<html><head><style type='text/css'>p { margin: 0; }</style></head><body><div style='font-family: times new roman,new york,times,serif; font-size: 12pt; color: #000000'><DIV style="FONT-STYLE: normal; FONT-FAMILY: Helvetica,Arial,sans-serif; COLOR: #000; FONT-SIZE: 12pt; FONT-WEIGHT: normal; TEXT-DECORATION: none">
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman,new york,times,serif; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 12pt">
<P>Hi,</P>
<P>I am trying to submit bash scripts as jobs to the barley machines. The command I am using is:  <FONT size=1><FONT size=3>qsub -cwd -o /dev/null -e /dev/null job1.script </FONT></FONT></P>
<P><FONT size=1><FONT size=3>However, none of my jobs run. They script runs for a few seconds before getting killed, and nothing is written to the output file in my script too (I had earlier put filenames for the -o and -e but both the stdout and stderr files were empty).</FONT></FONT></P>
<P><FONT size=1><FONT size=3>My shell script starts matlab and runs a matlab script (the command used is something like - unset DISPLAY; matlab > output_file << EOF; matlab_task(arg1, arg2); exit; EOF - so, its the usual script to run a matlab task and write the output to a file output_file). To debug this, I ran a test job by ssh'ing directly into a barley and running this same script, and it runs fine!!</FONT></FONT></P>
<P><FONT size=1><FONT size=3>So, I wonder why the job scheduler is not able to run the script? Are there some mandatory parameters I need to pass along with the qsub command that I am missing here? The qsub command is run from my home dir in /mnt/glusterfs, and output_file (in the matlab command above) is also in my home dir in /mnt/glusterfs, so I am following the guidelines about the location of input/output scripts here.</FONT></FONT></P>
<P><FONT size=1><FONT size=3>Any help from someone will be greatly appreciated!! My research is on hold right now because of this problem :(</FONT></FONT></P>
<P><FONT size=1><FONT size=3></FONT></FONT> </P>
<P><FONT size=1><FONT size=3>Thanks!</FONT></FONT></P>
<P><FONT size=1><FONT size=3>Abhik</FONT></P></FONT></DIV></DIV><BR></div></body></html>