<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hi Xintong,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">The latest version of NCIT (20.02d) was uploaded on 2/24/20 and, for some reason, several parts of its processing workflow had not completed successfully. I’ve re-processed the ontology, and it’s now fully operational, including the availability
 of the CSV file. Let me know if you experience further issues.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Michael</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div class="">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
----------------------------------------------------<br class="">
Michael Dorf<br class="">
Chief Software Architect<br class="">
The National Center for Biomedical Ontology<br class="">
Stanford Biomedical Informatics Research<br class="">
<a href="mailto:mdorf@stanford.edu" class="">mdorf@stanford.edu</a><br class="">
O: 650-723-0357<br class="">
M: 650-995-4374<br class="">
----------------------------------------------------</div>
</div>
</div>
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Feb 27, 2020, at 11:00 AM, Zhao,Xintong <<a href="mailto:xz485@drexel.edu" class="">xz485@drexel.edu</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<div style="margin: 0px; font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
Good Afternoon,</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<br class="">
</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
This is Xintong, a graduate student trying to download your NCIT (National Cancer Institute Thesaurus) ontology (CSV format) from BioPortal. However, when I tried to download the csv file (Version<span class=""> </span><b class="">20.02d</b>), the webpage returned
 error message as follows: </div>
<div style="margin: 0px; font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 14.29px; font-family: monospace;" class="">{</span>
<ul style="font-size: 14.29px; font-family: monospace; list-style: none; margin: 0px 0px 0px 2em;" class="">
<li class="">
<div style="margin: 0px; left: -1em;" class="">-</div>
<span style="margin: 0px; font-weight: bold;" class=""><span style="margin: 0px; color: transparent; display: inline-block; width: 0px;" class="">"</span>errors<span style="margin: 0px; color: transparent; display: inline-block; width: 0px;" class="">"</span></span>:
 [
<ul style="margin: 0px 0px 0px 2em;" class="">
<li class=""><span style="margin: 0px; color: green;" class="">"Cannot read latest submission upload file: /srv/ncbo/repository/NCIT/88/NCIT.csv.gz"</span></li></ul>
],</li><li class=""><span style="margin: 0px; font-weight: bold;" class=""><span style="margin: 0px; color: transparent; display: inline-block; width: 0px;" class="">"</span>status<span style="margin: 0px; color: transparent; display: inline-block; width: 0px;" class="">"</span></span>:<span class=""> </span><span style="margin: 0px; color: blue;" class="">500</span></li></ul>
<span style="margin: 0px; font-size: 14.29px; font-family: monospace;" class="">}</span><br class="">
</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<br class="">
</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
I contacted<span class="Apple-converted-space"> </span><span style="color: rgb(50, 49, 48); font-family: Calibri, sans-serif; font-size: 14.6667px; background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline !important;" class=""><a href="mailto:ncicbiit@mail.nih.gov" class="">ncicbiit@mail.nih.gov</a><span class="Apple-converted-space"> </span></span>and
 they redirected me here. Could you check on that csv file please? Its download links for other format (such as RDF, OWL) works fine.</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<br class="">
</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
Thank you for your help,</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
Xintong</div>
<br class="">
</div>
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">bioontology-support
 mailing list</span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>