<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hi Dan,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Apologies if it wan’t clear from my first message that we believe the problem is on our end, not with your ontology.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">As of end of business today, we were able to reproduce the error in our local development environment.<font size="2" class=""> Unfortunately it’s something we haven’t encountered before, and will need time to debug / troubleshoot the code. I’ll
 update you with any progress we’re able to make.</font></div>
<div class=""><font size="2" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font size="2" class="">Kind regards,</font></div>
<div class=""><font size="2" class="">Jennifer</font></div>
<div class=""><font size="2" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font size="2" class=""><br class="">
</font>
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Apr 23, 2019, at 5:37 AM, Daniel Hier <<a href="mailto:dbhier@dbhier.com" class="">dbhier@dbhier.com</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">Thanks for your help with NEO ontology.  I gave you permission to view ontology on Web Protege at <a href="https://webprotege.stanford.edu/#projects/cd29450e-727f-4afb-9ad6-e44cdb3461df/sharing" class="">https://webprotege.stanford.edu/#projects/cd29450e-727f-4afb-9ad6-e44cdb3461df/sharing</a>
<div class="">I tried to recheck for errors again and reload without success to the BioPortal.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Dan</div>
</div>
<br class="">
<div class="gmail_quote">
<div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Apr 22, 2019 at 7:30 PM Daniel Hier <<a href="mailto:dbhier@dbhier.com" class="">dbhier@dbhier.com</a>> wrote:<br class="">
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div dir="auto" class="">Thank you Jennifer
<div class="">I am rechecking my ontology for errors.</div>
<div class="">Thank you again!</div>
<div class="">I may have a mix of IRI formats</div>
<div class="">I wonder if that is problematic?</div>
<div class="">Dan<br class="">
<br class="">
<div id="gmail-m_1613185441342576472AppleMailSignature" dir="ltr" class="">Sent from my iPhone</div>
<div dir="ltr" class=""><br class="">
On Apr 22, 2019, at 6:59 PM, Jennifer Leigh Vendetti <<a href="mailto:vendetti@stanford.edu" target="_blank" class="">vendetti@stanford.edu</a>> wrote:<br class="">
<br class="">
</div>
<blockquote type="cite" class="">
<div dir="ltr" class="">Hello Daniel,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Typically if ontologies load successfully in Protege, they will also load in BioPortal. I looked at our parsing logs for your NEO ontology, and I encountered some unusual error messages. I’ve entered an issue in our tracker:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><a href="https://github.com/ncbo/bioportal-project/issues/111" target="_blank" class="">https://github.com/ncbo/bioportal-project/issues/111</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">We’re actively looking into the underlying cause and will update you when we’re able to get your ontology loaded.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Apologies for the inconvenience.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Kind regards,</div>
<div class="">Jennifer</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div class=""><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Apr 22, 2019, at 6:32 AM, Daniel Hier <<a href="mailto:dbhier@dbhier.com" target="_blank" class="">dbhier@dbhier.com</a>> wrote:</div>
<br class="gmail-m_1613185441342576472Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">Can you help me get my ontology to parse for the BioPortal?  I must be doing something wrong.  I took the Protege short course at Stanford in March in order to finish my ontology for the neurological examination.  I successfully loaded
 it to the Web Protege website but can't get it to parse in the BioPortal website.  I attached screen shots.  I saved it in RDF/XML owl format but it won't load.  Thanks again for your help.  The acronym is NEO. (neurologic examination ontology).
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br clear="all" class="">
<div class=""><br class="">
</div>
-- <br class="">
<div dir="ltr" class="gmail-m_1613185441342576472gmail_signature">
<div dir="ltr" class="">Daniel B Hier MD</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<span id="gmail-m_1613185441342576472cid:f_juseg2nq0" class=""><web protege.pdf></span><span id="gmail-m_1613185441342576472cid:f_juseg2o22" class=""><Ontology.pdf></span><span id="gmail-m_1613185441342576472cid:f_juseg2nx1" class=""><Neurologic Examination
 Ontology.pdf></span>_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" target="_blank" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br class="">
<a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" target="_blank" class="">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br clear="all" class="">
<div class=""><br class="">
</div>
-- <br class="">
<div dir="ltr" class="gmail_signature">
<div dir="ltr" class="">Daniel B Hier MD</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>