<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hello Manuel,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Mar 3, 2020, at 8:25 AM, Manuel Fiorelli <<a href="mailto:manuel.fiorelli@gmail.com" class="">manuel.fiorelli@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">Hi Jennifer</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">thank you very much for the time that you spent on my request for support. I was aware of the limitation regarding the assignment of SKOS concepts to schemes; consequently, I added the "inverse" statements, which unfortunately were written at
 the end of the submission in a separate <i class="">rdf:Description</i>.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><span style="font-family:monospace" class=""><rdf:Description rdf:about="<a href="http://example.org/conceptScheme_07199b34" class="">http://example.org/conceptScheme_07199b34</a>"><br class="">
   <skos:hasTopConcept rdf:resource="<a href="http://example.org/c_48989b6a" class="">http://example.org/c_48989b6a</a>"/><br class="">
   <skos:hasTopConcept rdf:resource="<a href="http://example.org/c_e17f8367" class="">http://example.org/c_e17f8367</a>"/><br class="">
   <skos:hasTopConcept rdf:resource="<a href="http://example.org/c_4b2068df" class="">http://example.org/c_4b2068df</a>"/><br class="">
   <skos:hasTopConcept rdf:resource="<a href="http://example.org/c_4e52523a" class="">http://example.org/c_4e52523a</a>"/><br class="">
  <skos:hasTopConcept rdf:resource="<a href="http://example.org/c_968694e7" class="">http://example.org/c_968694e7</a>"/><br class="">
</rdf:Description></span></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">The motivation of this "strange" serialization is that it was generated automatically without enabling the pretty print routines. Do you think that this might explain why root classes aren't found.<br class="">
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
<div>When I investigated your problem report, I downloaded the file that was associated with your latest submission (the 6th file that you uploaded that is marked as version “1000” in the user interface). That source file doesn’t contain any of the hasTopConcept
 properties that you list above.</div>
<div><br class="">
</div>
<div>After reading this follow-up message from you, I downloaded one of your previous submissions (the 5th file that you uploaded). In that source file, I do see these hasTopConcept properties. It shouldn’t matter that they are listed at the end of your file
 in a separate rdf:Description. I went ahead and uploaded this source file to our staging environment (this is a private instance that we use internally for testing), and I can confirm that BioPortal properly detected the root classes and the 404 error no longer
 appears in the user interface:</div>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
<div><img apple-inline="yes" id="4CEABB67-B6DF-42E9-9AE7-8486FD85385E" src="cid:572FD2E1-25A6-407C-BDB8-49D409755157@stanford.edu" class=""> </div>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
<div>Here is the REST call to retrieve the roots that no longer returns an empty set:</div>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
<div><img apple-inline="yes" id="5912DE3A-9302-4BD4-805E-42C4E202744E" src="cid:F5BD56DA-E0CD-4CD1-9FE2-DE3840FCDF25@stanford.edu" class=""></div>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
<div>If you would like to upload a new version of your source file with these hasTopConcept properties, you should be able to successfully see the class tree in the user interface. One thing to note is that BioPortal has several caches in place for performance
 reasons. When you upload a new submission, the new data may not appear immediately.</div>
<div><br class="">
</div>
<div>Kind regards,</div>
<div>Jennifer</div>
<div><br class="">
</div>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>