<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hello Yaron,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I assume you are using the account with username “ShebaRedCap”? I looked up this account and associated API key in our system. I issued a CURL command to our REST API to retrieve data for a particular ontology using your API key, e.g.:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">curl -H "Authorization: apikey token=your_api_key_here" <a href="http://data.bioontology.org/ontologies/BRO" class="">
http://data.bioontology.org/ontologies/BRO</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">(I removed your API key from the example call above for security purposes). The call returned data for me with no issues. I am not seeing a problem on our end with your API key.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">One thing you could do on your end to test your API key would be to open a browser window and try using your API key to retrieve data for an ontology. For example, you could enter the following REST call in your browser’s address bar:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><a href="http://data.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT?apikey=" class="">http://data.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT?apikey=</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">You would need to enter your API key at the end of that URL.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Kind regards,</div>
<div class="">Jennifer</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Jun 30, 2019, at 5:32 AM, <a href="mailto:RedCap.Administrator@sheba.health.gov.il" class="">
RedCap.Administrator@sheba.health.gov.il</a> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">Hi Jennifer.<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">I tried to insert the key and got an error message:<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><span id="cid:image001.jpg@01D52F59.17B12DA0"><image001.jpg></span></span><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">Regards,<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">Yaron<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div class="">
<div style="border-style: solid none none; border-top-width: 1pt; border-top-color: rgb(225, 225, 225); padding: 3pt 0in 0in;" class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<b class=""><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">From:</span></b><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class=""><span class="Apple-converted-space"> </span>Jennifer Leigh Vendetti [<a href="mailto:vendetti@stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">mailto:vendetti@stanford.edu</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Thursday, June 27, 2019 11:14 PM<br class="">
<b class="">To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">support@bioontology.org</a><br class="">
<b class="">Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>RedCap Administrator <<a href="mailto:RedCap.Administrator@sheba.health.gov.il" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">RedCap.Administrator@sheba.health.gov.il</a>><br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from ShebaRedCap<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
Hello Yaron,<span class="Apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
There are instructions for getting a BioPortal API key on our wiki:<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<a href="https://www.bioontology.org/wiki/BioPortal_Help#Getting_an_API_key" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">https://www.bioontology.org/wiki/BioPortal_Help#Getting_an_API_key</a><o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
Kind regards,<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
Jennifer<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<br class="">
<br class="">
<o:p class=""></o:p></div>
<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
On Jun 27, 2019, at 5:58 AM,<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">support@bioontology.org</a><span class="Apple-converted-space"> </span>wrote:<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
Name: ShebaRedCap<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<a href="mailto:RedCap.Administrator@sheba.health.gov.il" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">Email: RedCap.Administrator@sheba.health.gov.il</a><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
Location: https%3A%2F%<a href="http://2fbioportal.bioontology.org/" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">2Fbioportal.bioontology.org</a>%2F<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<br class="">
<strong class="">Feedback:</strong><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
Hi,<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
We have Redcap server installed in our organization.<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
We want to enable searching within a biomedical ontology.<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
We need to enter API token provide by your site.<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
Can you send me my API token?<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
Regards,<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
Yaron<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
Sheba Medical Center<o:p class=""></o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br class="">
<a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a></div>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
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