<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hi Anna,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thank you for contacting you. Unfortunately, BioPortal support isn’t in the position to answer your specific question. The issues we address relate to either using the BioPortal API services or the BioPortal website at <a href="http://bioportal.bioontology.org" class="">http://bioportal.bioontology.org</a>.
 We are not experts in each individual ontology that we host. Your question is best directed to the creators/maintainers of the ontology you have downloaded. It’s not clear to me from your message which ontology you are referring to, but you can always navigate
 to the ontology summary page and contact the person designated in the field “Contact”. For example:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><a href="http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NCIT" class="">http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NCIT</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thank you, and I hope you are able to find the correct source for your question.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Michael</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">----------------------------------------------------<br class="">
Michael Dorf<br class="">
Chief Software Architect<br class="">
The National Center for Biomedical Ontology<br class="">
Stanford Biomedical Informatics Research<br class="">
<a href="mailto:mdorf@stanford.edu" class="">mdorf@stanford.edu</a><br class="">
O: 650-723-0357<br class="">
M: 650-995-4374<br class="">
----------------------------------------------------</div>
<div class=""><br class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Sep 23, 2019, at 12:59 PM, <a href="mailto:support@bioontology.org" class="">
support@bioontology.org</a> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="">
<p class="">Name: anna lee </p>
<p class=""><a href="mailto:liai@mail.nih.gov" class="">Email: liai@mail.nih.gov</a>
</p>
<p class="">Location: https%3A%2F%<a href="http://2Fbioportal.bioontology.org" class="">2Fbioportal.bioontology.org</a>%2Fhelp
</p>
<p class=""><br class="">
<strong class="">Feedback:</strong> </p>
<p class="">I just downloaded low grade glioma segmented CN data from your site and I am wondering whether the mean.set values are centered to zero or not. In another word, what thresholds should I use if I want to define a sample is amplified or not.</p>
<div class=""><br class="webkit-block-placeholder">
</div>
</div>
_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br class="">
https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support<br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>