<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Georgeta,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">It appears the document that was uploaded to BioPortal included an HTML document, not an ontology. I see that your link (<a href="https://gitub.u-bordeaux.fr/erias/fideo/-/raw/master/fideo_core.owl" class="">https://gitub.u-bordeaux.fr/erias/fideo/-/raw/master/fideo_core.owl</a>)
 appears to work in Protege, so I will have to check with my colleagues about why it might not be working in BioPortal. I'll try to do this today (before our Thanksgiving weekend), but I'm not sure if we'll be able to figure out it. (I suspect it may have to
 do with the networking again, but it could be tricky.)</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Sorry for your trouble.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">John</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Nov 25, 2020, at 9:05 AM, Georgeta Bordea <<a href="mailto:georgeta.bordea@u-bordeaux.fr" class="">georgeta.bordea@u-bordeaux.fr</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="">
<div style="font-family: arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<div class="">Dear BioPortal support team,</div>
<div class=""><br data-mce-bogus="1" class="">
</div>
<div class="">Thank you for helping us track down the previous issue related to submitting the FIDEO ontology [1]. Could you please let us know how to fix another issue, at the moment FIDEO classes are not properly retrieved and displayed.
</div>
<div class=""><br data-mce-bogus="1" class="">
</div>
<div class="">The error message we get on BioPortal [2] is currently just:</div>
<div class="">"Problem retrieving classes"</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Regards,</div>
<div class="">Georgeta Bordea</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">[1] <a href="https://gitub.u-bordeaux.fr/erias/fideo" class="">https://gitub.u-bordeaux.fr/erias/fideo</a></div>
<div class="">[2] <a href="https://bioportal.bioontology.org/ontologies/FIDEO/?p=classes&conceptid=root" class="">
https://bioportal.bioontology.org/ontologies/FIDEO/?p=classes&conceptid=root</a></div>
<div class=""><br data-mce-bogus="1" class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<hr id="zwchr" data-marker="__DIVIDER__" class="">
<div data-marker="__HEADERS__" class=""><b class="">De: </b>"Georgeta Bordea" <<a href="mailto:georgeta.bordea@u-bordeaux.fr" class="">georgeta.bordea@u-bordeaux.fr</a>><br class="">
<b class="">À: </b>"support" <<a href="mailto:support@bioontology.org" class="">support@bioontology.org</a>><br class="">
<b class="">Envoyé: </b>Jeudi 3 Septembre 2020 12:33:11<br class="">
<b class="">Objet: </b>Error when submitting a new ontology<br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div data-marker="__QUOTED_TEXT__" class="">
<div style="font-family: arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<div class="">Hi,</div>
<br class="">
<div class="">We are trying to submit a new ontology on BioPortal with the main public file located here [1] but there's the following error message:</div>
<br class="">
<div class=""><strong style="padding: 0px; margin: 0px; box-sizing: border-box; font-weight: bolder; color: #ff0000; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, 'Segoe UI', Roboto, 'Helvetica Neue', Arial, sans-serif, 'Apple Color Emoji', 'Segoe UI Emoji', 'Segoe UI Symbol', 'Noto Color Emoji'; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: #ffffff; text-decoration-style: initial; text-decoration-color: initial;" class="">Errors
 On Form</strong><span style="color: #ff0000; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, 'Segoe UI', Roboto, 'Helvetica Neue', Arial, sans-serif, 'Apple Color Emoji', 'Segoe UI Emoji', 'Segoe UI Symbol', 'Noto Color Emoji'; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: #ffffff; text-decoration-style: initial; text-decoration-color: initial; display: inline !important; float: none;" class=""></span>
<ul style="padding: 0px; margin: 0px 0px 15px; box-sizing: border-box; color: #ff0000; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, 'Segoe UI', Roboto, 'Helvetica Neue', Arial, sans-serif, 'Apple Color Emoji', 'Segoe UI Emoji', 'Segoe UI Symbol', 'Noto Color Emoji'; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: #ffffff; text-decoration-style: initial; text-decoration-color: initial;" class="">
<li style="padding: 0px; margin: 0px 0px 0px 1.5em; box-sizing: border-box; list-style-position: outside; list-style-type: square;" class="">
[:error, #<OpenStruct links=nil, context=nil, pullLocation=["File at <a href="https://gitub.u-bordeaux.fr/erias/fideo/-/raw/master/fideo_core.owl" class="">
https://gitub.u-bordeaux.fr/erias/fideo/-/raw/master/fideo_core.owl</a> does not exist"]>]</li></ul>
<div class="">Could you please let us know how to address this issue?</div>
<br class="">
<div class="">Regards,</div>
<div class="">Georgeta Bordea</div>
</div>
<br class="">
<div class="">[1] <a href="https://gitub.u-bordeaux.fr/erias/fideo/-/raw/master/fideo_core.owl" class="">https://gitub.u-bordeaux.fr/erias/fideo/-/raw/master/fideo_core.owl</a></div>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br class="">
bioontology-support mailing list<br class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br class="">
https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support<br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
<div class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
========================
<div class="">John Graybeal</div>
<div class="">Technical Program Manager</div>
<div class="">Center for Expanded Data Annotation and Retrieval /+/ NCBO BioPortal</div>
<div class="">Stanford Center for Biomedical Informatics Research<br class="">
650-736-1632  | ORCID  0000-0001-6875-5360</div>
<div class=""><br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>