<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Karin,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">The issue we found seems to be with line 665, which declares that the IRI '<a href="http://purl.org/dc/terms/" class="">http://purl.org/dc/terms/</a>' is an AnnotationProperty. I'm not sure why this is an error (likely because the IRI is also
 used as the object of all the importedFrom triples of dct:); but if we delete that line we find the ontology loads properly into BioPortal. (We have uploaded it as the latest version with this change.)  We checked the last version that loaded correctly, and
 it does not have this declaration.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><font face="Courier" class="">663  ###  <a href="http://purl.org/dc/terms/" class="">http://purl.org/dc/terms/</a><br class="">
664  <br class="">
665  dct: rdf:type owl:AnnotationProperty .</font></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">We suggest that you might want to remove that line from future submissions in order that they parse in BioPortal.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">We found the issue when running our OWL API wrapper code against this ontology. (That's just a command line wrapper for the OWL API library.)  I'm wondering if you might be running a different version of the OWL API library, to explain why you
 didn't see a parsing issue?  We are running 4.5.17.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Please let us know of concerns or questions. </div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">John<br class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Apr 26, 2021, at 1:39 AM, Karin Colsman <<a href="mailto:karin.colsman.contractor@osthus.com" class="">karin.colsman.contractor@osthus.com</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">Dear support team,<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">we are getting an RDF error while trying to upload a new version of the AFO ontology at<a href="https://bioportal.bioontology.org/ontologies/AFO" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">https://bioportal.bioontology.org/ontologies/AFO</a><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">The ttl file can be opened both with the OWL API and the JENA API (Java versions) without any errors. Can you see from your server logs what the
 problem might be?<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">I am also attaching a screenshot of the support form which is unusable, because the site footer is overlapping the form fields. My screen resolution
 is 1920x1080. I have tried Firefox, Chrome and Internet Explorer and the problem is present on all of them.<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">Thank you very much for your time,<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">Karin Colsman<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div class="">
<div style="border-style: solid none none; border-top-width: 1pt; border-top-color: rgb(225, 225, 225); padding: 3pt 0in 0in;" class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<b class=""><span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">From:</span></b><span lang="EN-US" style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class=""><span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">support@bioontology.org</a><span class="Apple-converted-space"> </span><<a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">support@bioontology.org</a>><span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Monday, 24 August, 2020 10:24<br class="">
<b class="">To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:support@bioontology.org" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">support@bioontology.org</a>; Karin Colsman <<a href="mailto:karin.colsman.contractor@osthus.com" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">karin.colsman.contractor@osthus.com</a>><br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>[BioPortal] Feedback from Karin Colsman<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<p style="margin-right: 0in; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
Name: Karin Colsman<span class="Apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></p>
<p style="margin-right: 0in; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
Email:<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:karin.colsman.contractor@osthus.com" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">karin.colsman.contractor@osthus.com</a><o:p class=""></o:p></p>
<p style="margin-right: 0in; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
Location: https%3A%2F%<a href="http://2fbioportal.bioontology.org/" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">2Fbioportal.bioontology.org</a>%2Fontologies%2FAFO<span class="Apple-converted-space"> </span><span style="color: rgb(31, 73, 125);" class=""><o:p class=""></o:p></span></p>
<p style="margin-right: 0in; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></p>
</div>
<span id="cid:1D47DFAE-9D7B-4E99-89CF-C2C0E6D9E05E"><merged-and-inferred.ttl></span><span id="cid:FF420F4B-0E7A-44ED-B292-CB8F29C097F6"><bioportal_support.png></span><span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">bioontology-support
 mailing list</span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<a href="mailto:bioontology-support@lists.stanford.edu" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">bioontology-support@lists.stanford.edu</a><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<a href="https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://mailman.stanford.edu/mailman/listinfo/bioontology-support</a><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
<div class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
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========================
<div class="">John Graybeal</div>
<div class="">Technical Program Manager</div>
<div class="">Center for Expanded Data Annotation and Retrieval /+/ NCBO BioPortal</div>
<div class="">Stanford Center for Biomedical Informatics Research<br class="">
650-736-1632  | ORCID  0000-0001-6875-5360</div>
<div class=""><br class="">
</div>
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</div>
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