<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hi Clair,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Yes - there is a way to do this. You can specify the “also_search_properties” parameter for API calls to the /search endpoint. That syntax looks like the following:<br class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><a href="http://data.bioontology.org/search?q=RC571&ontologies=GSSO&also_search_properties=true" class="">http://data.bioontology.org/search?q=RC571&ontologies=GSSO&also_search_properties=true</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">… and returns the desired “Down syndrome” class:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><img apple-inline="yes" id="DDB4BBF4-7E46-407C-8E5C-51CD87308B6B" src="cid:42D9B5B0-17F0-4874-82F8-A73E99AC652F@stanford.edu" class=""></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">The /search endpoint is documented here: <a href="http://data.bioontology.org/documentation#nav_search" class="">http://data.bioontology.org/documentation#nav_search</a>.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Hope that helps.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Kind regards,</div>
<div class="">Jennifer</div>
<div class=""><br class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Sep 19, 2019, at 9:45 AM, Clair Kronk <<a href="mailto:clair.kronk@gmail.com" class="">clair.kronk@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">Jennifer,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Sorry to bother again, but I've been looking through and API docs and I'm not sure if this functionality is currently supported:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">So I have a property for Library of Congress Subject Headings in my ontology (GSSO). Is there any way to query my ontology for a match to a subject heading and return the entry to the user without downloading all classes?</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">For instance, if a user queries for the subject heading "RC571" it should return the entry for Down Syndrome.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks so much!</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""> Best wishes,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Clair Kronk</div>
</div>
<br class="">
<div class="gmail_quote">
<div dir="ltr" class="gmail_attr">On Thu, Sep 19, 2019 at 12:13 PM Clair Kronk <<a href="mailto:clair.kronk@gmail.com" class="">clair.kronk@gmail.com</a>> wrote:<br class="">
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div dir="ltr" class="">Jennifer,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks so much for your help! Sorry this got buried a bit in my email! Thanks so much for the instances endpoint, it helps a ton!</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Best,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Clair Kronk</div>
</div>
<br class="">
<div class="gmail_quote">
<div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, Sep 13, 2019 at 8:42 PM Jennifer Leigh Vendetti <<a href="mailto:vendetti@stanford.edu" target="_blank" class="">vendetti@stanford.edu</a>> wrote:<br class="">
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div class="">Hi Clair,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Sep 13, 2019, at 4:59 PM, Clair Kronk <<a href="mailto:clair.kronk@gmail.com" target="_blank" class="">clair.kronk@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">Jennifer,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I figured it out! I put the wrong GitHub link (you have to link to the raw file, not just the file link itself). I saved one as the Manchester OWL format and it seems to be working now (1.0.1e).</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
Great! Glad you were able to get your ontology successfully loaded.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I'm still trying to figure out how to link things in the best way (my ontology has quite a few instances in it which don't seem to be able to be explored as of now).</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Currently we don’t have anything in the BioPortal user interface for browsing instances. Instance data is available via our REST API however:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><a href="http://data.bioontology.org/ontologies/GSSO/instances" target="_blank" class="">http://data.bioontology.org/ontologies/GSSO/instances</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Not sure if that helps.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Kind regards,</div>
<div class="">Jennifer</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</body>
</html>