical Sciences and Engineering (CEMSE)​</font></a></font></div>
</div>
<div class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<div style="font-size: 12.8px;" class=""><br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<div style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<hr class="">
</div>
<font face="Arial" size="1" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">This
 message and its contents, including attachments are intended solely for the original recipient. If you are not the intended recipient or have received this message in error, please notify me immediately and delete this message from your computer system. Any
 unauthorized use or distribution is prohibited. Please consider the environment before printing this email.</font></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>