<html>
<body>
<font face="Courier New, Courier"><x-tab>        </x-tab><br><br>
Michael,<br><br>
I'm not sure if you're on any of my bio-ontology lists, so I'vce sent you
a personal CFP.....<br><br>
Robert.<br><br>
I can't remember if yo're on any of my lists. So, read on. I'm away until
next thrusday, so will not answer much email.<br><br>
Robert<br>
_______________________________________________________________________<br><br>
                
This message is posted to several lists.<br>
              
We apologize if you receive multiple copies.<br>
          Please forward it
to everyone who might be interested.<br>
_______________________________________________________________________<br><br>
<br>
                       
Call for Papers and Posters<br><br>
                     
Semantic Webs for Life Sciences<br><br>
              
at the Pacific Symposium on Biocomputing 2006<br>
                         
<a href="http://psb.stanford.edu/" eudora="autourl">http://psb.stanford.edu/<br>
</a>                            
January 3-7, 2006<br>
                
Grand Wailea Resort, Wailea, Maui, Hawaii<br><br>
_______________________________________________________________________<br><br>
Biology is evolving from a science of organisms and molecules to 
one<br>
that increasingly relies on processing data. These data range from
raw<br>
sequences represented in a reasonably computational form, to the
vast<br>
body of annotation of these data that are less amenable to
computational<br>
processing. The shift from hypothesis-driven experiments to
data-driven<br>
experiments relies on having computational access to all these data
and<br>
the tools that manipulate those data.<br><br>
The Semantic Web is a vision that moves the Web from a form that is
only<br>
really usable by humans, to one where the data and services are open
to<br>
autonomous computational agents. This vision relies on the semantics
of<br>
both the content and services on the Web being accessible to
computers.<br>
Semantic markup through ontologies developed in OWl or RDF are meant
to<br>
provide this semantic markup -- OWL is, after all, the web Ontology<br>
Language. As the recent biomedical ontology sessions at PSB have<br>
revealed, there is much activity within bioinformatics in the field
of<br>
semantic markup of data. The discipline is well poised to build<br>
Semantic Webs for Life Sciences that will afford bioinformatics<br>
applications deeper computational access to the knowledge element 
of<br>
bioinformatics resources.<br><br>
This session on Semantic Webs for Life Sciences would therefore
welcome<br>
papers that discuss:<br><br>
    * The creation and use of Semantic Web
applications<br>
    * Reasoning about the biomedical domain based on
Semantic Web<br>
      technologies to make scientific
insights<br>
    * Intelligent agent technologies and associated
ontologies<br>
    * Use of Semantic Web technologies to bridge between
heterogeneous<br>
      information resources (e.g., to connect
genotype to gene<br>
      expression and ultimately to clinical
medicine, drug discoveries,<br>
      etc.)<br>
    * Use of Semantic Web technologies to make biomedical
applications<br>
      interoperable<br>
    * The use of OWL, RDF, etc. to describe and use
knowledge in the<br>
      biomedical arena<br>
    * Advances in Semantic Web related technologies as
applied to<br>
      bioinformatics and biomedical
problems<br>
    * Other research associated with Semantic Webs for
Life Sciences <br><br>
_______________________________________________________________________<br><br>
<br>
  Session co-chairs<br><br>
    * Robert Stevens (Contact Person)<br>
      University of Manchester, UK<br>
      robert.stevens@manchester.ac.uk<br><br>
    * Olivier Bodenreider<br>
      National Library of Medicine<br>
      olivier@nlm.nih.gov<br><br>
    * Yves A. Lussier<br>
      Columbia University, NY, USA<br>
      yves.lussier@dbmi.columbia.edu<br><br>
_______________________________________________________________________<br><br>
<br>
  Submission information<br><br>
<br>
      Papers and Posters<br><br>
The core of the conference consists of rigorously peer-reviewed<br>
full-length papers reporting on original work. Accepted papers will
be<br>
published in a hard-bound archival proceedings, and the best of
these<br>
will be presented orally to the entire conference. Researchers
wishing<br>
to present their research without official publication are encouraged
to<br>
submit a one page abstract by November 1, 2005 to present their work
in<br>
the poster sessions.<br><br>
<br>
      Important dates<br><br>
    * Paper submissions due: July 18, 2005<br>
    * Notification of paper acceptance: September 6,
2005<br>
    * Final paper deadline: September 23, 2005<br>
    * Abstract deadline: November 1, 2005<br>
    * Meeting: January 3-7, 2006 <br><br>
<br>
      Paper format<br><br>
All papers must be submitted to russ.altman@stanford.edu in
electronic<br>
format. The file formats we accept are: postscript (*.ps), Adobe
Acrobat<br>
(*.pdf) and Microsoft Word documents (*.doc). Attached files should
be<br>
named with the last name of the first author (e.g. altman.ps,
altman.pdf,<br>
or altman.doc).<br>
Hardcopy submissions or unprocessed TEX or LATEX files will be
rejected<br>
without review.<br><br>
Each paper must be accompanied by a cover letter. The *cover letter
must<br>
state* the following:<br><br>
    * The email address of the corresponding author<br>
    * The specific PSB session that should review the
paper or abstract<br>
    * The submitted paper contains original, unpublished
results, and<br>
      is not currently under consideration
elsewhere.<br>
    * All co-authors concur with the contents of the
paper.<br><br>
<br>
Submitted papers are limited to twelve (12) pages in our 
publication<br>
format. Please format your paper according to instructions found at<br>
<a href="http://psb.stanford.edu/psb-online/psb-submit/" eudora="autourl">http://psb.stanford.edu/psb-online/psb-submit/</a>.
If figures can not be<br>
easily resized and placed precisely in the text, then it should be
clear<br>
that with appropriate modifications, the total manuscript length
would<br>
be within the page limit.<br><br>
Color pictures can be printed at the expense of the authors. The fee
is<br>
$500 per page of color pictures, payable at the time of camera 
ready<br>
submission.<br><br>
Contact Russ Altman (russ.altman@stanford.edu) for additional
information<br>
about paper submission requirements.<br><br>
</font></body>
<br>
</html>