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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">John,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">Thanks for getting back to me.  I think we figured it out.  We can now find PCL through the search function!<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">Best,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">Richard<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif;color:black">--------------------------------------------<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif;color:black">Richard H. Scheuermann, Ph.D.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif;color:black">Director, La Jolla Campus<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif;color:black">J. Craig Venter Institute<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif;color:black">4120 Capricorn Ln.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif;color:black">La Jolla, CA 92037<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif;color:black"><a href="http://www.jcvi.org"><span style="color:#0563C1">www.jcvi.org</span></a>
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif;color:black"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif;color:black"><a href="mailto:rscheuermann@jcvi.org"><span style="color:#0563C1">rscheuermann@jcvi.org</span></a>  <o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif;color:black">858-200-1876<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:12.0pt;color:black"> <o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:12.0pt;color:black"> <o:p></o:p></span></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"><o:p> </o:p></span></p>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><b><span style="font-size:12.0pt;color:black">From:
</span></b><span style="font-size:12.0pt;color:black">John Graybeal <jgraybeal@stanford.edu><br>
<b>Date: </b>Thursday, October 1, 2020 at 4:22 PM<br>
<b>To: </b>"Richard H. Scheuermann" <RScheuermann@jcvi.org><br>
<b>Cc: </b>Michael Dorf <mdorf@stanford.edu>, "support@bioontology.org" <support@bioontology.org><br>
<b>Subject: </b>Re: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from Richard Scheuermann<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><o:p> </o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">Richard, <o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">Thanks for your question.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">We can talk offline about the exact form of the change that would suit you—for example, it is straightforward to search for it on the ontologies page, but if it's important do so so from the main page also, we could
 add a checkbox to offer the option of including views in the search. Possibly another option would appeal more to you.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">Because at the moment we are excruciatingly limited in our available development resources, we don't have anyone who can do this change. If you can identify a funding source, I believe we could use it to acquire
 additional resources for the time needed to make the change. Please contact me directly if this interests you.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">John<o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><br>
<br>
<o:p></o:p></p>
<blockquote style="margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">On Oct 1, 2020, at 3:12 PM, Scheuermann, Richard <<a href="mailto:RScheuermann@jcvi.org">RScheuermann@jcvi.org</a>> wrote:<o:p></o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><o:p> </o:p></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">How do we change that?</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">--------------------------------------------</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">Richard H. Scheuermann, Ph.D.</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">Director, La Jolla Campus</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">J. Craig Venter Institute</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">4120 Capricorn Ln.</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">La Jolla, CA 92037</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"><a href="https://nam12.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.jcvi.org%2F&data=02%7C01%7CRScheuermann%40jcvi.org%7C103acee1be4045e6d8ec08d86660eb91%7C24d967f13ed84448baa6560ec572acb3%7C0%7C0%7C637371913742968526&sdata=wYzoF75F%2FeblJB2UcdlDKr51PaGwYAVuz2NFuYlZf0U%3D&reserved=0"><span style="color:#0563C1">www.jcvi.org</span></a></span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"><a href="mailto:rscheuermann@jcvi.org"><span style="color:#0563C1">rscheuermann@jcvi.org</span></a><span class="apple-converted-space"> </span> </span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif">858-200-1876</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-size:12.0pt"> </span><o:p></o:p></p>
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<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-size:12.0pt"> </span><o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"> </span><o:p></o:p></p>
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<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-family:"Arial",sans-serif"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><b><span style="font-size:12.0pt">From:<span class="apple-converted-space"> </span></span></b><span style="font-size:12.0pt">Michael Dorf <<a href="mailto:mdorf@stanford.edu">mdorf@stanford.edu</a>><br>
<b>Date:<span class="apple-converted-space"> </span></b>Thursday, October 1, 2020 at 3:05 PM<br>
<b>To:<span class="apple-converted-space"> </span></b>"<a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a>" <<a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a>><br>
<b>Cc:<span class="apple-converted-space"> </span></b>"Richard H. Scheuermann" <<a href="mailto:RScheuermann@jcvi.org">RScheuermann@jcvi.org</a>><br>
<b>Subject:<span class="apple-converted-space"> </span></b>Re: [bioontology-support] [BioPortal] Feedback from Richard Scheuermann</span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
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<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
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<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">Hi Richard,<span class="apple-converted-space"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">Thank you for contacting us. The PCL ontology appears to be configured as a “View” of Cell Line ontology (CL) rather than a standalone ontology. A view usually means a “subset” of the main ontology. By design, views
 do not appear in the main ontology selector, although the terms from views are searchable via the main BioPortal search.<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
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<div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><image001.png><o:p></o:p></p>
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<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
</div>
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<div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">Thanks,<o:p></o:p></p>
</div>
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<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
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<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">Michael<o:p></o:p></p>
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<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
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<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
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<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
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</div>
<div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><br>
<br>
<br>
<o:p></o:p></p>
</div>
<blockquote style="margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
<div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">On Sep 30, 2020, at 2:19 PM,<span class="apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org">support@bioontology.org</a><span class="apple-converted-space"> </span>wrote:<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
</div>
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<div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">Name: Richard Scheuermann<span class="apple-converted-space"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><a href="mailto:rscheuermann@jcvi.org">Email: rscheuermann@jcvi.org</a><o:p></o:p></p>
</div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">Location: https%3A%2F%<a href="https://nam12.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2F2fbioportal.bioontology.org%2F&data=02%7C01%7CRScheuermann%40jcvi.org%7C103acee1be4045e6d8ec08d86660eb91%7C24d967f13ed84448baa6560ec572acb3%7C0%7C0%7C637371913742978519&sdata=UGKtn3X%2BLFwYoSO1Uo1z%2Fpnjc5w9z45%2BFCEZaf8ebcg%3D&reserved=0">2Fbioportal.bioontology.org</a>%2F<o:p></o:p></p>
</div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><br>
<strong><span style="font-family:"Calibri",sans-serif">Feedback:</span></strong><o:p></o:p></p>
</div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">The Provisional Cell Ontology (<a href="https://nam12.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Fbioportal.bioontology.org%2Fontologies%2FPCL&data=02%7C01%7CRScheuermann%40jcvi.org%7C103acee1be4045e6d8ec08d86660eb91%7C24d967f13ed84448baa6560ec572acb3%7C0%7C0%7C637371913742978519&sdata=UlFGoJ3aaiGF2k%2F5WmbuEe%2FFAO1A0z0O1g%2BDDN6EFxM%3D&reserved=0">https://bioportal.bioontology.org/ontologies/PCL</a><span class="apple-converted-space"> </span>)
 does not appear to be discoverable from the Find an ontology search function on the BioPortal home page. Why is that?<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in">_______________________________________________<br>
bioontology-support mailing list<br>
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br>
<a href="https://nam12.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Fmailman.stanford.edu%2Fmailman%2Flistinfo%2Fbioontology-support&data=02%7C01%7CRScheuermann%40jcvi.org%7C103acee1be4045e6d8ec08d86660eb91%7C24d967f13ed84448baa6560ec572acb3%7C0%7C0%7C637371913742988519&sdata=Ar8vcB49QGsYQBTP6Kw1EhlH4DS7HzLY3aQH%2FrgVPrw%3D&reserved=0">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<div style="margin-left:.5in">
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"> <o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="font-size:9.0pt;font-family:Helvetica">_______________________________________________<br>
bioontology-support mailing list<br>
</span><a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu"><span style="font-size:9.0pt;font-family:Helvetica">bioontology-support@lists.stanford.edu</span></a><span style="font-size:9.0pt;font-family:Helvetica"><br>
</span><a href="https://nam12.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Fmailman.stanford.edu%2Fmailman%2Flistinfo%2Fbioontology-support&data=02%7C01%7CRScheuermann%40jcvi.org%7C103acee1be4045e6d8ec08d86660eb91%7C24d967f13ed84448baa6560ec572acb3%7C0%7C0%7C637371913742988519&sdata=Ar8vcB49QGsYQBTP6Kw1EhlH4DS7HzLY3aQH%2FrgVPrw%3D&reserved=0"><span style="font-size:9.0pt;font-family:Helvetica">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</span></a><o:p></o:p></p>
</div>
</blockquote>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><o:p> </o:p></p>
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<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="color:black">========================
<o:p></o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="color:black">John Graybeal<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="color:black">Technical Program Manager<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="color:black">Center for Expanded Data Annotation and Retrieval /+/ NCBO BioPortal<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="color:black">Stanford Center for Biomedical Informatics Research<br>
650-736-1632  | ORCID  0000-0001-6875-5360<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:.5in"><span style="color:black"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
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